fbpx
วิกิพีเดีย

TATA box

TATA box หรือ Goldberg-Hogness boxเป็นโปรโมเตอร์ที่ทำหน้าที่กระตุ้นการทรานสคริบชันอยู่ห่างจากจุดเริ่มไปทาง 5’ 30 คู่เบส เป็นลำดับเบสที่ประกอบด้วยเบส A และเบส T มาก เกี่ยวข้องกับการนำเอนไซม์อาร์เอ็นเอ โพลีเมอเรสไปสู่จุดเริ่มต้นที่ถูกต้อง พบในอาร์เคียแบคทีเรียและยูคาริโอต ประมาณ 24% ของยีนในมนุษย์มี TATA box ภายในโปรโมเตอร์

TATA box มีลำดับดีเอ็นเอหลัก 5'-TATAAA-3' หรือเปลี่ยนแปลงไปบ้างโดยมากตามด้วยอะดีนีนสามตัว ปกติมี 25 คู่เบสทางด้านอับสตรีมของบริเวณที่เกิดทรานสคริบชัน เชื่อว่าเป็นบริเวณอนุรักษนิยมของกระบวนการวิวัฒนาการตั้งแต่เริ่มมียูคาริโอต ปกติจะถูกจับด้วยTATA binding protein (TBP) ระหว่างเกิดทรานสคริบชัน ทำให้ดีเอ็นเอคลายเกลียว ซึ่งบริเวณที่มี A T มากจะคลายเกลียวได้ง่ายกว่าบริเวณที่มี G C มาก TBP จะจับกับร่องเล็กของดีเอ็นเอและจับแบบเบตาชีท

TATA box มักจะเป็นตำแหน่งที่เข้าจับของ RNA polymerase II และ TFIID ซึ่งเป็นทรานสคริบชันแฟกเตอร์เข้ามาจับกับ TATA box จากนั้น TFIIA จะเข้ามาจับด้านอับสตรีมของ TFIID ส่วนTFIIB เข้าจับกับด้านดาวน์สตรีมของ TFIID RNA polymerase II จะจดจำกลุ่มของโปรตีนนี้ได้และเข้ามาจับ เช่นเดียวกับทรานสคริบชันแฟกเตอร์อื่นๆ เช่น TFIIF TFIIE และ TFIIH ทรานสคริบชันจะเริ่ม RNA polymerase II เคลื่อนไปตามสายดีเอ็นเอโดยออกจาก TFIID และ TFIIA ที่ยังจับกับ TATA box และทำให้ RNA polymerase II โมเลกุลใหม่เข้ามาจับได้

ยีนที่ไม่มี TATA box จะใช้ downstream core promoter (DCE) การศึกษาจีโนมในมยุษย์ พบว่ามีโปรโมเตอร์ที่ขึ้นกับ ของมนุษย์ขึ้นอยู่กับ TATA box ~ 10% การศึกษาก่อนหน้านี้ พบว่าประมาณ 1,000 ยีนพบโปรโมเตอร์มี TATA box อยู่ด้วย 32%

อ้างอิง

  1. Lifton RP, Goldberg ML, Karp RW, Hogness DS (1978). "The organization of the histone genes in Drosophila melanogaster: functional and evolutionary implications". Cold Spring Harb Symp Quant Biol. 42: 1047–1051. PMID 98262.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
  2. Smale, ST; Kadonaga, JT (2003). "The RNA polymerase II core promoter" (PDF). Annual review of biochemistry. 72: 449–79. doi:10.1146/annurev.biochem.72.121801.161520. PMID 12651739.
  3. Yang, C; Bolotin, E; Jiang, T; Sladek, FM; Martinez, E (2007). "Prevalence of the initiator over the TATA box in human and yeast genes and identification of DNA motifs enriched in human TATA-less core promoters". Gene. 389 (1): 52–65. doi:10.1016/j.gene.2006.09.029. PMC 1955227. PMID 17123746.
  4. Carninci P, Sandelin A, Lenhard B; และคณะ (2006). "Genome-wide analysis of mammalian promoter architecture and evolution". Nat. Genet. 38 (6): 626–35. doi:10.1038/ng1789. PMID 16645617. Unknown parameter |month= ignored (help); Explicit use of et al. in: |author= (help)CS1 maint: multiple names: authors list (link)
  5. Suzuki Y, Tsunoda T, Sese J; และคณะ (2001). "Identification and characterization of the potential promoter regions of 1031 kinds of human genes". Genome Res. 11 (5): 677–84. doi:10.1101/gr.164001. PMC 311086. PMID 11337467. Unknown parameter |month= ignored (help); Explicit use of et al. in: |author= (help)CS1 maint: multiple names: authors list (link)

