fbpx
วิกิพีเดีย

สายพันธุ์ของ SARS-CoV-2

พฤศจิกายน 16, 2021

ไวรัสก่อโรคโควิด-19 คือไวรัสโคโรนาสายพันธุ์ใหม่ (SARS-CoV-2) นั้น มีรูปแปร (variants) ต่าง ๆ มากมาย บางชนิดเชื่อว่าหรือเคยเชื่อว่าสำคัญ เพราะมีโอกาสเพิ่มการติดต่อของโรค เพิ่มความรุนแรงของโรค หรือลดประสิทธิภาพของวัคซีน บทความนี้กล่าวถึงสายพันธุ์หรือรูปแปรที่โดดเด่นของไวรัสโควิด-19 และการกลายพันธุ์แบบมิสเซนส์ (missense mutation) ที่พบในสายพันธุ์เหล่านี้

การกลายพันธุ์ที่มีผลบวก ผลลบ และผลเป็นกลางต่อวิวัฒนาการของไวรัสโคโรนาต่าง ๆ เช่น ไวรัสโควิด-19 (SARS-CoV-2)
สายพันธุ์ไวรัสโควิด-19 ที่องค์กรสาธารณสุขในสหรัฐและอังกฤษได้รายงานอย่างเป็นทางการ เป็นไวรัสที่มีการกลายพันธุ์ชนิด L452R หรือ E484K

บทความนี้อ้างอิงคริสต์ศักราช/คริสต์ทศวรรษ/คริสต์ศตวรรษ ซึ่งเป็นสาระสำคัญของเนื้อหา

  • 12.2 เบตา (B.1.351)
  • 12.3 แกมมา (P.1)
  • 12.4 เดลตา (B.1.617.2)

    • ความย่อ

    แม้เชื้อไวรัสโควิด-19 (SARS-CoV-2) เริ่มแรกอาจเกิดจากการผสมกัน (recombination) ระหว่างไวรัสคล้ายโควิดของค้างคาวกับไวรัสโคโรนาประจำตัวนิ่ม (ผ่านการติดต่อโรคข้ามสปีชีส์) แต่การกลายพันธุ์ก็มีบทบาทสำคัญในวิวัฒนาการและการเกิดรูปแปรใหม่ ๆ ของไวรัส สำหรับสายพันธุ์แรกที่ได้ตัวอย่างแล้วระบุในประเทศจีน นักวิจัยจัดว่ามันต่างกับจีโนมบรรพบุรุษโดยห่างกันถึง 3 สายพันธุ์ ดังนั้น ไวรัสโควิด-19 จึงมีสายพันธุ์ต่าง ๆ มากมาย

    การหาลำดับดีเอ็นเอที่ทำกันได้ในปัจจุบันอาจทำให้ตรวจพบสายพันธุ์ใหม่ ๆ ได้เร็วเมื่อโรคระบาด เมื่อใช้กับโปรแกรมประยุกต์ที่แสดงต้นไม้สายพันธุ์โดยจำแนกตามวิวัฒนาการชาติพันธุ์ (phylogenetic tree visualization software) ลำดับจีโนมสามารถแบ่งเป็นกลุ่ม ๆ ที่มีการกลายพันธุ์แบบเดียวกัน แต่ละกลุ่มเป็น 'variant', 'clade' หรือ 'lineage' และการเปรียบเทียบลำดับยีนก็จะทำให้รู้ถึงวิวัฒนาการของไวรัสได้ สำหรับไวรัสโควิด-19 งานศึกษาทางวิทยาการระบาดทั่วโลกได้ถอดลำดับยีนไวรัสเกิน 330,000 ลำดับแล้ว

    SARS-CoV-2 กำลังวิวัฒนาการทำให้ติดต่อได้ง่ายขึ้น ที่เด่นก็คือสายพันธุ์อัลฟาและเดลตาซึ่งติดต่อได้ง่ายกว่าไวรัสดั้งเดิมที่พบในอู่ฮั่น

    ตารางต่อไปนี้แสดงข้อมูลและความเสี่ยงของสายพันธุ์ที่เสี่ยงเพิ่มหรืออาจเสี่ยงเพิ่มในปัจจุบัน ช่วงพิสัยมีความเชื่อมั่นร้อยละ 95 ยกเว้นจะระบุต่างหาก ให้สังเกตว่าเลขเหล่านี้เป็นค่าประมาณทั้งหมดเพราะข้อมูลการศึกษามีจำกัด

    ระดับความเสี่ยงโดยเปรียบเทียบ   สูงมาก   สูง   ปานกลาง   ต่ำ   ไม่ชัดเจน
    การระบุ การเกิด ความเปลี่ยนแปลงเทียบกับสายพันธุ์ที่มีมาก่อน ณ เวลาและสถานที่ที่เกิด
    องค์การอนามัยโลก แพงโก พีเอชอี เน็กซต์สเตรน ระบาดครั้งแรก ตัวอย่างแรกสุด เมื่อระบุว่าน่าเป็นห่วง การกลายพันธุ์ที่เด่น การติดต่อได้ การเข้า รพ. อัตราการตาย ความแม่นยำของการตรวจ ภูมิคุ้มกันไม่ให้ติดเชื้อได้อีก ประสิทธิศักย์ของวัคซีน ประสิทธิศักย์ของสารภูมิต้านทานแบบโมโนโคลน
    อัลฟา B.1.1.7 VOC‑20DEC‑01 20I (V1) สหราชอาณาจักร 20 ก.ย. 2020 18 ธ.ค. 2020 69-70del, N501Y, P681H +82% (43–130%) +52% (47–57%) +59% (44–74%) ไม่เปลี่ยน ลดลงน้อย ลดลงน้อย ไม่เปลี่ยน
    เบตา B.1.351 VOC‑20DEC‑02 20H (V2) แอฟริกาใต้ พ.ค. 2020 14 ม.ค. 2021 K417N, E484K, N501Y +52% (46–58%) กำลังตรวจสอบ อาจเพิ่ม ไม่เปลี่ยน ลดลงแต่การตอบสนองของเซลล์ทีต่อไวรัส D614G ยังคงประสิทธิภาพ ลดประสิทธิศักย์วัคซีนหลายอย่าง บางอย่างยังคงประสิทธิศักย์อยู่
    แกมมา P.1 VOC‑21JAN‑02 20J (V3) บราซิล พ.ย. 2020 15 ม.ค. 2021 K417T, E484K, N501Y +161% (145–176%) อาจเพิ่ม +50% (50 % CrI, 20–90%) ไม่เปลี่ยน ลดลง หลายชนิดยังคงประสิทธิศักย์ บางชนิดยังคงประสิทธิศักย์
    อัลฟา อัลฟาบวกกับ E484K VOC‑21FEB‑02 20I (V1) สหราชอาณาจักร 26 ม.ค. 2021 5 ก.พ. 2021 69-70del, E484K, N501Y, P681H +82% (43–130%) +52% (47–57%)

    		 +59% (44–74%) ไม่เปลี่ยน ลดลงอย่างสำคัญ ลดลงอย่างสำคัญ บางอย่างยังคงประสิทธิศักย์
    เอปซิลอน B.1.429, B.1.427 — 21C สหรัฐ มี.ค. 2020 17 มี.ค. 2021 L452R +20% (19%–24%) กำลังตรวจสอบ กำลังตรวจสอบ กำลังตรวจสอบ ลดลงปานกลาง ลดลงปานกลาง บางชนิดลดลงโดยยังไม่สามารถกำหนดผลที่แน่ชัด
    เดลตา B.1.617.2 VOC‑21APR‑02 21A อินเดีย ต.ค. 2020 6 พ.ค. 2021 L452R, T478K, P681R +64% (26–113%) เทียบกับอัลฟา +85% (39–147%) เทียบกับอัลฟา กำลังตรวจสอบ ไม่มีหลักฐานว่าเปลี่ยน ลดลง ลดลงน้อย บางชนิดคงประสิทธิศักย์
    แคปปา B.1.617.1 VUI‑21APR‑01 21B อินเดีย ต.ค. 2020 — L452R, E484Q, P681R กำลังตรวจสอบ กำลังตรวจสอบ กำลังตรวจสอบ กำลังตรวจสอบ ลดลงเล็กน้อย ลดลงเล็กน้อย อาจลดลง
    อีตา B.1.525 VUI‑21FEB‑03 21D ไนจีเรีย 11 ธ.ค. 2020 — E484K, F888L กำลังตรวจสอบ กำลังตรวจสอบ กำลังตรวจสอบ กำลังตรวจสอบ อาจลดลง อาจลดลง อาจลดลง

    ชื่อ

    ชื่อต่าง ๆ ของ SARS-CoV-2
    สายพันธุ์ตามแพงโก หมายเหตุตามแพงโก เคลดตามเน็กซต์สเตรน 2021 เคลดตามจีเซด สายพันธุ์เด่น ๆ
    A.1-A.6 19B S มี "reference sequence" เป็น WIV04/2019
    B.3-B.7, B.9, B.10, B.13-B.16 19A L
    O
    B.2 V
    B.1 B.1.5-B.1.72 20A G สายพันธุ์ B.1 ตามแพงโก รวมสายพันธุ์เดลตา (B.1.617)
    B.1.9, B.1.13, B.1.22, B.1.26, B.1.37 GH
    B.1.3-B.1.66 20C รวม สายพันธุ์เอปซิลอน (B.1.427/B.1.429/CAL.20C) และอีตา (B.1.525)
    20G เป็นสายพันธ์หลักในสหรัฐเมื่อ มค. 2021
    20H รวมสายพันธุ์เบตา (B.1.351 หรือ 20H/501Y.V2 หรือ 501.V2 )
    B.1.1 20B GR รวมสายพันธุ์ B.1.1.207[ต้องการอ้างอิง]
    20D
    20J รวมสายพันธุ์แกมมา (P.1) และซีตา (P.2)
    20F
    20I รวม สายพันธุ์อัลฟา (B.1.1.7 หรือ VOC-202012/01, VOC-20DEC-01 หรือ 20I/501Y.V1)
    B.1.177 20E (EU1) GV เป็นสายอนุพันธุ์ของ 20A

    ยังไม่มีการตั้งชื่อไวรัสโควิด-19 ที่เป็นมาตรฐาน รัฐบาลและสื่อข่าวมักระบุสายพันธุ์เป็นภาษาพูดโดยใช้ชื่อประเทศที่พบสายพันธุ์นั้น ๆ เป็นครั้งแรก ในปลายเดือนพฤษภาคมหลังจากที่ปรึกษากันเป็นเวลาหลายเดือน องค์การอนามัยโลกก็ประกาศการใช้อักษรกรีกเป็นชื่อสายพันธุ์สำคัญ ๆ เพื่อให้ความเป็นกลางทางภูมิภาคและทางการเมือง

    แม้ไวรัสโควิด-19 จะมีสายพันธุ์เป็นพัน ๆ แต่ชนิดย่อยต่าง ๆ ก็สามารถจัดเข้าเป็นกลุ่มเช่นเป็นเชื้อสาย (lineage) หรือเป็นเคลด (clade) มีการตั้งชื่อ 3 อย่างหลัก ๆ ที่ใช้อยู่โดยทั่วไป คือ

    • จนถึงเดือนมกราคม 2021 จีเซด (GISAID) ผู้เรียกเชื้อไวรัสดั้งเดิมคือ SARS-CoV-2 ว่า hCoV-19 ได้ระบุเคลด 8 เคลดแล้วทั่วโลก คือ S, O, L, V, G, GH, GR และ GV
    • ในปี 2017 นักวิชาการได้ประกาศระบบการตั้งชื่อเน็กซต์สเตรน (Nextstrain) เพื่อใช้ "ติดตามวิวัฒนาการของจุลชีพก่อโรคตามเวลาจริง" ซึ่งต่อมาได้ใช้ติตตามเชื้อ SARS-CoV-2 โดยจนถึงเดือนมกราคม 2021 ได้ระบุ 11 เคลดหลัก ๆ แล้ว คือ 19A, 19B และ 20A จนถึง 20I
    • ในปี 2020 นักวิชาการจากโครงการ Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages (PANGOLIN โครงการแพงโก) ซึ่งแปลได้ว่า การกำหนดเชื้อสายโรคระบาดทั่วโลกให้มีชื่อตามวิวัฒนาการชาติพันธุ์ ได้เสนอวิธี "การตั้งชื่อแบบพลวัตสำหรับเชื้อสายต่าง ๆ ของ SARS-CoV-2 ซึ่งให้ความสำคัญกับเชื้อสายไวรัสที่กำลังระบาดและกระจายไปยังภูมิภาคใหม่ ๆ" จนถึงเดือนกุมภาพันธ์ 2021 มีเชื้อสาย 6 สายที่ได้ระบุแล้วคือ A, B, B.1, B.1.1, B.1.177 และ B.1.1.7

    อนึ่ง องค์การสาธารณสุขของชาติต่าง ๆ ยังอาจใช้ระบบการตั้งชื่อของตน ๆ เพื่อติดตามสายพันธุ์ต่าง ๆ ยกตัวอย่างเช่น สำนักงานสาธารณสุขประเทศอังกฤษ (Public Health England) หรือพีเอชอี ได้ระบุไวรัสที่ติดตามโดยปี เดือน และหมายเลขในรูปแบบ [YYYY] [MM]/[NN] ซึ่งมีอักษรนำหน้าเป็น 'VUI' หรือ 'VOC' ซึ่งย่อมาจาก variant under investigation (รูปแบบที่กำลังตรวจสอบ) และ variant of concern (รูปแบบที่น่าเป็นห่วง) ระบบนี้ปัจจุบันปรับให้อยู่ในรูปแบบ [YY] [MMM]-[NN] โดยส่วนที่เป็นเดือนจะใช้อักษรย่อ 3 ตัว

    ลำดับยีนอ้างอิง

    ในปัจจุบันยังไม่รู้ว่าใครเป็นผู้ป่วยรายแรกสำหรับโรคโควิด-19 ดังนั้น ลำดับยีนที่ใช้อ้างอิงในงานศึกษาหนึ่ง ๆ ก็จะเลือกเอาตามชอบใจ โดยมีทางเลือกเด่น ๆ ดังต่อไปนี้

    • ลำดับจีโนม Wuhan-1 เป็นลำดับที่เก็บได้แรกสุดเมื่อวันที่ 24 ธันวาคม 2019
    • กลุ่มนักวิจัยอีกกลุ่มหนึ่ง ใช้ลำดับจีโนมอ้างอิงของ National Center for Biotechnology Information (NCBI) ซึ่งมีรหัส GenBankID:NC_045512; GISAID ID: EPI_ISL_402125 เป็นตัวอย่างที่เก็บได้เมื่อวันที่ 26 ธันวาคม 2019 ถึงแม้กลุ่มนี้ก็ยังใช้จีโนมอ้างอิงคือ WIV04 ของจีเซด (ID: EPI_ISL_402124) ในงานวิเคราะห์ต่าง ๆ ด้วย
    • ตามแหล่งอ้างอิงแห่งหนึ่ง WIV04/2019 ซึ่งอยู่ในเคลด S ตามจีเซด / เชื้อสาย A ตามแพงโก / เคลด 19B ตามเน็กซต์สเตรน เป็นลำดับยีนที่เชื่อว่าใกล้มากที่สุดกับลำดับยีนของไวรัสดั้งเดิมที่มนุษย์ติดและเรียกว่า ลำดับศูนย์ (sequence zero) โดยได้ตัวอย่างในวันที่ 30 ธันวาคม 2019 จากคนไข้ที่มีอาการ เป็นลำดับที่ใช้อ้างอิงกันมากที่สุด โดยเฉพาะในบรรดาองค์กรที่ทำงานร่วมกับจีเซด

    เกณฑ์ความเป็นสายพันธุ์โดดเด่น

    ไวรัสปกติมักจะกลายพันธุ์เมื่อเวลาผ่านไป เกิดเป็นรูปแปร (variant) หรือสายพันธุ์ใหม่ ๆ ซึ่งอาจระบาดไปในกลุ่มประชากร แล้วเพิ่มปัญหาต่าง ๆ ดังต่อไปนี้

    • ติดต่อได้ง่ายขึ้น
    • ก่ออาการหนักขึ้น
    • เพิ่มอัตราการตาย
    • ชุดตรวจเชื้อตรวจไม่ได้
    • เริ่มดื้อยาต้านไวรัส
    • ไวต่อแอนติบอดีที่ทำลายฤทธิ์ (neutralizing antibody) น้อยลงไม่ว่าจะเป็นแอนติบอดีที่พบในเลือด ที่ใช้ฉีด (คือแอนติบอดีแบบโมโนโคลน) หรือที่ตรวจหาในการทดลอง
    • สามารถหลบภูมิต้านทานที่มีอยู่โดยธรรมชาติได้ (คือ ทำให้ติดเชื้ออีกได้)
    • สามารถทำให้คนฉีดวัคซีนแล้วติดเชื้อได้
    • เพิ่มความเสี่ยงภาวะโรคต่าง ๆ เช่น การอักเสบในอวัยวะหลายบบ หรืออาการโควิดระยะยาว (long COVID)
    • เพิ่มการติดโรคในประชากรบางกลุ่ม เช่น เด็กหรือผู้มีภูมิคุ้มกันอ่อนแอ

    สายพันธุ์ที่ผ่านเกณฑ์มากกว่าหนึ่งเหล่านี้อาจระบุว่า สายพันธุ์ที่กำลังตรวจสอบ (variants under investigation) หรือสายพันธุ์ที่น่าสนใจ (variants of interest) โดยยังต้องตรวจสอบว่าเพิ่มปัญหาต่าง ๆ เหล่านี้หรือไม่ ลักษณะหลักของสายพันธุ์ที่น่าสนใจก็คือมีหลักฐานว่ามันเป็นเหตุให้เกิดโรคในอัตราสูงขึ้นหรือเป็นเหตุของคลัสเตอร์โรค แต่ก็ยังจำกัดไม่ถึงกับแพร่ไปในระดับชาติ ไม่งั้นแล้วก็จะต้องยกระดับขึ้นเป็นสายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วง (variant of concern) ถ้ามีหลักฐานชัดแล้วว่า การป้องกันหรือการรักษาการติดเชื้อจากสายพันธุ์นั้น ๆ มีประสิทธิภาพลดลงอย่างสำคัญ ก็จะจัดว่า สายพันธุ์ที่มีผลหนัก (variant of high consequence)

    สายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วง (องค์การอนามัยโลก)

    สายพันธุ์ในหัวข้อนี้จัดเป็นสายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วง (Variants of Concern, VOC) ตามองค์การอนามัยโลก ให้สังเกตว่า องค์กรต่าง ๆ เช่น ศูนย์ควบคุมและป้องกันโรคสหรัฐอาจมีรายการที่ต่างกันบ้าง

    อัลฟา (B.1.1.7)

    ดูบทความหลักที่: ไวรัส SARS-CoV-2 สายพันธุ์แอลฟา
     
    ภาพสีปลอมซึ่งถ่ายด้วยกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนชนิดส่องผ่าน (TEM) ของไวรัสโคโรนาสายพันธุ์ B.1.1.7 ดการเพิ่มการติดต่อของสายพันธุ์เชื่อว่า มาจากโครงสร้างโปรตีนหนาม (spike protein) ที่เปลี่ยนไป ซึ่งในภาพแสดงเป็นสีเขียว

    สายพันธุ์อัลฟา (B.1.1.7) ได้ตรวจพบครั้งแรกเมื่อเดือนตุลาคมในสหราชอาณาจักรจากตัวอย่างที่ได้เดือนก่อนในมณฑลเคนต์ จัดเป็นสายพันธุ์แรกที่ระบุว่ากำลังตรวจสอบเริ่มในเดือนธันวาคม 2020 (VUI - 202012/01) แล้วต่อมาเลื่อนเป็นสายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วง VOC-202012/01 มีชื่อเรียกอื่นว่า 20I/501Y.V1 (เดิมว่า 20B/501Y.V1) ตั้งแต่นั้น ค่าความชุกโรคแบบ prevalence odds ก็เพิ่มเป็นทวีคูณทุก ๆ 6.5 วัน ซึ่งเชื่อว่าเป็นระยะเวลาที่โรคติดต่อรุ่นต่อรุ่น (generational interval) มันมีสหสัมพันธ์กับอัตราการติดโรคโควิดใหม่ในสหราชอาณาจักอย่างสำคัญ โดยส่วนหนึ่งกับการกลายพันธุ์แบบ N501Y ด้วย

    มีหลักฐานบ้างว่า สายพันธุ์นี้ติดง่ายขึ้นร้อยละ 40-80 (ค่าประเมินต่าง ๆ โดยมากจะอยู่ทางด้านมาก) และงานวิเคราะห์แรก ๆ ก็ระบุว่า ทำให้ถึงตายเพิ่มขึ้น แต่งานเร็ว ๆ นี้กลับไม่พบหลักฐานว่าทำให้โรครุนแรงยิ่งขึ้น จนถึงเดือนพฤษภาคม 2021 สายพันธุ์อัลฟาได้ตรวจพบในประเทศกว่า 120 ประเทศแล้ว

    B.1.1.7 บวกกับการกลายพันธุ์ E484K

    สายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วงคือ Variant of Concern 21FEB-02 (เคยเขียนว่า VOC-202102/02) ที่กระทรวงสาธารณสุขอังกฤษอธิบายว่า เป็นสายพันธุ์ B.1.1.7 บวกกับการกลายพันธุ์ E484K จนถึงวันที่ 17 มีนาคม 2021 มีกรณีคนไข้ที่ยืนยันแล้ว 39 กรณีในสหราชอาณาจักร ในวันที่ 4 มีนาคม 2021 นักวิทยาศาสตร์ได้พบสายพันธุ์นี้ในรัฐออริกอนของสหรัฐ โดยพบในตัวอย่างหนึ่งใน 13 ตัวอย่างที่วิเคราะห์ แต่ดูเหมือนจะเกิดขึ้นเองในพื้นที่ คือไม่ได้นำเข้าจากประเทศอื่น

    ชื่ออื่น ๆ สำหรับสายพันธุ์นี้รวมทั้ง B.1.1.7+E484K และ B.1.1.7 Lineage with S:E484K

    เบตา (B.1.351)

