เอกซ์ปาซี
เอกซ์ปาซี (อังกฤษ: Expasy) เป็นทรัพยากรชีวสารสนเทศออนไลน์ที่ดำเนินการโดยสถาบันชีวสารสนเทศแห่งสวิสเซอร์แลนด์ (อังกฤษ: Swiss Institute of Bioinformatics, SIB) เป็นเว็บท่าซึ่งให้การเข้าถึงฐานข้อมูลและเครื่องมือซอฟต์แวร์ที่ผสานรวมและดำเนินการขยายเพิ่มกว่า 160 รายการ ซึ่งสนับสนุนงานในสาขาวิทยาศาสตร์ชีวภาพและการทดลองทางคลินิก ตั้งแต่จีโนมิกส์ โปรตีโอมิกส์ และชีววิทยาโครงสร้าง การวิวัฒนาการและวิวัฒนาการชาติพันธุ์ ชีววิทยาระบบ และเคมีทางการแพทย์ ทรัพยากรแต่ละรายการ (ฐานข้อมูล เครื่องมือซอฟต์แวร์บนเว็บ และซอฟต์แวร์ที่ดาวน์โหลดได้) ได้รับการติดตั้งเครื่องคอมพิวเตอร์แม่ข่ายในลักษณะกระจายศูนย์โดยกลุ่มต่าง ๆ ของสถาบัน SIB และสถาบันพันธมิตร
สัญลักษณ์ของเอกซ์ปาซี (พ.ศ. 2563) | |
| ประเภท | เว็บท่า |
|---|---|
| ภาษาที่ใช้ได้ | ภาษาอังกฤษ |
| ประเทศต้นทาง | สวิตเซอร์แลนด์ |
| เจ้าของ | สถาบันชีวสารสนเทศแห่งสวิสเซอร์แลนด์ |
| ผู้ก่อตั้ง | Ron Appel และ Amos Bairoch |
| บริการ | ฐานข้อมูลและซอฟต์แวร์ชีวสารสนเทศ |
| ยูอาร์แอล | www |
| เชิงพาณิชย์ | ไม่ |
| เปิดตัว | สิงหาคม พ.ศ. 2536 |
| สถานะปัจจุบัน | เวอร์ชัน 3.0 |
เครื่องมือค้นหา
เอกซ์ปาซีให้การสืบค้นข้อมูลในลักษณะ:
- ค้นหาฐานข้อมูล SIB แบบขนานผ่านการค้นหาครั้งเดียว
- ผลการค้นหารวบรวมจากชุดทรัพยากรทั้งหมดมากกว่า 160 รายการ ซึ่งเข้าถึงได้จากเว็บท่า
เอกซ์ปาซีให้ข้อมูลที่เป็นปัจจุบันจากรุ่นเผยแพร่ล่าสุดของทรัพยากรแต่ละรายการ
คำศัพท์ที่ใช้ในเอกซ์ปาซี อ้างอิงจากฐานข้อมูลภววิทยาของการวิเคราะห์ข้อมูลทางวิทยาศาสตร์ชีวภาพและการจัดการข้อมูล ของโครงการ EDAM
ประวัติ
เอกซ์ปาซีถูกสร้างขึ้นในปี พ.ศ. 2536 แต่เดิมมีชื่อว่า ExPASy (Expert Protein Analysis System) และทำหน้าที่เป็นเครื่องแม่ข่ายของงานด้านโปรตีโอมิกส์ ในการวิเคราะห์ลำดับและโครงสร้างของโปรตีน และเจลอิเล็กโตรโฟรีซิสแบบสองมิติ (2-D Page electrophoresis) นอกจากนั้นเอกซ์ปาซี ยังเป็นแม่ข่ายของฐานความรู้ลำดับโปรตีน UniProtKB/Swiss-Prot และส่วนเสริม UniProtKB/TrEMBL ที่ให้คำอธิบายประกอบออนไลน์ ซึ่งต่อมาทั้งสองส่วนได้ถูกรวมเป็นเว็บไซต์ UniProt
เอกซ์ปาซีถือเป็นเว็บไซต์แรกของสาขาวิทยาศาสตร์ชีวภาพซึ่งเริ่มเผยแพร่เมื่อเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2536 และเป็นหนึ่งใน 150 เว็บไซต์แรกของโลก โดยเอกซ์ปาซีได้ให้บริการสืบค้นแล้วกว่า 1 พันล้านครั้ง ณ วันที่ 5 เมษายน พ.ศ. 2550
ในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2554 ได้เปลี่ยนชื่อเป็น ExPASy: SIB Bioinformatics Resources Portal โดยทำหน้าที่เป็นบานแผนกรวบรวมรายชื่อทรัพยากรชีวสารสนเทศที่พัฒนาโดย SIB Groups รุ่นพัฒนาปัจจุบันเปิดตัวในเดือนตุลาคม พ.ศ. 2563
ดูเพิ่มเติม
อ้างอิง
- "SIB Resources". sib.swiss (ภาษาอังกฤษแบบบริติช). สืบค้นเมื่อ 27 ตุลาคม 2020.
- Ison J, Kalas M, Jonassen I, Bolser D, Uludag M, McWilliam H, และคณะ (พฤษภาคม 2013). "EDAM: an ontology of bioinformatics operations, types of data and identifiers, topics and formats". Bioinformatics. 29 (10): 1325–32. doi:10.1093/bioinformatics/btt113. PMC 3654706. PMID 23479348.
- Gasteiger E, Gattiker A, Hoogland C, Ivanyi I, Appel RD, Bairoch A (กรกฎาคม 2003). "ExPASy: The proteomics server for in-depth protein knowledge and analysis". Nucleic Acids Research. 31 (13): 3784–8. doi:10.1093/nar/gkg563. PMC 168970. PMID 12824418.
- "About Expasy – Some history". SIB Swiss Institute of Bioinformatics (ภาษาอังกฤษ).
- Artimo P, Jonnalagedda M, Arnold K, Baratin D, Csardi G, de Castro E, และคณะ (กรกฎาคม 2012). "ExPASy: SIB bioinformatics resource portal". Nucleic Acids Research. 40 (Web Server issue): W597-603. doi:10.1093/nar/gks400. PMC 3394269. PMID 22661580.
- Duvaud, Séverine; Gabella, Chiara; Lisacek, Frédérique; Stockinger, Heinz; Ioannidis, Vassilios; Durinx, Christine (13 เมษายน 2021). "Expasy, the Swiss Bioinformatics Resource Portal, as designed by its users". Nucleic Acids Research. 49 (W1): W216–W227. doi:10.1093/nar/gkab225. ISSN 0305-1048. PMC 8265094. PMID 33849055.
- "Discover the new Expasy.org, the Swiss Bioinformatics Resource Portal". sib.swiss (ภาษาอังกฤษแบบบริติช). สืบค้นเมื่อ 26 ตุลาคม 2020.
บรรณานุกรม
- Mohammad Yaseen Sofi; Afshana Shafi; Khalid Z. Masoodi (14 กันยายน 2021). "12 ExPASy Portal". Bioinformatics for Everyone (1st ed.). London, UK; San Diego, CA: Academic Press. pp. 119–126. ISBN 978-0-323-91128-3, 978-0-323-91129-0.
แหล่งข้อมูลอื่น
- เว็บไซต์ทางการ
- Swiss-Prot