tata, หร, goldberg, hogness, เป, นโปรโมเตอร, ทำหน, าท, กระต, นการทรานสคร, บช, นอย, างจากจ, ดเร, มไปทาง, เบส, เป, นลำด, บเบสท, ประกอบด, วยเบส, และเบส, มาก, เก, ยวข, องก, บการนำเอนไซม, อาร, เอ, นเอ, โพล, เมอเรสไปส, ดเร, มต, นท, กต, อง, พบในอาร, เค, ยแบคท, เร, ยแ. TATA box hrux Goldberg Hogness box 1 epnoprometxrthithahnathikratunkarthranskhribchnxyuhangcakcuderimipthang 5 30 khuebs epnladbebsthiprakxbdwyebs A aelaebs T mak ekiywkhxngkbkarnaexnismxarexnex ophliemxersipsucuderimtnthithuktxng phbinxarekhiyaebkhthieriyaelayukharioxt 2 praman 24 khxngyininmnusymi TATA box phayinoprometxr 3 TATA box miladbdiexnexhlk 5 TATAAA 3 hruxepliynaeplngipbangodymaktamdwyxadininsamtw pktimi 25 khuebsthangdanxbstrimkhxngbriewnthiekidthranskhribchn echuxwaepnbriewnxnurksniymkhxngkrabwnkarwiwthnakartngaeterimmiyukharioxt pkticathukcbdwyTATA binding protein TBP rahwangekidthranskhribchn thaihdiexnexkhlayekliyw sungbriewnthimi A T makcakhlayekliywidngaykwabriewnthimi G C mak TBP cacbkbrxngelkkhxngdiexnexaelacbaebbebtachithTATA box mkcaepntaaehnngthiekhacbkhxng RNA polymerase II aela TFIID sungepnthranskhribchnaefketxrekhamacbkb TATA box caknn TFIIA caekhamacbdanxbstrimkhxng TFIID swnTFIIB ekhacbkbdandawnstrimkhxng TFIID RNA polymerase II cacdcaklumkhxngoprtinniidaelaekhamacb echnediywkbthranskhribchnaefketxrxun echn TFIIF TFIIE aela TFIIH thranskhribchncaerim RNA polymerase II ekhluxniptamsaydiexnexodyxxkcak TFIID aela TFIIA thiyngcbkb TATA box aelathaih RNA polymerase II omelkulihmekhamacbidyinthiimmi TATA box caich downstream core promoter DCE karsuksacionminmyusy phbwamioprometxrthikhunkb khxngmnusykhunxyukb TATA box 10 4 karsuksakxnhnani phbwapraman 1 000 yinphboprometxrmi TATA box xyudwy 32 5 xangxing aekikh Lifton RP Goldberg ML Karp RW Hogness DS 1978 The organization of the histone genes in Drosophila melanogaster functional and evolutionary implications Cold Spring Harb Symp Quant Biol 42 1047 1051 PMID 98262 CS1 maint multiple names authors list link Smale ST Kadonaga JT 2003 The RNA polymerase II core promoter PDF Annual review of biochemistry 72 449 79 doi 10 1146 annurev biochem 72 121801 161520 PMID 12651739 Yang C Bolotin E Jiang T Sladek FM Martinez E 2007 Prevalence of the initiator over the TATA box in human and yeast genes and identification of DNA motifs enriched in human TATA less core promoters Gene 389 1 52 65 doi 10 1016 j gene 2006 09 029 PMC 1955227 PMID 17123746 Carninci P Sandelin A Lenhard B aelakhna 2006 Genome wide analysis of mammalian promoter architecture and evolution Nat Genet 38 6 626 35 doi 10 1038 ng1789 PMID 16645617 Unknown parameter month ignored help Explicit use of et al in author help CS1 maint multiple names authors list link Suzuki Y Tsunoda T Sese J aelakhna 2001 Identification and characterization of the potential promoter regions of 1031 kinds of human genes Genome Res 11 5 677 84 doi 10 1101 gr 164001 PMC 311086 PMID 11337467 Unknown parameter month ignored help Explicit use of et al in author help CS1 maint multiple names authors list link ekhathungcak https th wikipedia org w index php title TATA box amp oldid 5882823, wikipedia, วิกิ หนังสือ, หนังสือ, ห้องสมุด,

บทความ

, อ่าน, ดาวน์โหลด, ฟรี, ดาวน์โหลดฟรี, mp3, วิดีโอ, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, รูปภาพ, เพลง, เพลง, หนัง, หนังสือ, เกม, เกม