    ในวันที่ 18 ธันวาคม 2020 สายพันธุ์เบตา หรือ 501.V2 หรือ 20H/501Y.V2 (ก่อนหน้านี้ 20C/501Y.V2) หรือ VOC-20DEC-02 (ก่อนหน้านี้ VOC-202012/02) หรือ B.1.351 ได้พบในแอฟริกาใต้เป็นครั้งแรก นักวิจัยและเจ้าหน้าที่รายงานว่า เทียบกับสายพันธุ์อื่น ๆ ความชุกสายพันธุ์นี้สูงกว่าในบรรดาคนอายุน้อยที่สุขภาพดี และทำให้มีอาการหนักกว่า กระทรวงสาธารณสุขแอฟริกาใต้ยังระบุด้วยว่า สายพันธุ์นี้อาจเป็นตัวขับการระบาดทั่วรอบสองในประเทศเพราะติดต่อกันได้เร็วกว่าสายพันธุ์ก่อน ๆ

    นักวิทยาศาสตร์ให้ข้อสังเกตว่า สายพันธุ์นี้จับกับเซลล์มนุษย์ได้ดีกว่าเพราะไกลโคโปรตีนหนาม (spike glycoprotein) ของไวรัสมีการกลายพันธุ์ 3 อย่างใน receptor-binding domain (RBD) รวมทั้ง N501Y, K417N และ E484K

    แกมมา (P.1)

    พีเอชอีระบุสายพันธุ์แกมม (P.1) ว่าน่าเป็นห่วงโดยตั้งชื่อว่า VOC 21JAN-02 (เดิม VOC-202101/02) ส่วนเน็กซต์สเตรน ตั้งชื่อมันว่า 20J/501Y.V3 หรือ 20J (V3) หรือ 501Y.V3 สถาบันโรคติดต่อแห่งชาติญี่ปุ่น (NIID) ตรวจพบมันเป็นครั้งแรกในนครโตเกียวในวันที่ 6 มกราคม 2021 จากผู้เดินทางมาจากรัฐอามาโซนัส (บราซิล) 4 คน ในวันที่ 12 มกราคม 2021 ศูนย์ Brazil-UK CADDE Centre ในบราซิลยืนยันว่า มีสายพันธุ์ P.1 ในพื้นที่ที่พบในป่าดิบชื้นแอมะซอน สายพันธุ์นี้ตั้งชื่อว่า P.1 แม้จะมีบรรพบุรุษเป็น B.1.1.28 แต่เพราะตั้งเป็น B.1.1.28.1 ไม่ได้ (ตามกฎระบบการตั้งชื่อ) จึงตั้งเป็นชื่อนี้ มันมีกรดอะมิโนที่เปลี่ยนไปโดยเฉพาะ ๆ 17 อย่างโดย 10 อย่างอยู่ในโปรตีนหนาม รวมทั้งการกลายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วงคือ N501Y, E484K และ K417T.:Figure 5

    เพราะการกลายพันธุ์ N501Y และ E484K มักก่อ RBD-hACE2 complex ที่เสถียร ดังนั้นจึงเพิ่มสัมพรรคภาพการจับของ RBD เข้ากับ hACE2 แต่ในนัยตรงข้าม การกลายพันธุ์ K417T มักไม่ก่อการจับกันระหว่าง RBD กับ hACE2 โดยได้พิสูจน์แล้วว่า ลดสัมพรรคภาพการจับของ RBD กับ hACE2

    สายพันธุ์นี้ไม่พบในเมืองมาเนาส์ (รัฐอามาโซนัส) ระหว่างเดือนมีนาคม-พฤศจิกายน 2020 แต่พบในตัวอย่างร้อยละ 42 ระหว่างวันที่ 15-23 ธค., ร้อยละ 52.2 ระหว่าง 15-31 ธค. และร้อยละ 85.4 ระหว่าง 1-9 มกราคม 2021 งานศึกษาหนึ่งพบว่า การติดเชื้อ P.1 อาจสร้างจำนวนไวรัสเกือบ 10 เท่าเทียบกับสายพันธุ์บราซิลอื่น ๆ คือ B.1.1.28 หรือ B.1.195 โดยติดต่อได้ง่ายกว่า 2.2 เท่า ติดได้ทั้งผู้ใหญ่และคนชรา ซึ่งแสดงว่า ทำให้มนุษย์ที่อายุน้อยกว่าติดได้มากกว่าไม่ว่าจะเป็นเพศไหน

    งานศึกษาตัวอย่างที่ได้จากเมืองมาเนาส์ระหว่างเดือน พย. 2020 - มค. 2021 แสดงว่า สายพันธุ์ P.1 ติดต่อได้ง่ายกว่าง 1.4-2.2 เท่า และพบว่าหลบหลีกภูมิคุ้มกันที่เกิดจากการติดโรคไวรัสโคโรนาก่อน ๆ ได้ร้อยละ 25-61 ทำให้มีโอกาสติดเชื้ออีกแม้หลังติดโรคโควิดมาก่อนแล้ว P.1 ยังทำให้ถึงตายเพิ่มขึ้นร้อยละ 10-80

    งานศึกษาหนึ่งพบว่า คนที่ได้วัคซีนของไฟเซอร์และของโมเดอร์นาอย่างสมบูรณ์แล้ว จะมีแอนติบอดีที่กำจัดฤทธิ์ของ P.1 ได้ลดลง แม้ผลต่อการดำเนินของโรคจะยังไม่ชัดเจน

    ข้อมูลเบื้องต้นจากงานศึกษาสองงานระบุว่า วัคซีนของแอสตราเซเนกายังมีประสิทธิผลต่อสายพันธุ์ P.1 แม้ระดับประสิทธิศักย์ที่แน่นอนจะยังไม่ได้ตีพิมพ์

    งานศึกษาในบราซิล (ของ Oswaldo Cruz Foundation) ที่ยังไม่ได้ทบทวนโดยผู้รู้เสมอกันในต้นเดือนเมษายน 2021 พบว่า ในสถานการณ์จริง ๆ วัคซีนของซิโนแวคโดสแรกมีประสิทธิศักย์ประมาณร้อยละ 50 โดยคาดว่า จะสูงขึ้นเมื่อได้โดสที่สอง งานศึกษานี้ยังดำเนินไปอยู่ ส่วนข้อมูลเบื้องต้นจากงานศึกษาที่สถาบันวิจัยบราซิลคือ Instituto Butantan เป็นผู้ดำเนินการแสดงนัยว่า วัคซีนของซิโนแวคมีประสิทธิผลต่อต้านสายพันธุ์นี้เช่นกัน โดยสถาบันจะขยายงานเพื่อให้ได้ข้อมูลที่แน่นอน

    เดลตา (B.1.617.2)

    ดูบทความหลักที่: ไวรัส SARS-CoV-2 สายพันธุ์เดลตา

    สายพันธุ์เดลตา หรือ B.1.617.2 หรือ G/452R.V3 หรือ 21A หรือ 21A/S:478K ได้พบครั้งแรกในอินเดียเมื่อเดือนตุลาคม 2020 แต่หลังจากนั้นก็ได้กระจายไปยังประเทศอื่น ๆ แล้ว เป็นสายพันธุ์ลูกหลานของ B.1.617 เช่นเดียวกับสายพันธุ์แคปปาที่กำลังตรวจสอบ ในวันที่ 6 พฤษภาคม 2021 นักวิทยาศาสตร์อังกฤษได้ประกาศสายพันธุ์นี้ (ซึ่งมีจุดเด่นคือ ไม่มีการกลายพันธุ์ E484Q) ว่าเป็นสายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วงโดยกำหนดรหัสเป็น VOC-21APR-02 หลังจากที่พบหลักฐานว่ามันกระจายไปได้เร็วกว่าไวรัสดั้งเดิมและอาจกระจายได้เร็วเท่าสายพันธุ์อัลฟา มันมีการกลายพันธุ์ L452R, T478K และ P681R แต่ก็ไม่เหมือนกับสายพันธุ์แคปปาเพราะไม่มีการกลายพันธุ์ E484Q

    ในวันที่ 3 มิถุนายน 2021 พีเอชอีรายงานว่า การเสียชีวิต 12 รายจาก 42 รายเนื่องกับสายพันธุ์เดลตาในอังกฤษเป็นคนได้รับวัคซีนอย่างสมบูรณ์แล้ว และเชื้อยังกระจายได้เร็วกว่าสายพันธุ์อัลฟาเป็นสองเท่าอีกด้วย ในวันที่ 11 มิย. ศูนย์การแพทย์ในแคนาดาแห่งหนึ่งได้รายงานว่า ในบรรดาคนไข้ 22 รายที่ติดเชื้อสายพันธุ์เดลตา ครึ่งหนึ่งเป็นผู้ได้วัคซีนอย่างสมบูรณ์แล้ว

    ในเดือนมิถุนายน 2021 มีรายงานว่ามีรูปแปรของสายพันธุ์เดลตาบวกกับการกลายพันธุ์ K417N โดยเรียกกันเป็นภาษาพูดว่า สายพันธุ์เนปาล การกลายพันธุ์นี้ซึ่งก็พบในสายพันธุ์เบตาด้วยอาจ ลดประสิทธิภาพของวัคซีนและการรักษาด้วยแอนติบอดี โดยยังอาจเพิ่มความเสี่ยงการติดโรคซ้ำอีกด้วย พีเอชอีเรียกสายพันธุ์นี้ว่า เดลตาบวกกับ K417N ส่วนแพงโกจัดสายพันธุ์ให้อยู่ในเคลด 2 เคลดคือ AY.1 และ AY.2 โดยยังมีชื่อเล่นว่า เดลตาพลัส ด้วย ซึ่งย่อมาจาก เดลตาพลัส K417N ในวันที่ 22 มิถุนายน อินเดียระบุสายพันธุ์เดลตาพลัสว่าเป็นสายพันธุ์น่าเป็นห่วงเพราะพบกรณี 22 กรณีในอินเดีย แต่ผู้เชี่ยวชาญทางวิทยาการระบาดก็กล่าวว่า ยังไม่มีข้อมูลเพียงพอที่จะสนับสนุนให้ใช้ชื่อต่างหากเพราะการศึกษาได้ทำกับคนไข้เพียงจำนวนน้อย

    สายพันธุ์ที่น่าสนใจ (องค์การอนามัยโลก)

    สายพันธุ์ในหัวข้อนี้จัดเป็นสายพันธุ์ที่น่าสนใจ (Variants of Interest, VOI) ตามองค์การอนามัยโลก ให้สังเกตว่า องค์กรต่าง ๆ เช่น ศูนย์ควบคุมและป้องกันโรคสหรัฐอาจมีรายการที่ต่างกันบ้าง ยกตัวอย่างเช่น สหรัฐยกสายพันธุ์เอปซิลอนว่าเป็นสายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วง ไม่ใช่แค่น่าสนใจ

    เอปซิลอน (B.1.429 / CAL.20C)

    สายพันธุ์เอปซิลอน หรือ B.1.429 หรือ CAL.20C หรือ CA VUI1 หรือ 21C หรือ 20C/S:452R มีการกลายพันธุ์พิเศษ 5 อย่าง คือ I4205V, D1183Y (ในยีน ORF1ab) และ S13I, W152C, L452R (ในโปรตีนเอสของโปรตีนหนาม) โดยการกลายพันธุ์แบบ L452R ซึ่งก็พบในสายพันธุ์อื่น ๆ ที่ไม่เกี่ยวกันด้วย เป็นตัวน่าเป็นห่วงเป็นพิเศษ B.1.429 อาจติดต่อง่ายกว่า แต่ก็ต้องศึกษายิ่งขึ้นเพื่อยืนยัน ศูนย์ควบคุมและป้องกันโรคสหรัฐกำหนดสายพันธุ์ B.1.429 และ B.1.427 ที่สัมพันธ์กันว่าเป็น "สายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วง" โดยอ้างอิงงานศึกษาที่ยังไม่ได้ทบทวนโดยผู้รู้เสมอกันว่า

    • เพิ่มการติดต่อโรคได้ถึงร้อยละ 20
    • มีผลต่อภูมิคุ้มกันชนิดกำจัดเชื้อในบางคน แต่ไม่ทุกคน
    • เริ่มดื้อยาที่ได้อนุมัติให้ใช้รักษาหรือป้องกันโควิด
    • ลดการกำจัดฤทธิ์ของเชื้อในพลาสมาตามที่เก็บจากคนหายป่วยหรือฉีดวัคซีน

    ในเดือนกรกฎาคม 2020 นักวิจัยในรัฐแคลิฟอร์เนีย (สหรัฐ) ได้ตรวจพบ B.1.429 เป็นครั้งแรกในตัวอย่างที่ได้จากมณฑลลอสแอนเจลิส แล้วก็ไม่พบอีกจนเดือนกันยายนจากตัวอย่างที่ได้จากรัฐแคลิฟอร์เนีย แต่จำนวนที่พบก็ต่ำมากจนถึงเดือนพฤศจิกายน ซึ่งเริ่มพบในตัวอย่างร้อยละ 36 จนถึงเดือนมกราคม 2021 ก็พบสายพันธุ์นี้ในตัวอย่างร้อยละ 50 แล้ว

    หลังจากเพิ่มขึ้นในเบื้องต้น อัตราการติดเชื้อสายพันธุ์นี้ก็ลดลงตั้งแต่เดือนกุมภาพันธ์ 2021 เพราะสู้สายพันธุ์อัลฟาไม่ได้ จนถึงเดือนเมษายน สายพันธุ์นี้ก็ยังเกิดขึ้นค่อข้างบ่อยในแคลิฟอร์เนียภาคเหนือบางส่วน แต่ก็สาบสูญไปเลยในแคลิฟอร์เนียใต้ โดยไม่ได้เกิดในภูมิภาคอื่น ๆ อย่างสม่ำเสมอ การติดเชื้อร้อยละ 3.2 ในสหรัฐมีเหตุจากสายพันธุ์นี้ เทียบกับ 2/3 ที่มีเหตุจากสายพันธุ์อัลฟา

    ซีตา (P.2)

    สายพันธุ์ซีตา (P.2) ซึ่งเป็นสายพันธุ์ลูกหลานของ B.1.1.28 เช่นเดียวกันกับสายพันธุ์แกมมา (P.1) ได้พบว่ากำลังระบาดอยู่ครั้งแรกในรัฐรีโอเดจาเนโร มีการกลายพันธุ์ E484K แต่ไม่มี N501Y และ K417T เป็นสายพันธุ์ที่วิวัฒนาการขึ้นต่างหากโดยไม่ได้เกี่ยวกับสายพันธุ์แกมมาจากเมืองมาเนาส์โดยตรง

    ในการจัดชื่อขององค์องค์การอนามัยโลก สายพันธุ์นี้เรียกว่า ซีตา จัดเป็นสายพันธุ์ที่น่าสนใจ (VOI) แต่ยังไม่น่าเป็นห่วง

    อีตา (B.1.525)

    สายพันธุ์อีตา (B.1.525) หรือ VUI-21FEB-03 (ก่อนหน้านี้ VUI-202102/03) หรือ UK1188 21D หรือ 20A/S:484K ไม่มีการกลายพันธุ์ N501Y เหมือนกับสายพันธุ์ อัลฟา หรือเบตา หรือแกมมา แต่มีการกลายพันธุ์ E484K เหมือนกับที่พบในสายพันธุ์เบตา แกมมา และซีตา มีการลบยีนออกแบบ ΔH69/ΔV70 (คือการลบกรดอะมิโน histidine และ valine ที่ตำแหน่ง 69 และ 70) ดังที่พบในสายพันธุ์อัลฟา, สายพันธุ์ที่มีการกลายพันธุ์ N439K (B.1.141 และ B.1.258) และสายพันธุ์ที่มีการกลายพันธุ์ Y453F (คือ คลัสเตอร์ 5) สายพันธุ์นี้ต่างกับสายพันธุ์อื่น ๆ ทั้งหมดก็เพราะมีทั้งการกลายพันธุ์ E484K และ F888L (คือการแทนที่ phenylalanine (F) ด้วย leucine (L) ใน S2 domain ของโปรตีนหนาม)

    จนถึงต้นเดือนมีนาคม พบสายพันธุ์นี้แล้วในประเทศ 23 ประเทศรวมทั้งสหราชอาณาจักร เดนมาร์ก ฟินแลนด์ นอร์เวย์ เนเธอร์แลนด์ เบลเยียม ฝรั่งเศส สเปน ไนจีเรีย กานา จอร์แดน ญี่ปุ่น สิงค์โปร์ ออสเตรเลีย แคนาดา เยอรมนี อิตาลี สโลวีเนีย ออสเตรีย มาเลเซีย สวิตเซอร์แลนด์ ไอร์แลนด์ และสหรัฐ และยังพบในแคว้นจังหวัดโพ้นทะเลของฝรั่งเศสคือ มายอต อีกด้วย

    กรณีแรก ๆ พบในเดือนธันวาคม 2020 ในสหราชอาณาจักรและไนจีเรีย และจนถึงวันที่ 15 กุมภาพันธ์ก็เป็นสายพันธุ์ที่พบมากสุดในไนจีเรีย จนถึงวันที่ 24 กุมภาพันธ์ ได้พบกรณีคนติดสายพันธุ์นี้ 56 คนในสหราชอาณาจักร เดนมาร์กเป็นประเทศที่ถอดลำดับยีนของกรณีโควิดทั้งหมด และได้พบสายพันธุ์นี้ 113 กรณีระหว่างวันที่ 14 มค. - 21 กพ. โดยมี 7 กรณีที่เกี่ยวกับการเดินทางไปยังประเทศไนจีเรีย

    ผู้เชี่ยวชาญในสหราชอาณาจักรกำลังศึกษาเพื่อให้ชัดเจนว่ามันเสี่ยงแค่ไหน จนถึงวันที่ 16 กุมภาพันธ์ สายพันธุ์ยังจัดว่า กำลังตรวจสอบ (VUI) แต่อาจปรับเป็นสายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วง (VOC) เมื่อได้ข้อมูลเพิ่ม นักจุลชีววิทยาที่มหาวิทยาลัยเคมบริดจ์ระบุว่า สายพันธุ์นี้ดูเหมือนจะมีการกลายพันธุ์สำคัญ ๆ เหมือนกับที่เห็นในสายพันธุ์ใหม่ ๆ บางชนิด ซึ่งอาจทำให้พยากรณ์ผลกระทบของการกลายพันธุ์ได้ง่ายกว่า

    ทีตา (P.3)

    ในวันที่ 18 กุมภาพันธ์ 2021 กระทรวงสาธารณสุขฟิลิปปินส์ได้ตรวจพบการกลายพันธุ์ 2 ชนิดในเขตกิตนางคาบีซายาอัน ซึ่งต่อมาตั้งชื่อเป็น E484K และ N501Y และตรวจพบในตัวอย่าง 37 ตัวอย่างจาก 50 ตัวอย่าง โดยมีการกลายพันธุ์ทั้งสองในตัวอย่าง 29 ตัวอย่าง สายพันธุ์ต่าง ๆ เหล่านี้ยังไม่ได้ถอดลำดับยีนทั้งหมด

    ในวันที่ 13 มีนาคม กระทรวงสาธารณสุขฟิลิปปินส์ได้ยืนยันการกลายพันธุ์ต่าง ๆ ที่มีอยู่ในสายพันธุ์ซึ่งตั้งชื่อว่า P.3 โดยองค์การอนามัยโลกต่อมาให้ชื่อมันว่า ทีตา ในวันเดียวกัน ก็ยืนยันว่าพบสายพันธุ์แกมมา (P.1) เป็นตัวอย่างแรกในประเทศ แม้สายพันธุ์ P.1 และ P.3 จะสืบทอดมาจากบรรพบุรุษเดียวกัน คือ B.1.1.28 แต่กระทรวงก็กล่าวว่า ผลของ P.3 ต่อประสิทธิศักย์ของวัคซีนและการติดต่อของโรคยังไม่ชัดเจน จนถึงวันที่ 13 มีนาคม ฟิลิปปินส์มีกรณีคนติดเชื้อนี้แล้ว 98 ราย

    ในวันที่ 12 มีนาคม ญี่ปุ่นก็พบว่ามีคนติดเชื้อนี้แล้วเหมือนกัน ในวันที่ 17 มีนาคม สหราชอาณาจักรก็ได้ยืนยันว่าเกิดคนติดเชื้อ 2 คนแรกแล้ว ซึ่งพีเอชอีกำหนดสายพันธุ์เป็น VUI-21MAR-02

    ในวันที่ 30 เมษายน 2021 มาเลเซียตรวจพบการติดเชื้อนี้ 8 รายในรัฐซาราวัก

    ไอโอตา (B.1.526)

    ในเดือนพฤศจิกายน 2020 นครนิวยอร์กพบสายพันธุ์กลายพันธุ์ใหม่ซึ่งเรียกว่า B.1.526 จนถึงวันที่ 11 เมษายน 2021 เชื้อได้พบแล้วในมลรัฐ 48 รัฐในสหรัฐและในประเทศอื่น ๆ อีกถึง 18 ประเทศ แต่ก็เหมือนกับสายพันธุ์เอปซิลอนที่พบในแคลิฟอร์เนีย คือสายพันธุ์นี้ถึงแม้จะเพิ่มขึ้นจนถึงระดับหนึ่งในมลรัฐบางรัฐ แต่ในฤดูใบไม้ผลิของปี 2021 สายพันธุ์ อัลฟา ก็ได้เกิดมากกว่าแล้ว องค์การอนามัยโลกเรียกสายพันธุ์นี้ว่า ไอโอตา

    แคปปา (B.1.617.1)

    สายพันธุ์แคปปา เป็นสายพันธุ์ลูกหลานของ B.1.617 สายพันธุ์หนึ่งในบรรดา 3 สายพันธุ์ ยังมีชื่ออื่นอีกว่า B.1.617.1, 21B และ 21A/S:154K ได้พบเป็นครั้งแรกในอินเดียเมื่อเดือนธันวาคม 2020 ณ ปลายเดือนมีนาคม 2021 สายพันธุ์นี้ก็มีจำนวนเกินครึ่งจากลำดับยีนที่อินเดียได้ส่งบันทึกแล้ว ณ ต้นเดือนเมษายน พีเอชอีก็ระบุเชื้อว่าเป็นสายพันธุ์ที่กำลังตรวจสอบ (VUI-21APR-01)

    แลมบ์ดา (C.37)

    สายพันธุ์แลมบ์ดา หรือ C.37 ได้พบครั้งแรกในเดือนสิงหาคม 2020 ในประเทศเปรู องค์การอนามัยโลกได้กำหนดเป็นสายพันธุ์ที่น่าสนใจเมื่อวันที่ 14 มิถุนายน 2021

    สายพันธุ์เด่นอื่น ๆ

    B.1.1.207

    สายพันธุ์ B.1.1.207 ได้ถอดลำดับยีนเป็นครั้งแรกในเดือนสิงหาคม 2020 ในประเทศไนจีเรีย การติดต่อได้และความรุนแรงของเชื้อยังไม่ชัดเจน แต่เป็นสายพันธุ์ที่จัดว่ากำลังเกิดใหม่ (emerging) โดยศูนย์ควบคุมและป้องกันโรคสหรัฐ สายพันธุ์นี้มีการกลายพันธุ์ P681H เหมือนกับสายพันธุ์อัลฟา แต่ก็ไม่มีการกลายพันธุ์อื่น ๆ ที่เหมือนกับอัลฟา และจนถึงปลายเดือนธันวาคม 2020 การถอดลำดับยีนทั้งหมดในไนจีเรียก็พบสายพันธุ์นี้ในอัตราร้อยละ 1 ณ เดือนพฤษภาคม 2021 สายพันธุ์นี้ได้พบในประเทศ 10 ประเทศแล้ว

    B.1.1.317

    แม้สายพันธุ์ B.1.1.317 จะยังไม่จัดว่าน่าเป็นห่วง (variant of concern) แต่กระทรวงสาธารณสุของรัฐควีนส์แลนด์ (ออสเตรเลีย) ก็บังคับให้คนไข้สองคนในฮอสพิเทลเมืองบริสเบนให้อยู่กักตัวเพิ่มขึ้น 5 วันโดยบวกกับอีก 14 วันตามปกติ

    B.1.1.318

    เมื่อวันที่ 24 กุมภาพันธ์ 2021 พีเอชอีกำหนดสายพันธุ์ B.1.1.318 ให้เป็นสายพันธุ์ที่กำลังตรวจสอบคือ VUI-21FEB-04 (ก่อนหน้านี้เป็น VUI-202102/04) จนถึงวันที่ 4 มีนาคม 2021 พบคนไข้ที่ติดเชื้อนี้ 16 คนแล้วในสหราชอาณาจักร

    B.1.618

    สายพันธุ์นี้พบเป็นครั้งแรกเมื่อเดือนตุลาคม 2020 มีการกลายพันธุ์ E484K ซึ่งเหมือนกับสายพันธุ์หลายอย่างอื่น ๆ กำลังขยายพันธุ์อย่างรวดเร็วในรัฐเบงกอลตะวันตก (อินเดีย) จนถึงวันที่ 23 เมษายน 2021 ฐานข้อมูล CoV-Lineages แสดงการถอดลำดับยีนตัวอย่างสายพันธุ์นี้ 135 ครั้งในอินเดีย โดยประเทศอื่น ๆ อีก 8 ประเทศทั่วโลกถอดลำดับยีนตัวอย่างไม่ถึง 10 ครั้ง

    B.1.620

    ในเดือนมีนาคม 2021 ประเทศลิทัวเนียได้ตรวจพบสายพันธุ์ B.1.620 เป็นครั้งแรก[ต้องการอ้างอิง] เป็นสายพันธุ์ที่พบทั้งในแอฟริกากลางและอเมริกาเหนือ นอกเหนือจากลิทัวเนีย ประเทศยุโรปอื่น ๆ รวมทั้งสเปนและเบลเยียมก็พบสายพันธุ์นี้ด้วย[ต้องการอ้างอิง] สายพันธุ์นี้มีการกลายพันธุ์และการลบยีนรวม 23 ตำแหน่งเทียบกับสายพันธุ์ดั้งเดิม โดยบางอย่างไม่มีในสายพันธุ์อื่น ๆ การกลายพันธุ์ที่มีรวม E484K, D614G (ซึ่งก็พบในสายพันธุ์ที่กำลังกระจายไปอื่น ๆ ด้วย)ม P681H และ S477N

    การติดต่อโรคข้ามสปีชีส์

    คลัสเตอร์ 5

    ในต้นเดือนพฤศจิกายน 2020 เดนมาร์กได้พบสายพันธุ์เชื้อที่เรียกว่า คลัสเตอร์ 5 หรือเรียกว่า ΔFVI-spike โดยสถาบันเซรุ่มแห่งชาติเดนมาร์ก (Statens Serum Institut, เอสเอสไอ) สายพันธุ์ได้พบในเขตนอร์เทอร์นจัตแลนด์ของประเทศ โดยเชื่อว่ามนุษย์ติดมาจากตัวมิงค์ในฟาร์มตัวมิงค์ ในวันที่ 4 เดือนเดียวกัน รัฐจึงประกาศว่าจะฆ่าตัวมิงค์ในฟาร์มเพื่อป้องกันกันไม่ให้เชื้อกระจายแล้วเสี่ยงเกิดสายพันธุ์ใหม่ ๆ เพิ่มขึ้นอีก และประกาศการล็อกดาวน์เขตเทศบาล 7 เขตในนอร์เทอร์นจัตแลนด์ เพื่อไม่ให้การระบาดทั่วในประเทศหรือของโลกแย่ลง จนถึงวันที่ 5 เดือนเดียวกัน ได้พบกรณีผู้ติดโรคเนื่องกับตัวมิงค์ 214 กรณี

    องค์การอนามัยโลกระบุว่า คลัสเตอร์ 5 ลดการตอบสนองต่อแอนติบอดีที่ทำลายฤทธิ์อย่างพอควร ส่วนเอสเอสไอเตือนว่า การกลายพันธุ์นี้อาจลดฤทธิ์ของวัคซีนที่กำลังพัฒนา แม้จะไม่ทำให้ไร้ผลโดยสิ้นเชิง หลังจากที่ล็อกดาวน์แล้วตรวจคนเป็นจำนวนมาก เอสเอสไอประกาศในวันที่ 19 พฤศจิกายนว่า คลัสเตอร์ 5 น่าจะสูญพันธุ์ไปแล้ว ต่อมาวันที่ 1 กุมภาพันธ์ 2021 นักวิชาการที่เอสเอสไอจึงได้ตีพิมพ์ในวารสารที่ทบทวนโดยผู้รู้เสมอกันโดยระบุว่า ปัจจุบันไม่พบว่าคลัสเตอร์ 5 ยังกระจายตัวอยู่ในหมู่มนุษย์

    มีความเสี่ยงว่า เชื้อโควิด-19 สามารถติดต่อจากมนุษย์ไปยังสัตว์แล้วรวมเข้ากับไวรัสประจำตัวสัตว์โดยกลายเป็นสายพันธุ์ใหม่ ๆ ซึ่งเป็นอันตรายต่อมนุษย์

    การกลายพันธุ์แบบมิสเซนส์ (missense) เด่น ๆ

    N440K

    การกลายพันธุ์ชนิด N440K หมายถึงการเปลี่ยนกรดอะมิโนแอสพาราจีน (N) ด้วยไลซีน (K) ที่ตำแหน่ง 440 ในที่เพาะเซลล์ การกลายพันธุ์ชนิดนี้ทำให้เชื้อโควิด-19 ติดต่อได้มากกว่าเป็น 10 เท่าเทียบกับสายพันธุ์ A2a (ที่มีการกลายพันธุ์แบบ A97V ใน RdRP) ที่เคยกระจายไปอย่างกว้าง และเป็น 1,000 เท่าเทียบกับสายพันธุ์ A3i (มีการกลายพันธุ์แบบ D614G ในโปรตีนหนาม และการแทนที่แบบ P323L ใน RdRP) ที่กระจายไปน้อยกว่า เป็นการกลายพันธุ์ที่มีส่วนกับการระบาดเพิ่มขึ้นอย่างรวดเร็วในอินเดีย โดยเป็นประเทศที่มีคนติดเชื้อกลายพันธุ์ชนิด N440K ในอัตราสูงสุดตามด้วยสหรัฐและเยอรมนี

    L452R

    การกลายพันธุ์ L452R หมายถึงการแทนที่กรดอะมิโนลิวซีน (L) ด้วยอาร์จินีน (R) ที่ยีนตำแหน่ง 452

    การระบาดของโควิดได้เพิ่มขึ้นทั่วอินเดียอย่างสำคัญเริ่มในปี 2021 โดยส่วนหนึ่งก็เพราะสายพันธุ์ B.1.617 (สายพันธุ์บรรพบุรุษของเดลตา) ซึ่งบางครั้งเรียกผิด ๆ ว่าเป็นสายพันธุ์ที่มีการกลายพันธุ์ 2 อย่าง L452R เป็นการกลายพันธุ์สำคัญในสายพันธุ์นี้ เพราะทำให้ให้ไวรัสจับตัวกับหน่วยรับ ACE2 receptor ของเซลล์มนุษย์ได้ดีขึ้นและอาจทำให้แอนติบอดีที่เป็นผลของวัคซีนจับกับโปรตีนหนามที่เปลี่ยนไปนี้ได้น้อยลง

    งานศึกษาบางงานพบว่า L452R อาจทำให้ไวรัสโคโรนาดื้อต่อแม้กระทั่งเซลล์ที (T cell) ได้ ซึ่งเป็นเซลล์จำเป็นในการสืบหาแล้วทำลายเซลล์ที่ติดเชื้อไวรัส โดยนี่เป็นคนละอย่างกับแอนติบอดีที่ทำลายฤทธิ์ของอนุภาคไวรัสโคโรนาและป้องกันไม่ให้มันขยายพันธุ์ต่อไปได้

    S477G/N

    งานศึกษาที่ใช้วิธีการทางชีวสารสนเทศศาสตร์และทางสถิติศาสตร์หลายงานพบว่า ไวรัสโควิด-19 มียีน receptor binding domain (RBD) ที่พลิกเปลี่ยนได้ง่ายระหว่างเรซิดิว 475-485 โดยมหาวิทยาลัยในออสเตรีย (University of Graz) และบริษัทเทคโนโลยีชีวภาพออสเตรีย (Innophore) พบว่า โดยโครงสร้าง ตำแหน่ง S477 สามารถพลิกเปลี่ยนได้ง่ายที่สุด

    จนถึงปัจจุบัน ตำแหน่ง S477 ที่ RBD จริง ๆ ก็เป็นตำแหน่งที่เรซิดิวกรดอะมิโนเปลี่ยนไปมากที่สุดในเชื้อโควิด-19 ที่กลายพันธุ์ งานศึกษาที่จำลองลักษณะทางพลวัตของ RBD เมื่อเข้าเชื่อมกับ hACE2 พบว่า การเปลี่ยนกรดอะมิโนทั้งชนิด S477G และ S477N ล้วนทำให้โปรตีนหนามของไวรัสจับกับหน่วยรับ hACE2 ได้แน่นขึ้น ในเดือนกุมภาพันธ์ 2021 บริษัทพัฒนาวัคซีนเยอรมันคือไบออนเทค ระบุการเปลี่ยนแปลงทางกรดอะมิโนเช่นนี้ว่าสำคัญสำหรับการพัฒนาวัคซีนรุ่นต่อไปในอนาคต

    E484K

    การกลายพันธุ์ E484K หมายถึงการแทนกรดกลูตาเมต (E) ด้วยไลซีน (K) ที่ยีนตำแหน่ง 484 โดยมีชื่อเล่นว่า อี๊ก (Eeek)

    E484K ได้รายงานว่าเป็นการกลายพันธุ์ที่หลบหลีกระบบภูมิคุ้มกันได้ คือพบว่าหลบแอนติบอดีแบบโมโนโคลน (monoclonal antibody ที่สร้างขึ้นนอกกาย) อย่างน้อยชนิดหนึ่งได้ ซึ่งอาจแสดงว่า มีความเปลี่ยนแปลงทาง antigenicity คือมีปฏิกิริยากับระบบภูมิคุ้มกันแบบจำเพาะที่เปลี่ยนไป สายพันธุ์เบตา สายพันธุ์แกมมา (P.1) และสายพันธุ์ซีตา (P.2) มีการกลายพันธุ์เช่นนี้ โดยยังพบสายพันธุ์อัลฟาบวกกับการกลายพันธุ์ E484K อีกด้วย แอนติบอดีทั้งแบบโมโนโคลนและที่ได้จากเลือดพบว่า มีประสิทธิภาพกำจัดไวรัสที่มีการกลายพันธุ์ E484K ได้ลดลง 10-60 เท่า

    ในวันที่ 2 กุมภาพันธ์ 2021 นักวิทยาศาสตร์ทางการแพทย์ของสหราชอาณาจักรพบการกลายพันธุ์ E484K ในตัวอย่าง 11 ตัวอย่างจาก 214,000 ตัวอย่าง ซึ่งอาจลดประสิทธิภาพของวัคซีนที่ใช้อยู่ในปัจจุบัน

    E484Q

    การกลายพันธุ์ E484Q หมายถึงการแทนกรดกลูตาเมต (E) ด้วยกลูตามีน (Q) ที่ยีนตำแหน่ง 484 E484Q อาจทำให้ไวรัสจับกับหน่วยรับ ACE2 ของเซลล์มนุษย์ได้ดีขึ้น และอาจทำให้แอนติบอดีที่วัคซีนช่วยกระตุ้นจับกับโปรตีนหนามที่เปลี่ยนไปนี้ได้น้อยลง

    โรคโควิด-19 ได้เพิ่มระบาดมากขึ้นในอินเดียเริ่มในปี 2021 โดยส่วนหนึ่งก็เพราะสายพันธุ์ B.1.617 (สายพันธุ์บรรพบุรุษของเดลตา) สายพันธุ์นี้มักเรียกผิด ๆ ว่า มีการกลายพันธุ์ 2 ชนิด (double mutant)

    N501Y

    การกลายพันธุ์ N501Y หมายถึงการเปลี่ยนกรดอะมิโน asparagine (N) เป็นไทโรซีน (Y) ที่ตำแหน่ง 501 โดยมีชื่อเล่นว่า "เน็ลลี่"

    พีเอชอีเชื่อว่า การกลายพันธุ์นี้ทำให้ไวรัสจับกับหน่วยรับของเซลล์มนุษย์ได้ดีขึ้น เพราะตำแหน่งการกลายพันธุ์อยู่ที่ receptor-binding domain (RBD) ของโปรตีนหนามที่จับกับ ACE2 ของเซลล์มนุษย์ โดยก็พบข้อมูลที่สนับสนุนสมมติฐานนี้ด้วย แบบจำลองการปฏิสัมพันธ์ในระดับโมเลกุลและการคำนวณค่า free energy of binding แสดงว่า การกลายพันธุ์นี้ทำให้ RBD มีสัมพัคภาพการจับกับหน่วยรับของเซลล์ คือ hACE2 สูงสุดในบรรดาสายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วง

    สายพันธุ์ที่มีการกลายพันธุ์นี้รวมทั้งแกมมาอัลฟา (VOC 20DEC-01), เบตา และ COH.20G/501Y (โคลัมบัส (รัฐโอไฮโอ)) สายพันธุ์สุดท้ายนี้ได้กลายเป็นเชื้อชนิดหลักในเมืองโคลัมบัสเมื่อปลายเดือนธันวาคม 2020 และเดือนมกราคม โดยดูเหมือนจะวิวัฒนาการขึ้นต่างหากกับสายพันธุ์อื่น ๆ

    D614G

     
    ความชุกเชิงลอการิทึมของการกลายพันธุ์ D614G ในปี 2020 ตามข้อมูลลำดับยีนที่บันทึกไว้ในฐานข้อมูลจีเซด

    D614G เป็นการกลายพันธุ์แบบมิสเซนส์ (missense mutation) ที่โปรตีนหนามของไวรัสโควิด-19 ตั้งแต่เริ่มพบในจีนภาคตะวันออก ความชุกของการกลายพันธุ์นี้ก็ได้เพิ่มขึ้นทั่วโลกในช่วงการระบาดทั่ว กรดอะมิโนไกลซีน (G) ได้แทนที่กรดแอสปาร์ติก (D) ที่ตำแหน่ง 614 ในประเทศต่าง ๆ มากมายโดยเฉพาะในยุโรป แต่ก็เกิดช้ากว่าในจีนและเอเชียตะวันออกที่เหลือ ซึ่งสนับสนุนสมมติฐานว่า G เพิ่มอัตราการติดต่อ และเข้ากับการมีไวรัส (viral titer) ที่เข้มข้นกว่าและการติดต่อที่สูงกว่าในหลอดทดลอง (in vitro) นักวิจัยที่โครงการแพงโกตั้งชื่อเล่นให้แก่การกลายพันธุ์นี้ว่า ดั๊ก (Doug)

    ในเดือนกรกฎาคม 2020 มีรายงานว่า สายพันธุ์โรคที่มีการกลายพันธุ์ D614G และติดต่อได้ง่ายกว่า ได้กลายมาเป็นสายพันธุ์หลักแล้ว พีเอชอียืนยันว่า การกลายพันธุ์นี้มี "ผลปานกลางต่อการติดต่อของโรค" โดยกำลังติดตามดูอยู่ทั่วโลก

    ความชุกของ D614G มีสหสัมพันธ์กับภาวะเสียการรู้กลิ่น (anosmia) ที่เป็นอาการของโควิด ซึ่งอาจเกิดจาก RBD ที่จับกับหน่วยรับ ACE2 ได้ดีขึ้น หรือเกิดจากการสร้างโปรตีนที่เสถียรกว่า ทำให้เยื่อบุผิวรับกลิ่น (olfactory epithelium) ในช่องจมูกติดเชื้อมากกว่า

    สายพันธุ์ที่มีการกลายพันธุ์ D614G รวมเคลด G (ของจีเซด) และเคลด B.1 (ของแพงโก) รวมทั้งอัลฟา เบตา และเดลตา

    P681H

     
    ความชุกเชิงลอการิทึมของการกลายพันธุ์แบบ P681H ในปี 2020 ตามข้อมูลลำดับยีนที่ได้บันทึกในฐานข้อมูลจีเซด

    ในเดือนมกราคม 2021 มีการตีพิมพ์รายงานที่ยังไม่ได้ทบทวนโดยผู้รู้เสมอกันว่า ลักษณะพิเศษของสายพันธุ์อัลฟา และ (B.1.1.207) (พบครั้งแรกในไนจีเรีย) คือการกลายพันธุ์ P681H กำลังเพิ่มสัดส่วนอย่างเป็นเลขชี้กำลังทั่วโลก เช่นเดียวกับที่เกิดกับกลายพันธุ์ D614G ที่แพร่หลายไปทั่วโลกแล้ว

    P681R

    การกลายพันธุ์ P681R หมายถึงการเปลี่ยนกรดอะมิโน proline (P) ด้วยอาร์จินีน (R) ที่ยีนตำแหน่ง 681

    พบว่า สายพันธุ์ B.1.617 (ที่เป็นบรรพบุรุษของเดลตา) มีการกลายพันธุ์ P681R ที่สำคัญนอกเหนือไปจาก E484Q และ L452R การกลายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วงทั้งสามอย่างนี้อยู่ที่โปรตีนหนาม ซึ่งเป็นส่วนสำคัญที่ไวรัสโคโรนาใช้จับกับหน่วยรับของเซลล์มนุษย์

    A701V

    ตามรายงานเบื้องต้นของสื่อ กระทรวงสาธารณสุขมาเลเซียได้ประกาศในวันที่ 23 ธันวาคม 2020 ว่าได้พบการกลายพันธุ์ในจีโนมของไวรัสโควิด-19 ซึ่งระบุว่า A701B (ตามที่พิมพ์ ซึ่งไม่ถูก) ในบรรดาตัวอย่าง 60 ตัวอย่างที่ได้มาจากคลัสเตอร์ในรัฐซาบะฮ์ โดยระบุว่าคล้ายกับที่เพิ่งพบในช่วงนั้นในแอฟริกาใต้ ออสเตรเลีย และเนเธอร์แลนด์ แม้จะยังไม่ชัดเจนว่าติดต่อได้มากขึ้นหรือมีผลต่อการดำเนินของโรคหรือไม่ แต่รัฐบาลจังหวัดซูลูของฟิลิปปินส์ซึ่งอยู่ใกล้ ๆ กันก็ได้ระงับการเดินทางไปยังซาบะฮ์เพราะความไม่ชัดเจนของสายพันธุ์นี้

    ในวันที่ 25 ธันวาคม องค์กรสาธารณสุขของรัฐ (Kementerian Kesihatan Malaysia/covid-19 Malaysia) จัดว่า การกลายพันธุ์นี้กำลังกระจายไปทั่วโดยพบในผู้ติดเชื้อถึงร้อยละ 85 เทียบกับการกลายพันธุ์ D614G ที่พบเต็มร้อยในมาเลเซีย โดยตัวอย่างเหล่านี้ก็ได้จากคลัสเตอร์ในรัฐซาบะฮ์เช่นกัน

    สำหรับการกลายพันธุ์นี้ มีการแทนกรดอะมิโนอะลานีนด้วยวาลีนที่ยีนโปรตีนหนามตำแหน่ง 701 มีรายงานว่าพบทั่วโลกรวมทั้งแอฟริกาใต้ ออสเตรเลีย เนเธอร์แลนด์ และอังกฤษในช่วงเวลาเดียวกันกับมาเลเซีย ในฐานข้อมูลจีเซด ความชุกของการกลายพันธุ์นี้อยู่ที่ร้อยละ 0.18

    ในวันที่ 24 เมษายน 2021 องค์กรสาธารณสุขของมาเลเซีย (Kementerian Kesihatan Malaysia) รายงานว่า การระบาดระลอกที่ 3 ซึ่งเริ่มที่รัฐซาบะฮ์ได้ก่อสายพันธุ์ต่าง ๆ ที่มีการกลายพันธุ์ D614G และ A701V

    การตรวจและประเมินสายพันธุ์ใหม่ ๆ

    ในวันที่ 26 มกราคม 2021 รัฐบาลสหราชอาณาจักรระบุว่า จะแชร์สมรรถภาพการถอดลำดับจีโนมกับประเทศอื่น ๆ เพื่อเพิ่มอัตราการถอดลำดับแล้วติดตามสายพันธุ์ใหม่ ๆ โดยเรียกแพลตฟอร์มนี้ว่า New Variant Assessment Platform จนถึงเดือนมกราคม 2021 การถอดลำดับยีนของเชื้อโควิด-19 เกือบครึ่งทั่วโลกได้ทำในสหราชอาณาจักร

    แหล่งกำเนิดสายพันธุ์ต่าง ๆ

    นักวิจัยได้เสนอว่า การกลายพันธุ์หลายอย่างอาจเกิดได้เมื่อคนไข้ที่มีภูมิคุ้มกันอ่อนแอติดเชื้ออย่างเรื้อรัง โดยเฉพาะเมื่อเป็นการกลายพันธุ์ที่หลบภูมิคุ้มกันได้และอยู่ใต้แรงกดดันทางวิวัฒนาการเนื่องกับการรักษาด้วยแอนติบอดีหรือด้วยเลือดจากคนไข้ที่หายโรคแล้ว และมีการกลายพันธุ์แบบลบยีนแอนติเจน (deletion) อย่างเดียวกันซึ่งเกิดต่างหาก ๆ ในคนไข้ต่าง ๆ

    ผลต่อประสิทธิภาพวัคซีน

    ข้อมูลเพิ่มเติม: วัคซีนโรคติดเชื้อไวรัสโคโรนา 2019 § ประสิทธิศักย์
    วิดีโอภาษาอังกฤษขององค์การอนามัยโลก ซึ่งอธิบายว่าสายพันธุ์ของโรคเกิดขึ้นได้อย่างไรในเขตที่ประชาชนไม่ได้ฉีดวัคซีน

    ปฏิสัมพันธ์ระหว่างไวรัสโควิด-19 กับมนุษย์ตอนแรกเป็นไปตามธรรมชาติ แต่ปัจจุบันได้เปลี่ยนไปเพราะการฉีดวัคซีน โอกาสการเกิดสายพันธุ์โควิดที่ดื้อต่อแอนติบอดีที่วัคซีนรุ่นปัจจุบันกระตุ้นให้เกิด อาจทำให้ต้องปรับปรุงวัคซีน การทดลองต่าง ๆ ได้ระบุว่า วัคซีนที่พัฒนาเพื่อต่อต้านสายพันธุ์ดั้งเดิมมีประสิทธิศักย์ต่อต้านการติดเชื้อแบบแสดงอาการที่ลดลงสำหรับสายพันธุ์บางสายพันธุ์

    อัลฟา (B.1.1.7)

    ข้อมูลเพิ่มเติม: ไวรัส SARS-CoV-2 สายพันธุ์แอลฟา และ สายพันธุ์ของ SARS-CoV-2 § อัลฟา

    ในเดือนธันวาคม สายพันธุ์ใหม่ของไวรัสโควิด-19 คือสายพันธุ์อัลฟา (B.1.1.7) ได้พบเป็นครั้งแรกในสหราชอาณาจักร

    องค์การอนามัยโลกระบุว่ามีหลักฐานจำกัดที่แสดงว่าวัคซีนของออกซฟอร์ด-แอสตร้าเซนเนก้า ของไฟเซอร์-ไบออนเทค และโนวาแวกซ์ยังคงประสิทธิผล/ประสิทธิภาพต่อต้านสายพันธุ์อัลฟาอยู่ ส่วนวัคซีนอื่น ๆ ยังไม่มีข้อมูล ในเรื่องการคงระดับแอนติบอดีลบล้างฤทธิ์ซึ่งป้องกันการติดเชื้อแบบไม่แสดงอาการและสำคัญในการยุติเหตุการณ์ระบาดทั่ว วัคซีนที่ใช้มากที่สุดรวมทั้งสปุตนิกวี วัคซีนของไฟเซอร์-ไบออนเทค ของโมเดอร์นา ของซิโนแวค ของซิโนฟาร์ม และโคแว็กซิน ก็ปรากฏว่าคงระดับแอนติบอดีสำหรับสายอัลฟาด้วย สำหรับวัคซีนของออกซฟอร์ด-แอสตร้าเซนเนก้า ระดับแอนติบอดีลดลงเล็กน้อยจนถึงปานกลาง ส่วนวัคซีนอื่น ๆ ยังไม่มีข้อมูล

    ผลเบื้องต้นแสดงว่า วัคซีนของไฟเซอร์-ไบออนเทคและโมเดอร์นาสามารถป้องกันสายพันธุ์นี้

    งานศึกษาหนึ่งระบุว่า วัคซีนของออกซฟอร์ด-แอสตร้าเซนเนก้ามีประสิทธิศักย์ระหว่างร้อยละ 42-89 ต่อต้านสายพันธุ์นี้ เทียบกับร้อยละ 71-91 สำหรับสายพันธุ์อื่น

    ผลเบื้องต้นจากการทดลองทางคลินิกระบุว่า วัคซีนโนวาแวกซ์มีประสิทธิภาพประมาณร้อยละ 96 สำหรับการติดเชื้อที่แสดงอาการสำหรับสายพันธุ์ดั้งเดิม และประมาณร้อยละ 86 สำหรับสายพันธุ์อัลฟา

    เบตา (B.1.351)

    ข้อมูลเพิ่มเติม: สายพันธุ์ของ SARS-CoV-2 § เบตา

    องค์การอนามัยโลกระบุว่า มีหลักฐานจำกัดจากงานศึกษาเบื้องต้นหลายงานที่แสดงว่าวัคซีนต่าง ๆ มีประสิทธิศักย์/ประสิทธิภาพต่อต้านสายพันธุ์เบตาลดลงในระดับต่าง ๆ รวมทั้งวัคซีนของออกซฟอร์ด-แอสตร้าเซนเนก้า (อาจจะมาก) โนวาแวกซ์ (ปานกลาง) วัคซีนของบริษัทไฟเซอร์-ไบออนเทคและจอห์นสันแอนด์จอห์นสัน (น้อย) โดยยังไม่มีข้อมูลสำหรับวัคซีนอื่น ๆ ในเรื่องการคงระดับแอนติบอดีลบล้างฤทธิ์ซึ่งป้องกันการติดเชื้อแบบไม่แสดงอาการและสำคัญในการยุติเหตุการณ์ระบาดทั่ว วัคซีนที่ใช้มากที่สุดรวมทั้งวัคซีนของออกซฟอร์ด-แอสตร้าเซนเนก้า สปุตนิกวี จอห์นสันแอนด์จอห์นสัน ไฟเซอร์-ไบออนเทค โมเดอร์นา และโนวาแวกซ์ล้วนมีแอนติบอดีลดลงในระดับน้อยจนถึงมาก ยกเว้นซิโนแวคและซิโนฟาร์มที่มีแอนติบอดีลดลงน้อย โดยวัคซีนอื่น ๆ ยังไม่มีข้อมูล

    โมเดอร์นาได้เริ่มทำการทดลองวัคซีนรุ่นใหม่เพื่อจัดการสายพันธุ์เบตา (B.1.351) แล้ว ในวันที่ 17 กุมภาพันธ์ 2021 บริษัทไฟเซอร์ประกาศว่า สำหรับสายพันธุ์นี้ อานุภาพทำลายฤทธิ์ไวรัสของแอนติบอดีที่เนื่องกับวัคซีนลดลงถึง 2/3 โดยระบุด้วยว่ายังไม่สามารถกำหนดประสิทธิศักย์ของวัคซีนในการป้องกันการติดเชื้อแบบแสดงอาการ งานศึกษาหลายงานต่อมาได้ตรวจน้ำเหลืองของคนไข้ที่ได้ฉีดวัคซีนของโมเดอร์นาและของไฟเซอร์-ไบออนเทคแล้วยืนยันว่า อานุภาพทำลายฤทธิ์ไวรัสของแอนติบอดีที่เนื่องกับวัคซีนลดลงจริง ๆ แต่ในวันที่ 1 เมษายน 2021 รายงานจากการทดลองวัคซีนของไฟเซอร์-ไบออนเทคในแอฟริกาใต้กลับรายงานว่า วัคซีนมีประสิทธิภาพเต็มร้อยจนถึงตอนนั้น (คือ อาสาสมัครที่ฉีดวัคซีนไม่มีใครติดโรคเลย) เทียบกับกลุ่มยาหลอกที่อาสาสมัคร 6 คนติดเชื้อชนิดเบตา

    ในเดือนมกราคม 2021 บริษัทจอห์นสันแอนด์จอห์นสันซึ่งกำลังทดสอบวัคซีนโควิด-19 ในแอฟริกาใต้ รายงานว่าประสิทธิศักย์การป้องกันการติดเชื้อแบบมีอาการปานกลางจนถึงหนักอยู่ที่ร้อยละ 72 ในสหรัฐและร้อยละ 57 ในแอฟริกาใต้

    ในวันที่ 6 กุมภาพันธ์ หนังสือพิมพ์อังกฤษ Financial Times ได้รายงานข้อมูลเบื้องต้นจากงานศึกษาในแอฟริกาใต้ร่วมกับมหาวิทยาลัยออกซฟอร์ดที่แสดงว่า วัคซีนของออกซฟอร์ด-แอสตร้าเซนเนก้ามีประสิทธิศักย์ลดลงสำหรับสายพันธุ์นี้ โดยพบว่า ในบรรดาผู้ได้รับวัคซีน 2,000 คน วัคซีนสามารถป้องกันโรคได้เพียงเล็กน้อยยกเว้นแต่คนที่มีอาการหนักสุด ต่อมาในวันที่ 7 กุมภาพันธ์ 2021 กระทรวงสาธารณสุขแอฟริกาใต้จึงระงับแผนการฉีดวัคซีนนี้ 1 ล้านโดสให้แก่ประชาชน

    ในเดือนมีนาคม 2021 มีรายงานว่า "ประสิทธิศักย์เบื้องต้นที่พบ" ของโนวาแว็กซ์ (NVX-CoV2373) สำหรับการติดเชื้อชนิดเบตาที่มีอาการอ่อน ปานกลาง และรุนแรง สำหรับอาสาสมัครที่ตรวจไม่พบเอชไอวีอยู่ที่ร้อยละ 51

    แกมมา (P.1)

    ข้อมูลเพิ่มเติม: สายพันธุ์ของ SARS-CoV-2 § แกมมา

    องค์การอนามัยโลกระบุว่ามีหลักฐานจำกัดที่แสดงว่าวัคซีนของซิโนแวคและของซิโนฟาร์ม ยังคงประสิทธิผล/ประสิทธิภาพต่อต้านสายพันธุ์แกมมาอยู่ ส่วนวัคซีนอื่น ๆ ยังไม่มีข้อมูล ในเรื่องการคงระดับแอนติบอดีลบล้างฤทธิ์ซึ่งป้องกันการติดเชื้อแบบไม่แสดงอาการและสำคัญในการยุติเหตุการณ์ระบาดทั่ว วัคซีนของออกซฟอร์ด-แอสตร้าเซนเนก้าและของซิโนแวคไม่ลดหรือแทบไม่ลดประสิทธิภาพต่อต้านสายพันธุ์แกมมาเลย วัคซีนของไฟเซอร์-ไบออนเทคและของโมเดอร์นาลดลงบางเล็กน้อยจนถึงปานกลาง ส่วนวัคซีนอื่น ๆ ยังไม่มีข้อมูล ดังนั้น สายพันธุ์แกมมา (P.1, 20J/501Y.V3) ซึ่งเริ่มต้นพบที่บราซิล ดูเหมือนจะหลบภูมิคุ้มกันเนื่องกับวัคซีนของไฟเซอร์-ไบออนเทคได้บ้าง

    เดลตา (B.1.617.2)

    ข้อมูลเพิ่มเติม: ไวรัส SARS-CoV-2 สายพันธุ์เดลตา และ สายพันธุ์ของ SARS-CoV-2 § เดลตา

    สายพันธุ์เดลตา หรือ B.1.617.2 หรือ G/452R.V3 หรือ 21A หรือ 21A/S:478K ได้พบครั้งแรกในอินเดียเมื่อเดือนตุลาคม 2020 แต่หลังจากนั้นก็ได้กระจายไปยังประเทศอื่น ๆ แล้ว เป็นสายพันธุ์ลูกหลานของ B.1.617 เช่นเดียวกับสายพันธุ์แคปปาที่กำลังตรวจสอบ ในวันที่ 6 พฤษภาคม 2021 นักวิทยาศาสตร์อังกฤษได้ประกาศสายพันธุ์นี้ (ซึ่งมีจุดเด่นคือ ไม่มีการกลายพันธุ์ E484Q) ว่าเป็นสายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วงโดยกำหนดรหัสเป็น VOC-21APR-02 หลังจากที่พบหลักฐานว่ามันกระจายไปได้เร็วกว่าไวรัสดั้งเดิมและอาจกระจายได้เร็วเท่าสายพันธุ์อัลฟา มันมีการกลายพันธุ์ L452R, T478K และ P681R แต่ก็ไม่เหมือนกับสายพันธุ์แคปปาเพราะไม่มีการกลายพันธุ์ E484Q

    องค์การอนามัยโลกระบุว่า มีหลักฐานจำกัดจากงานศึกษาเบื้องต้นต่าง ๆ ที่แสดงว่าวัคซีนของออกซฟอร์ด-แอสตร้าเซนเนก้าและของไฟเซอร์-ไบออนเทคยังคงประสิทธิผล/ประสิทธิภาพต่อสายพันธุ์นี้ ส่วนวัคซีนอื่น ๆ ยังไม่มีข้อมูล

    ในเรื่องการคงระดับแอนติบอดีลบล้างฤทธิ์ซึ่งป้องกันการติดเชื้อแบบไม่แสดงอาการและสำคัญในการยุติเหตุการณ์ระบาดทั่ว วัคซีนของออกซฟอร์ด-แอสตร้าเซนเนก้ามีประสิทธิภาพลดลงอย่างมาก และวัคซีนของไฟเซอร์-ไบออนเทคและโคแว็กซินมีประสิทธิภาพลดลงน้อยจนถึงปานกลาง ส่วนวัคซีนอื่น ๆ ยังไม่มีข้อมูล

    เชิงอรรถ

    1. ↑ Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages (PANGO) lineage
    2. Public Health England (PHE) variant - รูปแบบการตั้งชื่อได้อัปเดตเมื่อเดือนมีนาคม 2021 โดยเปลี่ยนปีจากเลข 4 หลักเหลือ 2 หลัก และเปลี่ยนเดือนจากเลข 2 หลักเป็นอักษรย่อ 3 ตัว ตัวอย่างเช่น ดั้งเดิมเป็น VOC-202101-02 ให้เปลี่ยนเป็น VOC-21JAN-02
    3. ↑ Nextstrain clade
    4. ↑ ถ้าไม่ได้ระบุไว้โดยเฉพาะ นี่ปกติหมายถึงภูมิในน้ำเหลืองคือ neutralizing antibody ซึ่งมีสหสัมพันธ์กับภูมิคุ้มกันโรค งานศึกษาโดยมากยังไม่ได้ระบุผลจริง ๆ ของภูมิที่ลดลงต่อค่าประสิทธิศักย์ของวัคซีน
    5. Monoclonal antibody efficacy
    6. ↑ 1 มีค. - 24 ธค. 2020 ประเทศอังกฤษ
    7. ↑ 23 พย. 2020 - 31 มค. 2021 ประเทศอังกฤษ
    8. 1 สค. - 31 ธค. 2020 สหราชอาณาจักร ส่วนงานศึกษาอีกงานหนึ่งพบค่าที่ +50% (20–113%) ในแอฟริกาใต้ระหว่างเดือน พค. - พย. 2020
    9. ยกเว้นวัคซีนของโมเดอร์นาและจอห์นสัน
    10. ↑ ช่วงความเชื่อมั่นที่รายงานมีความน่าจะเป็นต่ำ ดังนั้น ค่าประมาณจึงจัดว่าแค่เป็นไปได้ แต่ก็ยังไม่แน่นอนหรือว่า น่าจะใช่
    11. 1 พย. 2020 - 31 มค. 2021, มาเนาส์ งานศึกษาอีกงานหนึ่งในมาเนาสประเมินว่าสายพันธุ์ P.1 อาจติดต่อได้ง่ายกว่า 100% (50 % CrI, 70–140%)
    12. ↑ ความแตกต่างอาจมาจากนโยบายและการรักษาที่แตกต่างกันในแต่ละพื้นที่ในเวลาที่ต่าง ๆ กัน มาจากสมรรถภาพของระบบสาธารณสุข และสายพันธุ์ต่าง ๆ ที่กำลังกระจายอยู่ในพื้นที่
    13. มีค. 2020 - กพ. 2021 มาเนาส์ ผลเบื้องต้นจากงานศึกษาหนึ่งในเขตทิศใต้ของบราซิลพบว่า สายพันธุ์ P.1 ทำให้คนอายุน้อยและมีสุขภาพดีถึงตายยิ่งกว่า ในกลุ่มที่ไร้โรคประจำตัว สายพันธุ์นี้พบว่าทำให้ชายอายุ 20-39 ปีถึงตายยิ่งกว่า ≈490% (220–985%), หญิงอายุ 20-39 ปีถึงตายยิ่งกว่า ≈465% (190–1003%) และหญิงอายุ 40-59 ปีถึงตายยิ่งกว่า ≈670% (401–1083%)
    14. ยกเว้นวัคซีนของไฟเซอร์-ไบออนเทค
    15. ↑ สมมุติว่าเท่ากับอัลฟา
    16. กย. 2020 - มค 2021 แคลิฟอร์เนีย ถูกอัลฟาแซงไปแล้ว
    17. ↑ 1 กย. 2020 - 29 มค. แคลิฟอร์เนีย
    18. 3 มีค. - 17 พค. 2021 ประเทศอังกฤษ ผลงานศึกษาเบื้องต้นอีกงานในญี่ปุ่นพบว่า สายพันธุเดลตาติดต่อได้เพียงร้อยละ 23 ยิ่งกว่าสายพันธุ์อัลฟา
    19. 1 เมย. - 6 มิย. 2021 ในประเทศสกอตแลนด์
    20. วัคซีน Covaxin ลดลงปานกลาง
    21. GISAID clade
    22. ↑ ในแหล่งอ้างอิงอีกที่หนึ่ง จีเซดตั้งชื่อเคลด 7 เคลดโดยไม่รวมเคลด O แต่รวมเคลด GV
    23. ตามองค์การอนามัยดลก เชื้อสาย (lineage) หรือเคลด (clade) สามารถระบุได้ด้วยการมีบรรพบุรุษร่วมกันตามวิวัฒนาการชาติพันธุ์
    24. จนถึงเดือนมกราคม 2021 จะนับว่าเป็นเคลดในระบบของเน็กซต์สเตรนก็จะต้องผ่านเกณฑ์ต่อไปนี้อย่างใดอย่างหนึ่ง คือ
      1. ได้เกิดในอัตรายิ่งกว่าร้อยละ 20 ในระดับโลกเป็นระยะ 2 เดือนหรือยิ่งกว่า
      2. ได้เกิดในอัตรายิ่งกว่าร้อยละ 30 ในระดับภูมิภาคเป็นระยะ 2 เดือนหรือยิ่งกว่า
      3. ได้จัดเป็นสายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วง (VOC) โดยจนถึงวันที่ 6 มกราคม นี่รวมสายพันธุ์ 501Y.V1 และ 501Y.V2
    25. Antigenicity เป็นสมรรถภาพของโครงสร้างทางเคมี (ไม่ว่าจะเป็นแอนติเจน หรือ hapten) ในการเข้าจับโดยเฉพาะ ๆ กับผลิตภัณฑ์ในร่างกายที่มีภูมิคุ้มกันแบบจำเพาะรวมทั้ง T-cell receptor หรือ antibody (หรือที่เรียกว่า B cell receptor)

    อ้างอิง

    1. ↑ Shahhosseini, Nariman; Babuadze, George; Wong, Gary; Kobinger, Gary (2021). "Mutation Signatures and In Silico Docking of Novel SARS-CoV-2 Variants of Concern". Microorganisms. 9 (5): 926. doi:10.3390/microorganisms9050926. PMID 33925854. S2CID 233460887. สืบค้นเมื่อ 2021-05-04.
    2. "Coronavirus variants and mutations: The science explained". BBC News (ภาษาอังกฤษ). 2021-01-06. สืบค้นเมื่อ 2021-02-02.
    3. Kupferschmidt, K (2021-01-15). "New coronavirus variants could cause more reinfections, require updated vaccines". Science. American Association for the Advancement of Science. doi:10.1126/science.abg6028. สืบค้นเมื่อ 2021-02-02.
    4. Shahhosseini, Nariman; Wong, Gary; Kobinger, Gary; Chinikar, Sadegh (2021). "SARS-CoV-2 spillover transmission due to recombination event". Gene Reports. 23: 101045. doi:10.1016/j.genrep.2021.101045. PMC 7884226. PMID 33615041.
    5. ↑ Kumar, Sudhir; Tao, Qiqing; Weaver, Steven; Sanderford, Maxwell; Caraballo-Ortiz, Marcos A; Sharma, Sudip; Pond, Sergei L K; Miura, Sayaka. "An evolutionary portrait of the progenitor SARS-CoV-2 and its dominant offshoots in COVID-19 pandemic". Oxford Academic. สืบค้นเมื่อ 2020-05-10.
    6. "The ancestor of SARS-CoV-2's Wuhan strain was circulating in late October 2019". News Medical. สืบค้นเมื่อ 2020-05-10. Journal reference: Kumar, S. et al. (2021). An evolutionary portrait...
    7. ↑ "Lineage descriptions". cov-lineages.org. Pango team.
    8. Yurkovetskiy, Leonid; Wang, Xue; Pascal, Kristen E.; Tomkins-Tinch, Christopher; Nyalile, Thomas P.; Wang, Yetao; และคณะ (October 2020). "Structural and Functional Analysis of the D614G SARS-CoV-2 Spike Protein Variant". Cell. 183 (3): 739-751.e8. doi:10.1016/j.cell.2020.09.032. PMC 7492024. PMID 32991842.
    9. Thomson, Emma C.; Rosen, Laura E.; Shepherd, James G.; Spreafico, Roberto; da Silva Filipe, Ana; Wojcechowskyj, Jason A.; และคณะ (March 2021). "Circulating SARS-CoV-2 spike N439K variants maintain fitness while evading antibody-mediated immunity". Cell. 184 (5): 1171-1187.e20. doi:10.1016/j.cell.2021.01.037. PMC 7843029. PMID 33621484.
    10. "Covid: Is there a limit to how much worse variants can get?". BBC. 2021-06-12.
    11. ↑ "Tracking SARS-CoV-2 variants". who.int (ภาษาอังกฤษ). World Health Organization. จากแหล่งเดิมเมื่อ 2021-06-18.
    12. ↑ "SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions". CDC.gov. Centers for Disease Control and Prevention. 2020-02-11.
    13. ↑ "Variants: distribution of cases data". GOV.UK. Government Digital Service. Public Health England.
    14. ↑ "Living Evidence - SARS-CoV-2 variants". Agency for Clinical Innovation. nsw.gov.au. Ministry of Health (New South Wales). 2021-06-22.
    15. ↑ "SARS-CoV-2 variants of concern". ECDC.eu. European Centre for Disease Prevention and Control.
    16. "Coronavirus Disease (COVID-19) Situation Reports". who.int. World Health Organization.
    17. "Investigation of SARS-CoV-2 variants of concern: technical briefings". GOV.UK. Government Digital Service. Public Health England.
    18. "Investigation of SARS-CoV-2 variants of concern: variant risk assessments". GOV.UK. Government Digital Service. Public Health England.
    19. "SARS-CoV-2 variants: risk assessment framework" (PDF). GOV.UK. Government Digital Service. Public Health England. 2021-05-22. GOV-8426.
    20. ↑ Weekly epidemiological update on COVID-19 - 15 June 2021 (Situation report). World Health Organization. 2021-06-15. สืบค้นเมื่อ 2021-06-16.
    21. Rambaut, A; Loman, N; Pybus, O; Barclay, W; Barrett, J; Carabelli, A; และคณะ (2020-12-18). "Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations". Virological. สืบค้นเมื่อ 2021-06-14.
    22. Investigation of novel SARS-COV-2 variant, technical briefing 1 (PDF) (Briefing). Public Health England. 2020-12-21. สืบค้นเมื่อ 2021-06-06.
    23. ↑ "Emerging SARS-CoV-2 Variants". CDC.gov (Science brief). Centers for Disease Control and Prevention. 2021-01-28. สืบค้นเมื่อ 2021-01-04.   บทความนี้รวมเอาเนื้อความจากแหล่งอ้างอิงนี้ ซึ่งเป็นสาธารณสมบัติ
    24. ↑ Chand et al. 2020, p. 6, Potential impact of spike variant N501Y.
    25. Davies, NG; Abbott, S; Barnard, RC; Jarvis, CI; Kucharski, AJ; Munday, JD; และคณะ (2021). "Estimated transmissibility and impact of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7 in England". Science. 372 (6538): eabg3055. doi:10.1126/science.abg3055. PMC 8128288. PMID 33658326.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
    26. Nyberg, T; Twohig, KA; Harris, RJ; Seaman, SR; Flannagan, J; Allen, H; และคณะ (2021-06-15). "Risk of hospital admission for patients with SARS-CoV-2 variant B.1.1.7: cohort analysis". BMJ. 373: n1412. doi:10.1136/bmj.n1412. ISSN 1756-1833. PMID 34130987. S2CID 235187479.
    27. Horby, Peter; Barclay, Wendy; Huntley, Catherine (2021-01-13). NERVTAG paper: brief note on SARS-CoV-2 variants (Note). Public Health England. สืบค้นเมื่อ 2021-06-06.
    28. Zhao, S; Lou, J; Cao, L; Zheng, H; Chong, MK; Chen, Z; และคณะ (2021-01-28). "Quantifying the transmission advantage associated with N501Y substitution of SARS-CoV-2 in the UK: an early data-driven analysis". Journal of Travel Medicine. 28 (2). doi:10.1093/jtm/taab011. ISSN 1195-1982. PMC 7928809. PMID 33506254.
    29. Risk related to the spread of new SARS-CoV-2 variants of concern in the EU/EEA - first update (Risk assessment). European Centre for Disease Prevention and Control. 2021-02-02.
    30. ↑ Weekly epidemiological update on COVID-19 - 8 June 2021 (Situation report). World Health Organization. 2021-06-08. สืบค้นเมื่อ 2021-06-14.
    31. "Confirmed cases of COVID-19 variants identified in UK". Friday 15 January: GOV.UK. Public Health England. 2021-01-15.CS1 maint: location (link)
    32. Horby, Peter; Barclay, Wendy; Gupta, Ravi; Huntley, Catherine (2021-01-27). NERVTAG paper: note on variant P.1 (Note). Public Health England. สืบค้นเมื่อ 2021-06-06.
    33. Coutinho, RM; Marquitti, FM; Ferreira, LS; Borges, ME; da Silva, RL; Canton, O; และคณะ (2021-03-23). "Model-based estimation of transmissibility and reinfection of SARS-CoV-2 P.1 variant". medRxiv (Preprint): 9. doi:10.1101/2021.03.03.21252706. S2CID 232119656. สืบค้นเมื่อ 2021-04-29. The new variant was found to be about 2.6 times more transmissible (95% Confidence Interval (CI): 2.4-2.8) than previous circulating variant (s). ... Table 1: Summary of the fitted parameters and respective confidence intervals considering the entire period, November 1, 2020-January 31, 2021 maintaining the same pathogenicity of the previous variant. Parameter: Relative transmission rate for the new variant. Estimate: 2.61. 2.5%: 2.45. 97.5%: 2.76.
    34. ↑ Faria, NR; Mellan, TA; Whittaker, C; Claro, IM; Candido, DS; Mishra, S; และคณะ (2021-05-21). "Genomics and epidemiology of the P.1 SARS-CoV-2 lineage in Manaus, Brazil". Science. 372 (6544): 815–821. doi:10.1126/science.abh2644. ISSN 0036-8075. PMID 33853970. Within this plausible region of parameter space, P.1 can be between 1.7 and 2.4 times more transmissible (50% BCI, 2.0 median, with a 99% posterior probability of being >1) than local non-P1 lineages and can evade 21 to 46% (50% BCI, 32% median, with a 95% posterior probability of being able to evade at least 10%) of protective immunity elicited by previous infection with non-P.1 lineages, corresponding to 54 to 79% (50% BCI, 68% median) cross-immunity ... We estimate that infections are 1.2 to 1.9 times more likely (50% BCI, median 1.5, 90% posterior probability of being >1) to result in mortality in the period after the emergence of P.1, compared with before, although posterior estimates of this relative risk are also correlated with inferred cross-immunity. More broadly, the recent epidemic in Manaus has strained the city’s health care system, leading to inadequate access to medical care. We therefore cannot determine whether the estimated increase in relative mortality risk is due to P.1 infection, stresses on the Manaus health care system, or both. Detailed clinical investigations of P.1 infections are needed.
    35. Freitas, AR; Lemos, DR; Beckedorff, OA; Cavalcanti, LP; Siqueira, AM; Mello, RC; และคณะ (2021-04-19). "The increase in the risk of severity and fatality rate of covid-19 in southern Brazil after the emergence of the Variant of Concern (VOC) SARS-CoV-2 P.1 was greater among young adults without pre-existing risk conditions" (Preprint). doi:10.1101/2021.04.13.21255281 – โดยทาง medRxiv. Female 20 to 39 years old, with no pre-existing risk conditions, were at risk of death 5.65 times higher in February (95% CI, 2.9-11.03; p <0.0001) and in the age group of 40 and 59 years old, this risk was 7.7 times higher (95% CI, 5.01-11.83; p <0.0001) comparing with November-December. ... The heterogeneity observed between the age groups was greater when we analyzed the subgroup of the population without preexisting risk conditions where we found that the CFR in the female sex in the second wave was 1.95 times (95% CI, 1.38-2.76) the CFR of the first wave in the population over 85 years old and was 7.7 times (95% CI, 5.01-11.83; p < 0.0001) in the population between 40 and 59 years old. In the male population without previous diseases, the CFR in the second wave was 2.18 (95% CI, 1.62-2.93) times the CFR of the first wave in the population over 85 years old and 5.9 (95% CI, 3.2-10.85; p < 0, 0001) higher in the range between 20 and 39 years old. Cite journal requires |journal= (help)
    36. Public Health England (2021-02-16). "Variants: distribution of cases data". GOV.UK. สืบค้นเมื่อ 2021-02-17.
    37. Investigation of novel SARS-CoV-2 variant 202012/01, technical briefing 5 (PDF) (Briefing). Public Health England. 2021-02-02. GW-1905. สืบค้นเมื่อ 2021-06-14.
    38. Investigation of SARS-CoV-2 variants of concern in England, technical briefing 6 (PDF) (Briefing). Public Health England. 2021-02-13. GW-1934. สืบค้นเมื่อ 2021-06-06.
    39. ↑ Collier, DA; De Marco, A; Gupta, RK; al, et (2021-05-06). "Sensitivity of SARS-CoV-2 B.1.1.7 to mRNA vaccine-elicited antibodies". Nature (Published). 593 (7857): 136–141. doi:10.1038/s41586-021-03412-7. PMID 33706364. We therefore generated pseudoviruses that carried the B.1.1.7 spike mutations with or without the additional E484K substitution and tested these against sera obtained after the first and second dose of the BNT162b2 mRNA vaccine as well as against convalescent sera. After the second vaccine dose, we observed a considerable loss of neutralizing activity for the pseudovirus with the B.1.1.7 spike mutations and E484K (Fig. 3d, e). The mean fold change for the E484K-containing B.1.1.7 spike variant was 6.7 compared with 1.9 for the B.1.1.7 variant, relative to the wild-type spike protein (Fig. 3a-c and Extended Data Fig. 5). Similarly, when we tested a panel of convalescent sera with a range of neutralization titres (Fig. 1f, g and Extended Data Fig. 5), we observed additional loss of activity against the mutant B.1.1.7 spike with E484K, with fold change of 11.4 relative to the wild-type spike protein (Fig. 3f, g and Extended Data Fig. 5).
    40. Azad, Arman (2021-03-17). "Coronavirus strains first detected in California are officially 'variants of concern,' CDC says". CNN. สืบค้นเมื่อ 2021-06-06.
    41. Deng, X; Garcia-Knight, MA; Khalid, MM; Servellita, V; Wang, C; Morris, MK; และคณะ (2021-03-09). "Transmission, infectivity, and antibody neutralization of an emerging SARS-CoV-2 variant in California carrying a L452R spike protein mutation" (Preprint). doi:10.1101/2021.03.07.21252647. PMC 7987058. PMID 33758899 – โดยทาง medRxiv. Cite journal requires |journal= (help)
    42. ↑ Zimmer, Carl; Mandavilli, Apoorva (2021-05-14). "How the United States Beat the Variants, for Now". New York Times. สืบค้นเมื่อ 2021-05-17.
    43. Wadman, M (2021-02-23). "California coronavirus strain may be more infectious - and lethal". Science News. doi:10.1126/science.abh2101. สืบค้นเมื่อ 2021-03-17.
    44. SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England, technical briefing 10 (PDF) (Briefing). Public Health England. 2021-05-07. GOV-8226. สืบค้นเมื่อ 2021-06-06.
    45. ↑ "SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions". CDC.gov. Centers for Disease Control and Prevention. 2021-05-12. สืบค้นเมื่อ 2021-05-16.
    46. ↑ SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England, technical briefing 15 (PDF) (Briefing). Public Health England. 2021-06-11. GOV-8576. สืบค้นเมื่อ 2021-06-15.
    47. Ito, K; Piantham, C; Nishiura, H (2021-06-15). "Predicted domination of variant Delta of SARS-CoV-2 before Tokyo Olympic games, Japan". medRxiv (Preprint). doi:10.1101/2021.06.12.21258835. S2CID 235437370.
    48. Sheikh, A; McMenamin, J; Taylor, B; Robertson, C (2021-06-14). "SARS-CoV-2 Delta VOC in Scotland: demographics, risk of hospital admission, and vaccine effectiveness". The Lancet. doi:10.1016/S0140-6736(21)01358-1. ISSN 0140-6736. PMID 34139198.
    49. ↑ Yadav, PD; Sapkal, GN; Abraham, P; Ella, R; Deshpande, G; Patil, DY; และคณะ (2021-05-07). "Neutralization of variant under investigation B.1.617 with sera of BBV152 vaccinees". Clinical Infectious Diseases. Oxford University Press (ciab411). bioRxiv 10.1101/2021.04.23.441101. doi:10.1093/cid/ciab411. PMID 33961693.
    50. ↑ Planas, D; Veyer, D; Baidaliuk, A; Staropoli, I; Guivel-Benhassine, F; Rajah, MM; และคณะ (2021-05-27). "Reduced sensitivity of infectious SARS-CoV-2 variant B.1.617.2 to monoclonal antibodies and sera from convalescent and vaccinated individuals". bioRxiv 10.1101/2021.05.26.445838.
    51. Risk assessment for SARS-CoV-2 variant Delta (PDF) (Assessment). Public Health England. 2021-06-18. GOV-8664. สืบค้นเมื่อ 2021-06-22.
    52. Nuki, Paul; Newey, Sarah (2021-04-16). "Arrival of India's 'double mutation' adds to variant woes, but threat posed remains unclear". The Telegraph (ภาษาอังกฤษ). ISSN 0307-1235. สืบค้นเมื่อ 2021-04-17.
    53. "B.1.525 international lineage report". cov-lineages.org. Pango team. สืบค้นเมื่อ 2021-06-04.
    54. "Date mismatch between international report and lineage description - cov-lineages/pangolin". GitHub (Software issue). 2021-06-13. สืบค้นเมื่อ 2021-06-14.
    55. ↑ "B.1.525". cov-lineages.org. Pango team. สืบค้นเมื่อ 2021-03-22.
    56. "B.1.525". cov-lineages.org. Pango team. สืบค้นเมื่อ 2021-03-22.
    57. ตารางนี้เป็นการปรับใช้งานของ Alm et al. (), figure 1
    58. ↑ Rambaut, A; Holmes, EC; Á, O'Toole; Hill, V; McCrone, JT; Ruis, C; และคณะ (November 2020). "A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages to assist genomic epidemiology". Nature Microbiology. 5 (11): 1403–1407. doi:10.1038/s41564-020-0770-5. PMC 7610519. PMID 32669681. S2CID 220544096. Cited in Alm et al. ()
    59. ↑ Alm, E; Broberg, EK; Connor, T; Hodcroft, EB; Komissarov, AB; Maurer-Stroh, S; และคณะ (August 2020). "Geographical and temporal distribution of SARS-CoV-2 clades in the WHO European Region, January to June 2020". Euro Surveillance. 25 (32). doi:10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410. PMC 7427299. PMID 32794443.
    60. ↑ "Nextclade" (What are the clades?). clades.nextstrain.org. จากแหล่งเดิมเมื่อ 2021-01-19. สืบค้นเมื่อ 2021-01-19.
    61. ↑ Bedford, T; Hodcroft, B; Neher, RA (2021-01-06). "Updated Nextstrain SARS-CoV-2 clade naming strategy". nextstrain.org/blog. สืบค้นเมื่อ 2021-01-19.
    62. ↑ Zhukova, A; Blassel, L; Lemoine, F; Morel, M; Voznica, J; Gascuel, O (November 2020). "Origin, evolution and global spread of SARS-CoV-2". Comptes Rendus Biologies: 1–20. doi:10.5802/crbiol.29. PMID 33274614.
    63. ↑ Zhang, W; Davis, B; Chen, SS; Martinez, JS; Plummer, JT; Vail, E (2021). "Emergence of a novel SARS-CoV-2 strain in Southern California, USA". MedRxiv. doi:10.1101/2021.01.18.21249786. S2CID 231646931.
    64. "PANGO lineages-Lineage B.1.1.28". cov-lineages.org. สืบค้นเมื่อ 2021-02-04.[ไม่อยู่ในแหล่งอ้างอิง]
    65. "Variant: 20J/501Y.V3". covariants.org. 2021-04-01. สืบค้นเมื่อ 2021-04-06.
    66. "clade tree (from 'Clade and lineage nomenclature')". www.gisaid.org. 2020-07-04. สืบค้นเมื่อ 2021-01-07.
    67. ↑ "3.6 Considerations for virus naming and nomenclature". SARS-CoV-2 genomic sequencing for public health goals: Interim guidance, 8 January 2021. World Health Organization. 2021-01-08. p. 6. สืบค้นเมื่อ 2021-02-02.
    68. "Don't call it the 'British variant.' Use the correct name: B.1.1.7". STAT (ภาษาอังกฤษ). 2021-02-09. สืบค้นเมื่อ 2021-02-12.
    69. Flanagan, R (2021-02-02). "Why the WHO won't call it the 'U.K. variant', and you shouldn't either". Coronavirus (ภาษาอังกฤษ). สืบค้นเมื่อ 2021-02-12.
    70. "The name game for coronavirus variants just got a little easier". stat. 2021-05-31.
    71. -emergency-committee-regarding-the-coronavirus-disease-(covid-19) -pandemic "Statement on the sixth meeting of the International Health Regulations (2005) Emergency Committee regarding the coronavirus disease (COVID-19) pandemic" Check |url= value (help). World Health Organization. 2021-01-15. สืบค้นเมื่อ 2021-01-18.
    72. Koyama, T; Platt, D; Parida, L (July 2020). "Variant analysis of SARS-CoV-2 genomes". Bulletin of the World Health Organization. 98 (7): 495–504. doi:10.2471/BLT.20.253591. PMC 7375210. PMID 32742035. We detected in total 65776 variants with 5775 distinct variants.
    73. "Global phylogeny, updated by Nextstrain". GISAID. 2021-01-18. สืบค้นเมื่อ 2021-01-19.
    74. Hadfield, J; Megill, C; Bell, SM; Huddleston, J; Potter, B; Callender, C; และคณะ (December 2018). Kelso, J (บ.ก.). "Nextstrain: real-time tracking of pathogen evolution". Bioinformatics. 34 (23): 4121–4123. doi:10.1093/bioinformatics/bty407. PMC 6247931. PMID 29790939.
    75. "cov-lineages/pangolin: Software package for assigning SARS-CoV-2 genome sequences to global lineages". Github. สืบค้นเมื่อ 2021-01-02.
    76. Rambaut, A; Holmes, EC; Á, O'Toole; Hill, V; McCrone, JT; Ruis, C; และคณะ (March 2021). "Addendum: A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages to assist genomic epidemiology". Nature Microbiology. 6 (3): 415. doi:10.1038/s41564-021-00872-5. PMC 7845574. PMID 33514928.
    77. Wu, Fan; Zhao, Su; Yu, Bin; Chen, Yan-Mei; Wang, Wen; Song, Zhi-Gang; Hu, Yi; Tao, Zhao-Wu; Tian, Jun-Hua; Pei, Yuan-Yuan; Yuan, Ming-Li; Zhang, Yu-Ling; Dai, Fa-Hui; Liu, Yi; Wang, Qi-Min; Zheng, Jiao-Jiao; Xu, Lin; Holmes, Edward C.; Zhang, Yong-Zhen (2020). "A new coronavirus associated with human respiratory disease in China". Nature. 579 (7798): 265–269. doi:10.1038/s41586-020-2008-3. ISSN 0028-0836.
    78. Chiara, M; Horner, DS; Gissi, C; Pesole, G (May 2021). "Comparative Genomics Reveals Early Emergence and Biased Spatiotemporal Distribution of SARS-CoV-2". Mol Biol Evol. 38 (6): 2547–2565. doi:10.1093/molbev/msab049. PMC 7928790. PMID 33605421.
    79. Zhou, Peng; Yang, Xing-Lou; Wang, Xian-Guang; Hu, Ben; Zhang, Lei; Zhang, Wei; Si, Hao-Rui; Zhu, Yan; Li, Bei; Huang, Chao-Lin; Chen, Hui-Dong; Chen, Jing; Luo, Yun; Guo, Hua; Jiang, Ren-Di; Liu, Mei-Qin; Chen, Ying; Shen, Xu-Rui; Wang, Xi; Zheng, Xiao-Shuang; Zhao, Kai; Chen, Quan-Jiao; Deng, Fei; Liu, Lin-Lin; Yan, Bing; Zhan, Fa-Xian; Wang, Yan-Yi; Xiao, Geng-Fu; Shi, Zheng-Li (2020). "A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin". Nature. 579 (7798): 270–273. doi:10.1038/s41586-020-2012-7. ISSN 0028-0836.
    80. Okada, Pilailuk; Buathong, Rome; Phuygun, Siripaporn; Thanadachakul, Thanutsapa; Parnmen, Sittiporn; Wongboot, Warawan; Waicharoen, Sunthareeya; Wacharapluesadee, Supaporn; Uttayamakul, Sumonmal; Vachiraphan, Apichart; Chittaganpitch, Malinee; Mekha, Nanthawan; Janejai, Noppavan; Iamsirithaworn, Sopon; Lee, Raphael TC; Maurer-Stroh, Sebastian (2020). "Early transmission patterns of coronavirus disease 2019 (COVID-19) in travellers from Wuhan to Thailand, January 2020". Eurosurveillance. 25 (8). doi:10.2807/1560-7917.ES.2020.25.8.2000097. ISSN 1560-7917.
    81. "Official hCoV-19 Reference Sequence". GISAID. สืบค้นเมื่อ 2021-05-14.
    82. ↑ "Emerging SARS-CoV-2 Variants". cdc.org (Science brief). Centers for Disease Control and Prevention. 2021-01-28. สืบค้นเมื่อ 2021-01-04.   บทความนี้รวมเอาเนื้อความจากแหล่งอ้างอิงนี้ ซึ่งเป็นสาธารณสมบัติ
    83. "COVID "Mega-variant" and eight criteria for a template to assess all variants". Science Speaks: Global ID News (ภาษาอังกฤษ). 2021-02-02. สืบค้นเมื่อ 2021-02-20.
    84. Griffiths, E; Tanner, J; Knox, N; Hsiao, W; Van Domselaar, G (2021-01-15). "CanCOGeN Interim Recommendations for Naming, Identifying,and Reporting SARS-CoV-2 Variants of Concern" (PDF). CanCOGeN (nccid.ca). สืบค้นเมื่อ 2021-02-25.
    85. Chand, M; Hopkins, S; Dabrera, G; Achison, C; Barclay, W; Ferguson, N et al. (2020-12-21). Investigation of novel SARS-COV-2 variant: Variant of Concern 202012/01 (รายงาน). Public Health England. https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/947048/Technical_Briefing_VOC_SH_NJL2_SH2.pdf. เรียกข้อมูลเมื่อ 2020-12-23. 
    86. "Covid: Ireland, Italy, Belgium and Netherlands ban flights from UK". BBC News. 2020-12-20.
    87. "PHE investigating a novel strain of COVID-19". Public Health England (PHE). 2020-12-14.
    88. Rambaut, A; Loman, N; Pybus, O; Barclay, W; Barrett, J; Carabelli, A et al. (2020). Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations (รายงาน). Written on behalf of COVID-19 Genomics Consortium UK. https://virological.org/t/563. เรียกข้อมูลเมื่อ 2020-12-20. 
    89. Kupferschmidt, K (2020-12-20). "Mutant coronavirus in the United Kingdom sets off alarms but its importance remains unclear". Science Mag (ภาษาอังกฤษ). สืบค้นเมื่อ 2020-12-21.
    90. "New evidence on VUI-202012/01 and review of the public health risk assessment". khub.net. 2020-12-15.
    91. "COG-UK Showcase Event". สืบค้นเมื่อ 2020-12-25 – โดยทาง YouTube.
    92. "New evidence on VUI-202012/01 and review of the public health risk assessment". สืบค้นเมื่อ 2021-01-04.
    93. "Estimated transmissibility and severity of novel SARS-CoV-2 Variant of Concern 202012/01 in England". CMMID Repository. 2020-12-23. สืบค้นเมื่อ 2021-01-24 – โดยทาง GitHub.
      • Cited in "Risk related to the spread of new SARS-CoV-2 variants of concern in the EU/EEA - first update" (PDF). Stockholm: European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC). 2021-01-21. p. 9. สืบค้นเมื่อ 2021-01-24.
    94. Gallagher, J (2021-01-22). "Coronavirus: UK variant 'may be more deadly'". BBC News. สืบค้นเมื่อ 2021-01-22.
    95. Horby, Peter; Huntley, Catherine; Davies, Nick; Edmunds, John; Ferguson, Neil; Medley, Graham; Hayward, Andrew; Cevik, Muge; Semple, Calum (2021-02-11). "NERVTAG paper on COVID-19 variant of concern B.1.1.7: NERVTAG update note on B.1.1.7 severity (2021-02-11)" (PDF). www.gov.uk.CS1 maint: uses authors parameter (link)
    96. Genomic characteristics and clinical effect of the emergent SARS-CoV-2 B.1.1.7 lineage in London, UK: a whole-genome sequencing and hospital-based cohort study, Dan Frampton, et al., The Lancet, Online, April 12, 2021
    97. "PANGO lineages Lineage B.1.1.7". cov-lineages.org. สืบค้นเมื่อ 2021-05-15.
    98. Mandavilli, A (2021-03-05). "In Oregon, Scientists Find a Virus Variant With a Worrying Mutation - In a single sample, geneticists discovered a version of the coronavirus first identified in Britain with a mutation originally reported in South Africa". The New York Times. สืบค้นเมื่อ 2021-03-06.
    99. Chen, RE; Zhang, X; Case, JB; Winkler, ES; Liu, Y; VanBlargan, LA; และคณะ (March 2021). "Resistance of SARS-CoV-2 variants to neutralization by monoclonal and serum-derived polyclonal antibodies". Nature Medicine. 27 (4): 717–726. doi:10.1038/s41591-021-01294-w. PMC 8058618. PMID 33664494.
    100. "B.1.1.7 Lineage with S:E484K Report". outbreak.info. 2021-03-05. สืบค้นเมื่อ 2021-03-07.
    101. Moustafa, AM; Bianco, C; Denu, L; Ahmed, A; Neide, B; Everett, J; และคณะ (2021-04-21). "Comparative Analysis of Emerging B.1.1.7+E484K SARS-CoV-2 isolates from Pennsylvania". bioRxiv 10.1101/2021.04.21.440801.
    102. B.1.1.7 Lineage with S:E484K Report, outbreak.info
    103. ↑ "South Africa announces a new coronavirus variant". The New York Times. 2020-12-18. สืบค้นเมื่อ 2020-12-20.
    104. ↑ Wroughton, L; Bearak, M (2020-12-18). "South Africa coronavirus: Second wave fueled by new strain, teen 'rage festivals'". The Washington Post. สืบค้นเมื่อ 2020-12-20.
    105. Mkhize, Z (2020-12-18). "Update on Covid-19 (18th December 2020)" (Press release). South Africa. COVID-19 South African Online Portal. สืบค้นเมื่อ 2020-12-23. Our clinicians have also warned us that things have changed and that younger, previously healthy people are now becoming very sick.
    106. "The 2nd Covid-19 wave in South Africa:Transmissibility & a 501.V2 variant, 11th slide". www.scribd.com. 2020-12-19.
    107. Lowe, D (2020-12-22). "The New Mutations". In the Pipeline. American Association for the Advancement of Science. สืบค้นเมื่อ 2020-12-23. I should note here that there's another strain in South Africa that is bringing on similar concerns. This one has eight mutations in the Spike protein, with three of them (K417N, E484K and N501Y) that may have some functional role.
    108. "Statement of the WHO Working Group on COVID-19 Animal Models (WHO-COM) about the UK and South African SARS-CoV-2 new variants" (PDF). World Health Organization. 2020-12-22. สืบค้นเมื่อ 2020-12-23.
    109. "Japan finds new coronavirus variant in travelers from Brazil". Japan Today. Japan. 2021-01-11. สืบค้นเมื่อ 2021-01-14.
    110. ↑ Faria, NR; Claro, IM; Candido, D; LA, Moyses Franco; Andrade, PS; Coletti, TM; และคณะ (2021-01-12). "Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings". CADDE Genomic Network. virological.org. สืบค้นเมื่อ 2021-01-23.
    111. "COG-UK Report on SARS-CoV-2 Spike mutations of interest in the UK" (PDF). Covid-19 Genomics UK Consortium. 2021-01-15. สืบค้นเมื่อ 2021-01-25.
    112. "P.1 report". cov-lineages.org. สืบค้นเมื่อ 2021-02-08.
    113. ↑ Voloch, CM; da Silva Francisco, R; de Almeida, LG; Cardoso, CC; Brustolini, OJ; Gerber, AL; และคณะ (2020). "Genomic characterization of a novel SARS-CoV-2 lineage from Rio de Janeiro, Brazil". doi:10.1101/2020.12.23.20248598. S2CID 229379623 – โดยทาง MedRxiv. Cite journal requires |journal= (help)
    114. Nascimento, V; Souza, V (2021-02-25). "COVID-19 epidemic in the Brazilian state of Amazonas was driven by long-term persistence of endemic SARS-CoV-2 lineages and the recent emergence of the new Variant of Concern P.1". Research Square. doi:10.21203/rs.3.rs-275494/v1. สืบค้นเมื่อ 2021-03-02. Cite journal requires |journal= (help)
    115. Andreoni, M; Londoño, E; Casado, L (2021-03-03). "Brazil's Covid Crisis Is a Warning to the Whole World, Scientists Say - Brazil is seeing a record number of deaths, and the spread of a more contagious coronavirus variant that may cause reinfection". The New York Times. สืบค้นเมื่อ 2021-03-03.
    116. Zimmer, C (2021-03-01). "Virus Variant in Brazil Infected Many Who Had Already Recovered From Covid-19 - The first detailed studies of the so-called P.1 variant show how it devastated a Brazilian city. Now scientists want to know what it will do elsewhere". The New York Times. สืบค้นเมื่อ 2021-03-03.
    117. Garcia-Beltran, W; Lam, E; Denis, K (2021-03-12). "Circulating SARS-CoV-2 variants escape neutralization by vaccine-induced humoral immunity". doi:10.1101/2021.02.14.21251704. สืบค้นเมื่อ 2021-04-14 – โดยทาง medrxiv.
    118. Gaier, R (2021-03-05). "Exclusive: Oxford study indicates AstraZeneca effective against Brazil variant, source says". Reuters. Rio de Janeiro. สืบค้นเมื่อ 2021-03-09.
    119. "Exclusive: Oxford study indicates AstraZeneca effective against Brazil variant, source says". Reuters. Rio de Janeiro. 2021-03-08. สืบค้นเมื่อ 2021-03-09.
    120. Moutinho, Sofia (2021-05-04). "Chinese COVID-19 vaccine maintains protection in variant-plagued Brazil".
    121. Simões, E; Gaier, R (2021-03-08). "CoronaVac e Oxford são eficazes contra variante de Manaus, dizem laboratórios" [CoronaVac and Oxford are effective against Manaus variant, say laboratories]. UOL Notícias (ภาษาโปรตุเกส). Reuters Brazil. สืบค้นเมื่อ 2021-03-09.
    122. "PANGO lineages". cov-lineages.org. สืบค้นเมื่อ 2021-04-18.
    123. ↑ Koshy, J (2021-04-08). "Coronavirus | Indian 'double mutant' strain named B.1.617". The Hindu (ภาษาอังกฤษ).
    124. "India's variant-fuelled second wave coincided with spike in infected flights landing in Canada". Toronto Sun. 2021-04-10. สืบค้นเมื่อ 2021-04-10.
    125. "Weekly epidemiological update on COVID-19 - 11 May 2021". World Health Organization. 2021-05-11. สืบค้นเมื่อ 2021-05-12.
    126. "COVID strain first detected in India found in 53 territories: WHO".
    127. "British scientists warn over Indian coronavirus variant". Reuters. 2021-05-07. สืบค้นเมื่อ 2021-05-07.
    128. "SARS-CoV-2 variants of concern as of 6 May 2021". European Centre for Disease Prevention and Control (ภาษาอังกฤษ). สืบค้นเมื่อ 2021-05-12.
    129. "expert reaction to VUI-21APR-02/B.1.617.2 being classified by PHE as a variant of concern". Science Media Centre. 2021-05-07. สืบค้นเมื่อ 2021-05-15.
    130. Pearson, Heide; Pullen, Lauren; Dao, Christa (2021-06-11). "AHS breaks down vaccination data of COVID-19 Delta variant outbreak at Calgary hospital". Global News. สืบค้นเมื่อ 2021-06-12.
    131. Schraer, Rachel (2021-06-04). "'Nepal variant': What's the mutation stopping green list trips to Portugal?". BBC News. สืบค้นเมื่อ 2021-06-18.
    132. Acharya, Bhargav; Jamkhandikar, Shilpa (2021-06-23). "Explainer: What is the Delta variant of coronavirus with K417N mutation?". Reuters. สืบค้นเมื่อ 2021-06-23.
    133. SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England, technical briefing 16 (PDF) (Briefing). Public Health England. 2021-06-18. GOV-8641. สืบค้นเมื่อ 2021-06-23.
    134. Sharma, Milan. "New 'Delta Plus' variant of SARS-CoV-2 identified; here's what we know so far". India Today (ภาษาอังกฤษ). สืบค้นเมื่อ 2021-06-16.
    135. Cutler, Sally (2021-06-18). "'Nepal variant': what we've learned so far". The Conversation. สืบค้นเมื่อ 2021-06-18.
    136. "India says new COVID variant is a concern". Reuters. Bengaluru. 2021-06-22. สืบค้นเมื่อ 2021-06-23.
    137. Biswas, Soutik (2021-06-23). "Delta plus: Scientists say too early to tell risk of Covid-19 variant". BBC News. สืบค้นเมื่อ 2021-06-23.
    138. "Southern California COVID-19 Strain Rapidly Expands Global Reach". Cedars-Sinai Newsroom. Los Angeles. 2021-02-11. สืบค้นเมื่อ 2021-03-17.
    139. B.1.429 Lineage Report. Alaa Abdel Latif, Julia L. Mullen, Manar Alkuzweny, Ginger Tsueng, Marco Cano, Emily Haag, Jerry Zhou, Mark Zeller, Nate Matteson, Chunlei Wu, Kristian G. Andersen, Andrew I. Su, Karthik Gangavarapu, Laura D. Hughes, and the Center for Viral Systems Biology. outbreak.info, (available at https://outbreak.info/situation-reports?pango=B.1.429&loc=USA&loc=USA_US-CA&selected=USA_US-CA). Accessed 28 May 2021.
    140. ↑ "New California Variant May Be Driving Virus Surge There, Study Suggests". New York Times. 2021-01-19.
    141. "SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions". Centers for Disease Control and Prevention. U.S. Department of Health & Human Services. 2021-03-24. สืบค้นเมื่อ 2021-04-04.
    142. Shen, X; Tang, H; Pajon, R; Smith, G; Glenn, GM; Shi, W; และคณะ (April 2021). "Neutralization of SARS-CoV-2 Variants B.1.429 and B.1.351". The New England Journal of Medicine. doi:10.1056/NEJMc2103740. PMC 8063884. PMID 33826819.
    143. "Local COVID-19 Strain Found in Over One-Third of Los Angeles Patients". news wise (Press release). California: Cedars Sinai Medical Center. 2021-01-19. สืบค้นเมื่อ 2021-03-03.
    144. "B.1.429". Rambaut Group, University of Edinburgh. PANGO Lineages. 2021-02-15. สืบค้นเมื่อ 2021-02-16.
    145. "B.1.429 Lineage Report". Scripps Research. outbreak.info. 2021-02-15. สืบค้นเมื่อ 2021-02-16.
    146. "PANGO lineages Lineage P.2". COV lineages. สืบค้นเมื่อ 2021-01-28. P.2… Alias of B.1.1.28.2, Brazilian lineage
    147. "Delta-PCR-testen" [The Delta PCR Test] (ภาษาDanish). Statens Serum Institut. 2021-02-25. สืบค้นเมื่อ 2021-02-27.CS1 maint: unrecognized language (link)
    148. ↑ "GISAID hCOV19 Variants (see menu option 'G/484K.V3 (B.1.525)')". www.gisaid.org. สืบค้นเมื่อ 2021-03-04.
    149. ↑ "Status for udvikling af SARS-CoV-2 Variants of Concern (VOC) i Danmark" [Status of development of SARS-CoV-2 Variants of Concern (VOC) in Denmark] (ภาษาDanish). Statens Serum Institut. 2021-02-27. สืบค้นเมื่อ 2021-02-27.CS1 maint: unrecognized language (link)
    150. "Varianten van het coronavirus SARS-CoV-2" [Variants of the coronavirus SARS-CoV-2] (ภาษาDutch). Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu, RIVM. 2021-02-16. สืบค้นเมื่อ 2021-02-16.CS1 maint: unrecognized language (link)
    151. "A coronavirus variant with a mutation that 'likely helps it escape' antibodies is already in at least 11 countries, including the US". Business Insider. 2021-02-16. สืบค้นเมื่อ 2021-02-16.
    152. "En ny variant av koronaviruset er oppdaget i Norge. Hva vet vi om den?" [A new variant of the coronavirus has been discovered in Norway. What do we know about it?] (ภาษาNorwegian). Aftenposten. 2021-02-18. สืบค้นเมื่อ 2021-02-18.CS1 maint: unrecognized language (link)
      • Cullen, P (2021-02-25). "Coronavirus: Variant discovered in UK and Nigeria found in State for first time". The Irish Times. สืบค้นเมื่อ 2021-02-25.
      • Gataveckaite, G (2021-02-25). "First Irish case of B1525 strain of Covid-19 confirmed as R number increases". Irish Independent. สืบค้นเมื่อ 2021-02-25.
      • McGlynn, M (2021-02-25). "Nphet confirm new variant B1525 detected in Ireland as 35 deaths and 613 cases confirmed". Irish Examiner. สืบค้นเมื่อ 2021-02-25.
    154. Roberts, M (2021-02-16). "Another new coronavirus variant seen in the UK". BBC News. สืบค้นเมื่อ 2021-02-16.
    155. "DOH confirms detection of 2 SARS-CoV-2 mutations in Region 7". ABS-CBN News (ภาษาอังกฤษ). 2021-02-18. สืบค้นเมื่อ 2021-03-13.
    156. Santos, E (2021-03-13). "DOH reports COVID-19 variant 'unique' to PH, first case of Brazil variant". CNN Philippines. สืบค้นเมื่อ 2021-03-17.
    157. "DOH confirms new COVID-19 variant first detected in PH, first case of Brazil variant". ABS-CBN News (ภาษาอังกฤษ). 2021-03-13. สืบค้นเมื่อ 2021-03-13.
    158. "PH discovered new COVID-19 variant earlier than Japan, expert clarifies". CNN Philippines. 2021-03-13. สืบค้นเมื่อ 2021-03-17.
    159. "Japan detects new coronavirus variant from traveler coming from PH". CNN Philippines. 2021-03-13. สืบค้นเมื่อ 2021-03-21.
    160. "UK reports 2 cases of COVID-19 variant first detected in Philippines". ABS-CBN. 2021-03-17. สืบค้นเมื่อ 2021-03-21.
    161. "Covid-19: Sarawak detects variant reported in the Philippines" (ภาษาอังกฤษ). 2021-04-30. สืบค้นเมื่อ 2021-04-30.
    162. Mandavilli, A (2021-02-24). "A New Coronavirus Variant Is Spreading in New York, Researchers Report". The New York Times.
    163. "Tracking SARS-CoV-2 variants". www.who.int (ภาษาอังกฤษ). 2021-05-31. สืบค้นเมื่อ 2021-06-05.
    164. Weekly epidemiological update on COVID-19 - 27 April 2021 (Situation report). World Health Organization. 2021-04-27. สืบค้นเมื่อ 2021-06-14.
    165. Le Page, Michael (2021-06-04). "Indian covid-19 variant (B.1.617)". New Scientist. สืบค้นเมื่อ 2021-06-08.
    166. (in en) SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England - Technical briefing 10 (รายงาน). London. 2021-05-07. https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/984274/Variants_of_Concern_VOC_Technical_Briefing_10_England.pdf. เรียกข้อมูลเมื่อ 2021-06-05. "A variant first detected in India was designated under investigation on 1 April 2021 as VUI-21APR-01 (B.1.617.1)."  OGL บทความนี้ รวมเนื้อความที่ตีพิมพ์ใต้สัญญา Open Government Licence v3.0:
    167. "Tracking SARS-CoV-2 variants". World Health Organization (ภาษาอังกฤษ). สืบค้นเมื่อ 2021-06-17.
    168. ↑ "Detection of SARS-CoV-2 P681H Spike Protein Variant in Nigeria". Virological (ภาษาอังกฤษ). 2020-12-23. สืบค้นเมื่อ 2021-01-01.
    169. "Lineage B.1.1.207". cov-lineages.org. Pango team. สืบค้นเมื่อ 2021-03-11.
    170. "Queensland travellers have hotel quarantine extended after Russian variant of coronavirus detected". www.abc.net.au (ภาษาอังกฤษ). 2021-03-03. สืบค้นเมื่อ 2021-03-03.
    171. "Latest update: New Variant Under Investigation designated in the UK". www.gov.uk. 2021-03-04. สืบค้นเมื่อ 2021-03-05.
    172. "New coronavirus variant found in West Bengal". thehindu.
    173. "What is the new 'triple mutant variant' of Covid-19 virus found in Bengal? How bad is it?". indiatoday. 2021-04-22.
    174. "PANGO lineages Lineage B.1.618". cov-lineages. สืบค้นเมื่อ 2021-04-23.
    175. ↑ "COVID-19: African variant reveals sequencing lag".
    176. "Unidentified coronavirus strain found in eastern Lithuania". lrt.lt. 2021-04-20.
    177. "The travel-related origin and spread of SARS-CoV-2 B.1.620 strain". 2021-05-11.
    178. Lassaunière, R; Fonager, J; Rasmussen, M; Frische, A; Strandh, C; Rasmussen, T; และคณะ (2020-11-10). SARS-CoV-2 spike mutations arising in Danish mink, their spread to humans and neutralization data (Preprint). Statens Serum Institut. จากแหล่งเดิมเมื่อ 2020-11-10. สืบค้นเมื่อ 2020-11-11.
    179. "Detection of new SARS-CoV-2 variants related to mink" (PDF). European Centre for Disease Prevention and Control. 2020-11-12. สืบค้นเมื่อ 2020-11-12.
    180. "SARS-CoV-2 mink-associated variant strain - Denmark". WHO Disease Outbreak News. 2020-11-06. สืบค้นเมื่อ 2021-03-19.
    181. "Danish Covid mink variant 'very likely extinct', but controversial cull continues". theguardian. 2020-11-19.
    182. Larsen, HD; Fonager, J; Lomholt, FK; Dalby, T; Benedetti, G; Kristensen, B; และคณะ (February 2021). "Preliminary report of an outbreak of SARS-CoV-2 in mink and mink farmers associated with community spread, Denmark, June to November 2020". Euro Surveillance. 26 (5). doi:10.2807/1560-7917.ES.2021.26.5.210009. PMC 7863232. PMID 33541485.
    183. "Covid-19 and evolutionary pressure - can we predict which genetic dangers lurk beyond the horizon?". 2021-06-14: n230. Cite journal requires |journal= (help)
    184. ↑ Greenwood, M (2021-01-15). ""What Mutations of SARS-CoV-2 are Causing Concern?"]". News Medical Lifesciences. สืบค้นเมื่อ 2021-01-16.
    185. Tandel, Dixit; Gupta, Divya; Sah, Vishal; Harshan, Krishnan Harinivas (2021-04-30). "N440K variant of SARS-CoV-2 has Higher Infectious Fitness". bioRxiv (ภาษาอังกฤษ): 2021.04.30.441434. doi:10.1101/2021.04.30.441434.
    186. Bhattacharjee, Sumit (2021-05-03). "COVID-19 | A.P. strain at least 15 times more virulent". The Hindu (ภาษาอังกฤษ).
    187. "Hyderabad: Mutant N440K 10 times more infectious than parent strain".
    พฤศจิกายน 16, 2021
    สายพ, นธ, ของ, sars, ไวร, สก, อโรคโคว, อไวร, สโคโรนาสายพ, นธ, ใหม, sars, ปแปร, variants, าง, มากมาย, บางชน, ดเช, อว, าหร, อเคยเช, อว, าสำค, เพราะม, โอกาสเพ, มการต, ดต, อของโรค, เพ, มความร, นแรงของโรค, หร, อลดประส, ทธ, ภาพของว, คซ, บทความน, กล, าวถ, งสายพ, นธ, . iwrskxorkhokhwid 19 khuxiwrsokhornasayphnthuihm SARS CoV 2 nn mirupaepr variants tang makmay bangchnidechuxwahruxekhyechuxwasakhy ephraamioxkasephimkartidtxkhxngorkh 1 ephimkhwamrunaerngkhxngorkh hruxldprasiththiphaphkhxngwkhsin 2 3 bthkhwamniklawthungsayphnthuhruxrupaeprthioddednkhxngiwrsokhwid 19 aelakarklayphnthuaebbmisesns missense mutation thiphbinsayphnthuehlanielnmiediy karklayphnthuthimiphlbwk phllb aelaphlepnklang txwiwthnakarkhxngiwrsokhorna tang echn iwrsokhwid 19 SARS CoV 2 sayphnthuiwrsokhwid 19 thixngkhkrsatharnsukhinshrthaelaxngkvsidraynganxyangepnthangkar epniwrsthimikarklayphnthuchnid L452R hrux E484K bthkhwamnixangxingkhristskrach khristthswrrs khriststwrrs sungepnsarasakhykhxngenuxha enuxha 1 khwamyx 2 chux 3 ladbyinxangxing 4 eknthkhwamepnsayphnthuoddedn 5 sayphnthuthinaepnhwng xngkhkarxnamyolk 5 1 xlfa B 1 1 7 5 1 1 B 1 1 7 bwkkbkarklayphnthu E484K 5 2 ebta B 1 351 5 3 aekmma P 1 5 4 edlta B 1 617 2 6 sayphnthuthinasnic xngkhkarxnamyolk 6 1 expsilxn B 1 429 CAL 20C 6 2 sita P 2 6 3 xita B 1 525 6 4 thita P 3 6 5 ixoxta B 1 526 6 6 aekhppa B 1 617 1 6 7 aelmbda C 37 7 sayphnthuednxun 7 1 B 1 1 207 7 2 B 1 1 317 7 3 B 1 1 318 7 4 B 1 618 7 5 B 1 620 8 kartidtxorkhkhamspichis 8 1 khlsetxr 5 9 karklayphnthuaebbmisesns missense edn 9 1 N440K 9 2 L452R 9 3 S477G N 9 4 E484K 9 5 E484Q 9 6 N501Y 9 7 D614G 9 8 P681H 9 9 P681R 9 10 A701V 10 kartrwcaelapraeminsayphnthuihm 11 aehlngkaenidsayphnthutang 12 phltxprasiththiphaphwkhsin 12 1 xlfa B 1 1 7 12 2 ebta B 1 351 12 3 aekmma P 1 12 4 edlta B 1 617 2 13 echingxrrth 14 xangxing 15 aehlngkhxmulxunkhwamyx aekikhaemechuxiwrsokhwid 19 SARS CoV 2 erimaerkxacekidcakkarphsmkn recombination rahwangiwrskhlayokhwidkhxngkhangkhawkbiwrsokhornapracatwnim phankartidtxorkhkhamspichis 4 aetkarklayphnthukmibthbathsakhyinwiwthnakaraelakarekidrupaeprihm khxngiwrs 1 sahrbsayphnthuaerkthiidtwxyangaelwrabuinpraethscin nkwicycdwamntangkbcionmbrrphburusodyhangknthung 3 sayphnthu 5 6 dngnn iwrsokhwid 19 cungmisayphnthutang makmay 7 karhaladbdiexnexthithaknidinpccubnxacthaihtrwcphbsayphnthuihm iderwemuxorkhrabad 8 emuxichkbopraekrmprayuktthiaesdngtnimsayphnthuodycaaenktamwiwthnakarchatiphnthu phylogenetic tree visualization software ladbcionmsamarthaebngepnklum thimikarklayphnthuaebbediywkn aetlaklumepn variant clade hrux lineage aelakarepriybethiybladbyinkcathaihruthungwiwthnakarkhxngiwrsid sahrbiwrsokhwid 19 ngansuksathangwithyakarrabadthwolkidthxdladbyiniwrsekin 330 000 ladb aelw 9 SARS CoV 2 kalngwiwthnakarthaihtidtxidngaykhun thiednkkhuxsayphnthuxlfaaelaedltasungtidtxidngaykwaiwrsdngedimthiphbinxuhn 10 tarangtxipniaesdngkhxmulaelakhwamesiyngkhxngsayphnthuthiesiyngephimhruxxacesiyngephiminpccubn 11 12 13 14 15 16 17 18 chwngphisymikhwamechuxmnrxyla 95 ykewncarabutanghak ihsngektwaelkhehlaniepnkhapramanthnghmdephraakhxmulkarsuksamicakd radbkhwamesiyngodyepriybethiyb 19 sungmak sung panklang ta imchdecnkarrabu 20 karekid khwamepliynaeplngethiybkbsayphnthuthimimakxn n ewlaaelasthanthithiekidxngkhkarxnamyolk aephngok wbr A phiexchxi wbr B enkst setrn wbr C rabadkhrngaerk twxyangaerksud wbr 20 emuxrabuwanaepnhwng karklayphnthuthiedn kartidtxid karekha rph xtrakartay khwamaemnyakhxngkartrwc phumikhumknimihtidechuxidxik wbr D prasiththiskykhxngwkhsin wbr D prasiththiskykhxngsarphumitanthanaebbomonokhln wbr E 12 1 xlfa B 1 1 7 VOC 20DEC 01 wbr 20I V1 shrachxanackr 000000002020 09 20 0000 20 k y 2020 wbr 21 000000002020 12 18 0000 18 th kh 2020 wbr 22 69 70del N501Y P681H wbr 23 24 82 43 130 wbr F 52 47 57 wbr G 59 44 74 wbr G imepliyn wbr 14 ldlngnxy wbr 12 ldlngnxy wbr 12 imepliyn2 ebta B 1 351 VOC 20DEC 02 20H V2 aexfrikait 000000002020 05 01 0000 ph kh 2020 000000002021 01 14 0000 14 m kh 2021 wbr 27 K417N E484K N501Y wbr 23 52 46 58 wbr H kalngtrwcsxb xacephim wbr 14 30 imepliyn wbr 14 ldlngaetkartxbsnxngkhxngesllthitxiwrs D614G yngkhngprasiththiphaph wbr 12 30 ldprasiththiskywkhsinhlayxyang wbr I bangxyangyngkhngprasiththiskyxyu3 aekmma P 1 VOC 21JAN 02 20J V3 brasil 000000002020 11 01 0000 ph y 2020 000000002021 01 15 0000 15 m kh 2021 31 32 K417T E484K N501Y wbr 23 161 145 176 wbr K xacephim wbr 30 50 50 CrI 20 90 J M imepliyn 14 ldlng 12 hlaychnidyngkhngprasiththisky wbr N bangchnidyngkhngprasiththisky1 1 xlfa xlfabwkkb E484K 36 VOC 21FEB 02 20I V1 shrachxanackr 000000002021 01 26 0000 26 m kh 2021 37 000000002021 02 05 0000 5 k ph 2021 38 69 70del E484K N501Y P681H 23 24 82 43 130 wbr O F 52 47 57 O G 59 44 74 O G imepliyn wbr O ldlngxyangsakhy 39 ldlngxyangsakhy 39 bangxyangyngkhngprasiththisky wbr 39 5 expsilxn B 1 429 B 1 427 21C shrth 000000002020 03 01 0000 mi kh 2020 000000002021 03 17 0000 17 mi kh 2021 40 L452R 23 20 19 24 wbr P kalngtrwcsxb kalngtrwcsxb kalngtrwcsxb ldlngpanklang wbr Q ldlngpanklang wbr Q bangchnidldlngodyyngimsamarthkahndphlthiaenchd4 edlta B 1 617 2 VOC 21APR 02 wbr 21A xinediy 000000002020 10 01 0000 t kh 2020 000000002021 05 06 0000 6 ph kh 2021 44 L452R T478K P681R wbr 45 64 26 113 ethiybkbxlfa R 85 39 147 ethiybkbxlfa S kalngtrwcsxb immihlkthanwaepliyn wbr 30 ldlng 49 50 ldlngnxy 30 51 T bangchnidkhngprasiththisky 50 10 aekhppa B 1 617 1 VUI 21APR 01 21B xinediy 000000002020 10 01 0000 t kh 2020 L452R E484Q P681R wbr 52 kalngtrwcsxb kalngtrwcsxb kalngtrwcsxb kalngtrwcsxb ldlngelknxy wbr 49 ldlngelknxy wbr 49 xacldlng7 xita B 1 525 VUI 21FEB 03 21D incieriy 000000002020 12 11 0000 11 th kh 2020 53 54 E484K F888L wbr 56 kalngtrwcsxb kalngtrwcsxb kalngtrwcsxb kalngtrwcsxb xacldlng 12 xacldlng 12 xacldlngchux aekikhchuxtang khxng SARS CoV 2 57 sayphnthutamaephngok wbr A 58 hmayehtutamaephngok wbr 59 ekhldtamenkstsetrn wbr C wbr 60 2021 wbr 61 ekhldtamciesd wbr U sayphnthuedn A 1 A 6 19B S mi reference sequence epn WIV04 2019 62 B 3 B 7 B 9 B 10 B 13 B 16 19A LO V B 2 VB 1 B 1 5 B 1 72 20A G sayphnthu B 1 tamaephngok A rwmsayphnthuedlta B 1 617 45 B 1 9 B 1 13 B 1 22 B 1 26 B 1 37 GHB 1 3 B 1 66 20C rwm sayphnthuexpsilxn B 1 427 B 1 429 CAL 20C 63 aelaxita B 1 525 12 20G epnsayphnthhlkinshrthemux mkh 2021 63 20H rwmsayphnthuebta B 1 351hrux 20H 501Y V2 hrux 501 V2 B 1 1 20B GR rwmsayphnthu B 1 1 207 txngkarxangxing 20D20J rwmsayphnthuaekmma P 1 aelasita P 2 64 65 20F20I rwm sayphnthuxlfa B 1 1 7hrux VOC 202012 01 VOC 20DEC 01 hrux 20I 501Y V1 B 1 177 20E EU1 61 GV V epnsayxnuphnthukhxng 20A 61 yngimmikartngchuxiwrsokhwid 19 thiepnmatrthan 67 rthbalaelasuxkhawmkrabusayphnthuepnphasaphudodyichchuxpraethsthiphbsayphnthunn epnkhrngaerk 68 69 inplayeduxnphvsphakhmhlngcakthipruksaknepnewlahlayeduxn xngkhkarxnamyolkkprakaskarichxksrkrikepnchuxsayphnthusakhy ephuxihkhwamepnklangthangphumiphakhaelathangkaremuxng 70 71 aemiwrsokhwid 19 camisayphnthuepnphn 72 aetchnidyxytang ksamarthcdekhaepnklumechnepnechuxsay lineage hruxepnekhld clade W mikartngchux 3 xyanghlk thiichxyuodythwip khux 67 cnthungeduxnmkrakhm 2021 ciesd GISAID phueriykechuxiwrsdngedimkhux SARS CoV 2 wa hCoV 19 59 idrabuekhld 8 ekhldaelwthwolk khux S O L V G GH GR aela GV 73 inpi 2017 nkwichakaridprakasrabbkartngchuxenkstsetrn Nextstrain ephuxich tidtamwiwthnakarkhxngculchiphkxorkh tamewlacring 74 sungtxmaidichtittamechux SARS CoV 2 odycnthungeduxnmkrakhm 2021 idrabu 11 ekhldhlk aelw X khux 19A 19B aela 20A cnthung 20I 60 inpi 2020 nkwichakarcakokhrngkar Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages PANGOLIN okhrngkaraephngok sungaeplidwa karkahndechuxsayorkhrabadthwolkihmichuxtamwiwthnakarchatiphnthu 75 58 idesnxwithi kartngchuxaebbphlwtsahrbechuxsaytang khxng SARS CoV 2 sungihkhwamsakhykbechuxsayiwrsthikalngrabadaelakracayipyngphumiphakhihm 67 cnthungeduxnkumphaphnth 2021 miechuxsay 6 saythiidrabuaelwkhux A B B 1 B 1 1 B 1 177 aela B 1 1 7 7 76 xnung xngkhkarsatharnsukhkhxngchatitang yngxacichrabbkartngchuxkhxngtn ephuxtidtamsayphnthutang yktwxyangechn sankngansatharnsukhpraethsxngkvs Public Health England hruxphiexchxi idrabuiwrsthitidtamodypi eduxn aelahmayelkhinrupaebb YYYY MM NN sungmixksrnahnaepn VUI hrux VOC sungyxmacak variant under investigation rupaebbthikalngtrwcsxb aela variant of concern rupaebbthinaepnhwng 13 rabbnipccubnprbihxyuinrupaebb YY MMM NN odyswnthiepneduxncaichxksryx 3 tw 13 ladbyinxangxing aekikhinpccubnyngimruwaikhrepnphupwyrayaerksahrborkhokhwid 19 dngnn ladbyinthiichxangxinginngansuksahnung kcaeluxkexatamchxbic odymithangeluxkedn dngtxipni ladbcionm Wuhan 1 epnladbthiekbidaerksudemuxwnthi 24 thnwakhm 2019 5 klumnkwicyxikklumhnung 5 ichladbcionmxangxingkhxng National Center for Biotechnology Information NCBI sungmirhs GenBankID NC 045512 GISAID ID EPI ISL 402125 77 epntwxyangthiekbidemuxwnthi 26 thnwakhm 2019 78 thungaemklumnikyngichcionmxangxingkhux WIV04 khxngciesd ID EPI ISL 402124 79 innganwiekhraahtang dwy 80 tamaehlngxangxingaehnghnung 62 WIV04 2019 sungxyuinekhld S tamciesd echuxsay A tamaephngok ekhld 19B tamenkstsetrn epnladbyinthiechuxwaiklmakthisudkbladbyinkhxngiwrsdngedimthimnusytidaelaeriykwa ladbsuny sequence zero 62 odyidtwxyanginwnthi 30 thnwakhm 2019 cakkhnikhthimixakar epnladbthiichxangxingknmakthisud odyechphaainbrrdaxngkhkrthithanganrwmkbciesd 81 62 eknthkhwamepnsayphnthuoddedn aekikhiwrspktimkcaklayphnthuemuxewlaphanip ekidepnrupaepr variant hruxsayphnthuihm sungxacrabadipinklumprachakr aelwephimpyhatang dngtxipni 82 83 tidtxidngaykhun kxxakarhnkkhun ephimxtrakartay chudtrwcechuxtrwcimid erimduxyataniwrs iwtxaexntibxdithithalayvththi neutralizing antibody nxylngimwacaepnaexntibxdithiphbineluxd thiichchid khuxaexntibxdiaebbomonokhln hruxthitrwchainkarthdlxng samarthhlbphumitanthanthimixyuodythrrmchatiid khux thaihtidechuxxikid samarththaihkhnchidwkhsinaelwtidechuxid ephimkhwamesiyngphawaorkhtang echn karxkesbinxwywahlaybb hruxxakarokhwidrayayaw long COVID ephimkartidorkhinprachakrbangklum echn edkhruxphumiphumikhumknxxnaex sayphnthuthiphaneknthmakkwahnungehlanixacrabuwa sayphnthuthikalngtrwcsxb variants under investigation hruxsayphnthuthinasnic variants of interest odyyngtxngtrwcsxbwaephimpyhatang ehlanihruxim lksnahlkkhxngsayphnthuthinasnickkhuxmihlkthanwamnepnehtuihekidorkhinxtrasungkhunhruxepnehtukhxngkhlsetxrorkh aetkyngcakdimthungkbaephripinradbchati imngnaelwkcatxngykradbkhunepnsayphnthuthinaepnhwng variant of concern 13 84 thamihlkthanchdaelwwa karpxngknhruxkarrksakartidechuxcaksayphnthunn miprasiththiphaphldlngxyangsakhy kcacdwa sayphnthuthimiphlhnk variant of high consequence 12 sayphnthuthinaepnhwng xngkhkarxnamyolk aekikhsayphnthuinhwkhxnicdepnsayphnthuthinaepnhwng Variants of Concern VOC tamxngkhkarxnamyolk 11 ihsngektwa xngkhkrtang echn sunykhwbkhumaelapxngknorkhshrthxacmiraykarthitangknbang 12 xlfa B 1 1 7 aekikh dubthkhwamhlkthi iwrs SARS CoV 2 sayphnthuaexlfa phaphsiplxmsungthaydwyklxngculthrrsnxielktrxnchnidsxngphan TEM khxngiwrsokhornasayphnthu B 1 1 7 dkarephimkartidtxkhxngsayphnthuechuxwa macakokhrngsrangoprtinhnam spike protein thiepliynip sunginphaphaesdngepnsiekhiyw sayphnthuxlfa B 1 1 7 85 idtrwcphbkhrngaerkemuxeduxntulakhminshrachxanackrcaktwxyangthiideduxnkxninmnthlekhnt 86 cdepnsayphnthuaerkthirabuwakalngtrwcsxberimineduxnthnwakhm 2020 VUI 202012 01 87 aelwtxmaeluxnepnsayphnthuthinaepnhwng VOC 202012 01 13 michuxeriykxunwa 20I 501Y V1 edimwa 20B 501Y V1 88 89 82 tngaetnn khakhwamchukorkhaebb prevalence odds kephimepnthwikhunthuk 6 5 wn sungechuxwaepnrayaewlathiorkhtidtxruntxrun generational interval 90 91 mnmishsmphnthkbxtrakartidorkhokhwidihminshrachxanackxyangsakhy odyswnhnungkbkarklayphnthuaebb N501Y dwy 92 mihlkthanbangwa sayphnthunitidngaykhunrxyla 40 80 khapraemintang odymakcaxyuthangdanmak 93 aelanganwiekhraahaerk krabuwa thaihthungtayephimkhun 94 95 aetnganerw niklbimphbhlkthanwathaihorkhrunaerngyingkhun 96 cnthungeduxnphvsphakhm 2021 sayphnthuxlfaidtrwcphbinpraethskwa 120 praeths aelw 97 B 1 1 7 bwkkbkarklayphnthu E484K aekikh sayphnthuthinaepnhwngkhux Variant of Concern 21FEB 02 ekhyekhiynwa VOC 202102 02 thikrathrwngsatharnsukhxngkvsxthibaywa epnsayphnthu B 1 1 7 bwkkbkarklayphnthu E484K 13 cnthungwnthi 17 minakhm 2021 mikrnikhnikhthiyunynaelw 39 krni inshrachxanackr 13 inwnthi 4 minakhm 2021 nkwithyasastridphbsayphnthuniinrthxxrikxnkhxngshrth odyphbintwxyanghnungin 13 twxyang thiwiekhraah aetduehmuxncaekidkhunexnginphunthi khuximidnaekhacakpraethsxun 98 99 100 chuxxun sahrbsayphnthunirwmthng B 1 1 7 E484K 101 aela B 1 1 7 Lineage with S E484K 102 ebta B 1 351 aekikh inwnthi 18 thnwakhm 2020 sayphnthuebta hrux 501 V2 hrux 20H 501Y V2 kxnhnani 20C 501Y V2 hrux VOC 20DEC 02 kxnhnani VOC 202012 02 hrux B 1 351 82 idphbinaexfrikaitepnkhrngaerk 103 nkwicyaelaecahnathiraynganwa ethiybkbsayphnthuxun khwamchuksayphnthunisungkwainbrrdakhnxayunxythisukhphaphdi aelathaihmixakarhnkkwa 104 105 krathrwngsatharnsukhaexfrikaityngrabudwywa sayphnthunixacepntwkhbkarrabadthwrxbsxnginpraethsephraatidtxkniderwkwasayphnthukxn 103 104 nkwithyasastrihkhxsngektwa sayphnthunicbkbesllmnusyiddikwaephraaiklokhoprtinhnam spike glycoprotein khxngiwrsmikarklayphnthu 3 xyangin receptor binding domain RBD rwmthng N501Y 103 106 K417N aela E484K 107 108 aekmma P 1 aekikh phiexchxirabusayphnthuaekmm P 1 wanaepnhwngodytngchuxwa VOC 21JAN 02 13 edim VOC 202101 02 13 swnenkstsetrn C tngchuxmnwa 20J 501Y V3 12 hrux 20J V3 20 hrux 501Y V3 39 sthabnorkhtidtxaehngchatiyipun NIID trwcphbmnepnkhrngaerkinnkhrotekiywinwnthi 6 mkrakhm 2021 cakphuedinthangmacakrthxamaosns brasil 4 khn 109 inwnthi 12 mkrakhm 2021 suny Brazil UK CADDE Centre inbrasilyunynwa misayphnthu P 1 inphunthithiphbinpadibchunaexmasxn 110 sayphnthunitngchuxwa P 1 aemcamibrrphburusepn B 1 1 28 aetephraatngepn B 1 1 28 1 imid tamkdrabbkartngchux cungtngepnchuxni mnmikrdxamionthiepliynipodyechphaa 17 xyangody 10 xyangxyuinoprtinhnam rwmthngkarklayphnthuthinaepnhwngkhux N501Y E484K aela K417T 110 111 112 113 Figure 5ephraakarklayphnthu N501Y aela E484K mkkx RBD hACE2 complex thiesthiyr dngnncungephimsmphrrkhphaphkarcbkhxng RBD ekhakb hACE2 aetinnytrngkham karklayphnthu K417T mkimkxkarcbknrahwang RBD kb hACE2 odyidphisucnaelwwa ldsmphrrkhphaphkarcbkhxng RBD kb hACE2 1 sayphnthuniimphbinemuxngmaenas rthxamaosns rahwangeduxnminakhm phvscikayn 2020 aetphbintwxyangrxyla 42 rahwangwnthi 15 23 thkh rxyla 52 2 rahwang 15 31 thkh aelarxyla 85 4 rahwang 1 9 mkrakhm 2021 110 ngansuksahnungphbwa kartidechux P 1 xacsrangcanwniwrsekuxb 10 ethaethiybkbsayphnthubrasilxun khux B 1 1 28 hrux B 1 195 odytidtxidngaykwa 2 2 etha tididthngphuihyaelakhnchra sungaesdngwa thaihmnusythixayunxykwatididmakkwaimwacaepnephsihn 114 ngansuksatwxyangthiidcakemuxngmaenasrahwangeduxn phy 2020 mkh 2021 aesdngwa sayphnthu P 1 tidtxidngaykwang 1 4 2 2 etha aelaphbwahlbhlikphumikhumknthiekidcakkartidorkhiwrsokhornakxn idrxyla 25 61 thaihmioxkastidechuxxikaemhlngtidorkhokhwidmakxnaelw P 1 yngthaihthungtayephimkhunrxyla 10 80 115 116 34 ngansuksahnungphbwa khnthiidwkhsinkhxngifesxraelakhxngomedxrnaxyangsmburnaelw camiaexntibxdithikacdvththikhxng P 1 idldlng aemphltxkardaeninkhxngorkhcayngimchdecn 117 khxmulebuxngtncakngansuksasxngnganrabuwa wkhsinkhxngaexstraesenkayngmiprasiththiphltxsayphnthu P 1 aemradbprasiththiskythiaennxncayngimidtiphimph 118 119 ngansuksainbrasil khxng Oswaldo Cruz Foundation thiyngimidthbthwnodyphuruesmxknintneduxnemsayn 2021 phbwa insthankarncring wkhsinkhxngsionaewkhodsaerkmiprasiththiskypramanrxyla 50 odykhadwa casungkhunemuxidodsthisxng ngansuksaniyngdaeninipxyu 120 swnkhxmulebuxngtncakngansuksathisthabnwicybrasilkhux Instituto Butantan epnphudaeninkaraesdngnywa wkhsinkhxngsionaewkhmiprasiththiphltxtansayphnthuniechnkn odysthabncakhyaynganephuxihidkhxmulthiaennxn 121 edlta B 1 617 2 aekikh dubthkhwamhlkthi iwrs SARS CoV 2 sayphnthuedlta sayphnthuedlta hrux B 1 617 2 hrux G 452R V3 hrux 21A 20 hrux 21A S 478K 30 idphbkhrngaerkinxinediyemuxeduxntulakhm 2020 aethlngcaknnkidkracayipyngpraethsxun aelw epnsayphnthulukhlankhxng B 1 617 echnediywkbsayphnthuaekhppathikalngtrwcsxb 122 123 124 125 126 inwnthi 6 phvsphakhm 2021 nkwithyasastrxngkvsidprakassayphnthuni sungmicudednkhux immikarklayphnthu E484Q waepnsayphnthuthinaepnhwngodykahndrhsepn VOC 21APR 02 hlngcakthiphbhlkthanwamnkracayipiderwkwaiwrsdngedimaelaxackracayiderwethasayphnthuxlfa 127 128 129 mnmikarklayphnthu L452R T478K aela P681R 45 aetkimehmuxnkbsayphnthuaekhppaephraaimmikarklayphnthu E484Qinwnthi 3 mithunayn 2021 phiexchxiraynganwa karesiychiwit 12 raycak 42 rayenuxngkbsayphnthuedltainxngkvsepnkhnidrbwkhsinxyangsmburnaelw aelaechuxyngkracayiderwkwasayphnthuxlfaepnsxngethaxikdwy 46 inwnthi 11 miy sunykaraephthyinaekhnadaaehnghnungidraynganwa inbrrdakhnikh 22 raythitidechuxsayphnthuedlta khrunghnungepnphuidwkhsinxyangsmburnaelw 130 ineduxnmithunayn 2021 miraynganwamirupaeprkhxngsayphnthuedltabwkkbkarklayphnthu K417N odyeriykknepnphasaphudwa sayphnthuenpal 131 karklayphnthunisungkphbinsayphnthuebtadwyxac ldprasiththiphaphkhxngwkhsinaelakarrksadwyaexntibxdi odyyngxacephimkhwamesiyngkartidorkhsaxikdwy 132 phiexchxieriyksayphnthuniwa edltabwkkb K417N swnaephngokcdsayphnthuihxyuinekhld 2 ekhldkhux AY 1 aela AY 2 46 133 odyyngmichuxelnwa edltaphls dwy 134 sungyxmacak edltaphls K417N 135 inwnthi 22 mithunayn xinediyrabusayphnthuedltaphlswaepnsayphnthunaepnhwngephraaphbkrni 22 krni inxinediy 136 aetphuechiywchaythangwithyakarrabadkklawwa yngimmikhxmulephiyngphxthicasnbsnunihichchuxtanghakephraakarsuksaidthakbkhnikhephiyngcanwnnxy 137 sayphnthuthinasnic xngkhkarxnamyolk aekikhsayphnthuinhwkhxnicdepnsayphnthuthinasnic Variants of Interest VOI tamxngkhkarxnamyolk 11 ihsngektwa xngkhkrtang echn sunykhwbkhumaelapxngknorkhshrthxacmiraykarthitangknbang yktwxyangechn shrthyksayphnthuexpsilxnwaepnsayphnthuthinaepnhwng imichaekhnasnic 12 expsilxn B 1 429 CAL 20C aekikh sayphnthuexpsilxn hrux B 1 429 hrux CAL 20C 138 hrux CA VUI1 139 hrux 21C 20 hrux 20C S 452R 30 mikarklayphnthuphiess 5 xyang khux I4205V D1183Y inyin ORF1ab aela S13I W152C L452R inoprtinexskhxngoprtinhnam odykarklayphnthuaebb L452R sungkphbinsayphnthuxun thiimekiywkndwy epntwnaepnhwngepnphiess 63 140 B 1 429 xactidtxngaykwa aetktxngsuksayingkhunephuxyunyn 140 sunykhwbkhumaelapxngknorkhshrthkahndsayphnthu B 1 429 aela B 1 427 thismphnthknwaepn sayphnthuthinaepnhwng odyxangxingngansuksathiyngimidthbthwnodyphuruesmxknwa ephimkartidtxorkhidthungrxyla 20 miphltxphumikhumknchnidkacdechuxinbangkhn aetimthukkhn erimduxyathiidxnumtiihichrksahruxpxngknokhwid ldkarkacdvththikhxngechuxinphlasmatamthiekbcakkhnhaypwyhruxchidwkhsin 141 142 ineduxnkrkdakhm 2020 nkwicyinrthaekhlifxreniy shrth idtrwcphb B 1 429 epnkhrngaerkintwxyangthiidcakmnthllxsaexneclis 143 aelwkimphbxikcneduxnknyayncaktwxyangthiidcakrthaekhlifxreniy aetcanwnthiphbktamakcnthungeduxnphvscikayn 144 145 sungerimphbintwxyangrxyla 36 cnthungeduxnmkrakhm 2021 kphbsayphnthuniintwxyangrxyla 50 aelw 140 hlngcakephimkhuninebuxngtn xtrakartidechuxsayphnthunikldlngtngaeteduxnkumphaphnth 2021 ephraasusayphnthuxlfaimid cnthungeduxnemsayn sayphnthunikyngekidkhunkhxkhangbxyinaekhlifxreniyphakhehnuxbangswn aetksabsuyipelyinaekhlifxreniyit odyimidekidinphumiphakhxun xyangsmaesmx kartidechuxrxyla 3 2 inshrthmiehtucaksayphnthuni ethiybkb 2 3 thimiehtucaksayphnthuxlfa 42 sita P 2 aekikh sayphnthusita P 2 sungepnsayphnthulukhlankhxng B 1 1 28 echnediywknkbsayphnthuaekmma P 1 idphbwakalngrabadxyukhrngaerkinrthrioxedcaenor mikarklayphnthu E484K aetimmi N501Y aela K417T 113 epnsayphnthuthiwiwthnakarkhuntanghakodyimidekiywkbsayphnthuaekmmacakemuxngmaenasodytrng 110 146 inkarcdchuxkhxngxngkhxngkhkarxnamyolk sayphnthunieriykwa sita cdepnsayphnthuthinasnic VOI aetyngimnaepnhwng 11 xita B 1 525 aekikh sayphnthuxita B 1 525 hrux VUI 21FEB 03 13 kxnhnani VUI 202102 03 hrux UK1188 13 21D 20 hrux 20A S 484K 30 immikarklayphnthu N501Y ehmuxnkbsayphnthu xlfa hruxebta hruxaekmma aetmikarklayphnthu E484K ehmuxnkbthiphbinsayphnthuebta aekmma aelasita mikarlbyinxxkaebb DH69 DV70 khuxkarlbkrdxamion histidine aela valine thitaaehnng 69 aela 70 dngthiphbinsayphnthuxlfa sayphnthuthimikarklayphnthu N439K B 1 141 aela B 1 258 aelasayphnthuthimikarklayphnthu Y453F khux khlsetxr 5 147 sayphnthunitangkbsayphnthuxun thnghmdkephraamithngkarklayphnthu E484K aela F888L khuxkaraethnthi phenylalanine F dwy leucine L in S2 domain khxngoprtinhnam cnthungtneduxnminakhm phbsayphnthuniaelwinpraeths 23 praeths rwmthngshrachxanackr ednmark finaelnd nxrewy enethxraelnd ebleyiym frngess sepn incieriy kana cxraedn yipun singkhopr xxsetreliy aekhnada eyxrmni xitali solwieniy xxsetriy maelesiy switesxraelnd ixraelnd aelashrth 148 149 150 55 151 152 153 aelayngphbinaekhwncnghwdophnthaelkhxngfrngesskhux mayxt xikdwy 148 krniaerk phbineduxnthnwakhm 2020 inshrachxanackraelaincieriy aelacnthungwnthi 15 kumphaphnthkepnsayphnthuthiphbmaksudinincieriy 55 cnthungwnthi 24 kumphaphnth idphbkrnikhntidsayphnthuni 56 khninshrachxanackr 13 ednmarkepnpraethsthithxdladbyinkhxngkrniokhwidthnghmd aelaidphbsayphnthuni 113 krni rahwangwnthi 14 mkh 21 kph odymi 7 krni thiekiywkbkaredinthangipyngpraethsincieriy 149 phuechiywchayinshrachxanackrkalngsuksaephuxihchdecnwamnesiyngaekhihn cnthungwnthi 16 kumphaphnth sayphnthuyngcdwa kalngtrwcsxb VUI aetxacprbepnsayphnthuthinaepnhwng VOC emuxidkhxmulephim nkculchiwwithyathimhawithyalyekhmbridcrabuwa sayphnthuniduehmuxncamikarklayphnthusakhy ehmuxnkbthiehninsayphnthuihm bangchnid sungxacthaihphyakrnphlkrathbkhxngkarklayphnthuidngaykwa 154 thita P 3 aekikh inwnthi 18 kumphaphnth 2021 krathrwngsatharnsukhfilippinsidtrwcphbkarklayphnthu 2 chnidinekhtkitnangkhabisayaxn sungtxmatngchuxepn E484K aela N501Y aelatrwcphbintwxyang 37 twxyangcak 50 twxyang odymikarklayphnthuthngsxngintwxyang 29 twxyang sayphnthutang ehlaniyngimidthxdladbyinthnghmd 155 inwnthi 13 minakhm krathrwngsatharnsukhfilippinsidyunynkarklayphnthutang thimixyuinsayphnthusungtngchuxwa P 3 156 odyxngkhkarxnamyolktxmaihchuxmnwa thita inwnediywkn kyunynwaphbsayphnthuaekmma P 1 epntwxyangaerkinpraeths aemsayphnthu P 1 aela P 3 casubthxdmacakbrrphburusediywkn khux B 1 1 28 aetkrathrwngkklawwa phlkhxng P 3 txprasiththiskykhxngwkhsinaelakartidtxkhxngorkhyngimchdecn cnthungwnthi 13 minakhm filippinsmikrnikhntidechuxniaelw 98 ray 157 inwnthi 12 minakhm yipunkphbwamikhntidechuxniaelwehmuxnkn 158 159 inwnthi 17 minakhm shrachxanackrkidyunynwaekidkhntidechux 2 khnaerkaelw 160 sungphiexchxikahndsayphnthuepn VUI 21MAR 02 13 inwnthi 30 emsayn 2021 maelesiytrwcphbkartidechuxni 8 rayinrthsarawk 161 ixoxta B 1 526 aekikh ineduxnphvscikayn 2020 nkhrniwyxrkphbsayphnthuklayphnthuihmsungeriykwa B 1 526 162 cnthungwnthi 11 emsayn 2021 echuxidphbaelwinmlrth 48 rthinshrthaelainpraethsxun xikthung 18 praeths aetkehmuxnkbsayphnthuexpsilxnthiphbinaekhlifxreniy khuxsayphnthunithungaemcaephimkhuncnthungradbhnunginmlrthbangrth aetinvduibimphlikhxngpi 2021 sayphnthu xlfa kidekidmakkwaaelw 42 xngkhkarxnamyolkeriyksayphnthuniwa ixoxta aekhppa B 1 617 1 aekikh sayphnthuaekhppa 163 epnsayphnthulukhlankhxng B 1 617 sayphnthuhnunginbrrda 3 sayphnthu yngmichuxxunxikwa B 1 617 1 21B 20 aela 21A S 154K 30 idphbepnkhrngaerkinxinediyemuxeduxnthnwakhm 2020 164 n playeduxnminakhm 2021 sayphnthunikmicanwnekinkhrungcakladbyinthixinediyidsngbnthukaelw 165 n tneduxnemsayn phiexchxikrabuechuxwaepnsayphnthuthikalngtrwcsxb VUI 21APR 01 166 aelmbda C 37 aekikh sayphnthuaelmbda hrux C 37 idphbkhrngaerkineduxnsinghakhm 2020 inpraethsepru xngkhkarxnamyolkidkahndepnsayphnthuthinasnicemuxwnthi 14 mithunayn 2021 167 sayphnthuednxun aekikhB 1 1 207 aekikh sayphnthu B 1 1 207 idthxdladbyinepnkhrngaerkineduxnsinghakhm 2020 inpraethsincieriy 168 kartidtxidaelakhwamrunaerngkhxngechuxyngimchdecn aetepnsayphnthuthicdwakalngekidihm emerging odysunykhwbkhumaelapxngknorkhshrth 82 sayphnthunimikarklayphnthu P681H ehmuxnkbsayphnthuxlfa aetkimmikarklayphnthuxun thiehmuxnkbxlfa aelacnthungplayeduxnthnwakhm 2020 karthxdladbyinthnghmdinincieriykphbsayphnthuniinxtrarxyla 1 168 n eduxnphvsphakhm 2021 sayphnthuniidphbinpraeths 10 praeths aelw 169 B 1 1 317 aekikh aemsayphnthu B 1 1 317 cayngimcdwanaepnhwng variant of concern aetkrathrwngsatharnsukhxngrthkhwinsaelnd xxsetreliy kbngkhbihkhnikhsxngkhninhxsphiethlemuxngbrisebnihxyukktwephimkhun 5 wnodybwkkbxik 14 wntampkti 170 B 1 1 318 aekikh emuxwnthi 24 kumphaphnth 2021 phiexchxikahndsayphnthu B 1 1 318 ihepnsayphnthuthikalngtrwcsxbkhux VUI 21FEB 04 kxnhnaniepn VUI 202102 04 13 cnthungwnthi 4 minakhm 2021 phbkhnikhthitidechuxni 16 khnaelwinshrachxanackr 13 171 B 1 618 aekikh sayphnthuniphbepnkhrngaerkemuxeduxntulakhm 2020 mikarklayphnthu E484K sungehmuxnkbsayphnthuhlayxyangxun kalngkhyayphnthuxyangrwderwinrthebngkxltawntk xinediy 172 173 cnthungwnthi 23 emsayn 2021 thankhxmul CoV Lineages aesdngkarthxdladbyintwxyangsayphnthuni 135 khrnginxinediy odypraethsxun xik 8 praethsthwolkthxdladbyintwxyangimthung 10 khrng 174 B 1 620 aekikh ineduxnminakhm 2021 praethslithweniyidtrwcphbsayphnthu B 1 620 epnkhrngaerk txngkarxangxing epnsayphnthuthiphbthnginaexfrikaklangaelaxemrikaehnux 175 nxkehnuxcaklithweniy praethsyuorpxun rwmthngsepnaelaebleyiymkphbsayphnthunidwy txngkarxangxing sayphnthunimikarklayphnthuaelakarlbyinrwm 23 taaehnng ethiybkbsayphnthudngedim odybangxyangimmiinsayphnthuxun karklayphnthuthimirwm E484K 175 176 D614G sungkphbinsayphnthuthikalngkracayipxun dwy 177 m P681H aela S477N 175 kartidtxorkhkhamspichis aekikhkhlsetxr 5 aekikh intneduxnphvscikayn 2020 ednmarkidphbsayphnthuechuxthieriykwa khlsetxr 5 hruxeriykwa DFVI spike odysthabnesrumaehngchatiednmark Statens Serum Institut exsexsix 178 sayphnthuidphbinekhtnxrethxrnctaelnd khxngpraeths odyechuxwamnusytidmacaktwmingkhinfarmtwmingkh inwnthi 4 eduxnediywkn rthcungprakaswacakhatwmingkhinfarmephuxpxngknknimihechuxkracayaelwesiyngekidsayphnthuihm ephimkhunxik aelaprakaskarlxkdawnekhtethsbal 7 ekhtinnxrethxrnctaelnd ephuximihkarrabadthwinpraethshruxkhxngolkaeylng cnthungwnthi 5 eduxnediywkn idphbkrniphutidorkhenuxngkbtwmingkh 214 krni 179 xngkhkarxnamyolkrabuwa khlsetxr 5 ldkartxbsnxngtxaexntibxdithithalayvththixyangphxkhwr 180 swnexsexsixetuxnwa karklayphnthunixacldvththikhxngwkhsinthikalngphthna aemcaimthaihirphlodysineching hlngcakthilxkdawnaelwtrwckhnepncanwnmak exsexsixprakasinwnthi 19 phvscikaynwa khlsetxr 5 nacasuyphnthuipaelw 181 txmawnthi 1 kumphaphnth 2021 nkwichakarthiexsexsixcungidtiphimphinwarsarthithbthwnodyphuruesmxknodyrabuwa pccubnimphbwakhlsetxr 5 yngkracaytwxyuinhmumnusy 182 mikhwamesiyngwa echuxokhwid 19 samarthtidtxcakmnusyipyngstwaelwrwmekhakbiwrspracatwstwodyklayepnsayphnthuihm sungepnxntraytxmnusy 183 karklayphnthuaebbmisesns missense edn aekikhN440K aekikh karklayphnthuchnid N440K hmaythungkarepliynkrdxamionaexspharacin N dwyilsin K thitaaehnng 440 184 inthiephaaesll karklayphnthuchnidnithaihechuxokhwid 19 tidtxidmakkwaepn 10 ethaethiybkbsayphnthu A2a thimikarklayphnthuaebb A97V in RdRP thiekhykracayipxyangkwang aelaepn 1 000 ethaethiybkbsayphnthu A3i mikarklayphnthuaebb D614G inoprtinhnam aelakaraethnthiaebb P323L in RdRP thikracayipnxykwa 185 epnkarklayphnthuthimiswnkbkarrabadephimkhunxyangrwderwinxinediy 186 odyepnpraethsthimikhntidechuxklayphnthuchnid N440K inxtrasungsudtamdwyshrthaelaeyxrmni 187 L452R aekikh karklayphnthu L452R hmaythungkaraethnthikrdxamionliwsin L dwyxarcinin R thiyintaaehnng 452 184 karrabadkhxngokhwididephimkhunthwxinediyxyangsakhyeriminpi 2021 odyswnhnungkephraasayphnthu B 1 617 sayphnthubrrphburuskhxngedlta sungbangkhrngeriykphid waepnsayphnthuthimikarklayphnthu 2 xyang L452R epnkarklayphnthusakhyinsayphnthuni ephraathaihihiwrscbtwkbhnwyrb ACE2 receptor khxngesllmnusyiddikhunaelaxacthaihaexntibxdithiepnphlkhxngwkhsincbkboprtinhnamthiepliynipniidnxylngngansuksabangnganphbwa L452R xacthaihiwrsokhornaduxtxaemkrathngesllthi T cell id sungepnesllcaepninkarsubhaaelwthalayesllthitidechuxiwrs odyniepnkhnlaxyangkbaexntibxdithithalayvththikhxngxnuphakhiwrsokhornaaelapxngknimihmnkhyayphnthutxipid 123 S477G N aekikh ngansuksathiichwithikarthangchiwsarsnethssastraelathangsthitisastrhlaynganphbwa iwrsokhwid 19 miyin receptor binding domain RBD thiphlikepliynidngayrahwangersidiw 475 485 odymhawithyalyinxxsetriy University of Graz 188 aelabristhethkhonolyichiwphaphxxsetriy Innophore 189 phbwa odyokhrngsrang taaehnng S477 samarthphlikepliynidngaythisud 190 cnthungpccubn taaehnng S477 thi RBD cring kepntaaehnngthiersidiwkrdxamionepliynipmakthisudinechuxokhwid 19 thiklayphnthu ngansuksathicalxnglksnathangphlwtkhxng RBD emuxekhaechuxmkb hACE2 phbwa karepliynkrdxamionthngchnid S477G aela S477N lwnthaihoprtinhnamkhxngiwrscbkbhnwyrb hACE2 idaennkhun ineduxnkumphaphnth 2021 bristhphthnawkhsineyxrmnkhuxibxxnethkh 191 rabukarepliynaeplngthangkrdxamionechnniwasakhysahrbkarphthnawkhsinruntxipinxnakht 192 E484K aekikh karklayphnthu E484K hmaythungkaraethnkrdklutaemt E dwyilsin K thiyintaaehnng 484 184 odymichuxelnwa xik Eeek 193 E484K idraynganwaepnkarklayphnthuthihlbhlikrabbphumikhumknid 194 195 khuxphbwahlbaexntibxdiaebbomonokhln monoclonal antibody thisrangkhunnxkkay xyangnxychnidhnungid sungxacaesdngwa mikhwamepliynaeplngthang antigenicity Y khuxmiptikiriyakbrabbphumikhumknaebbcaephaathiepliynip 196 sayphnthuebta 196 sayphnthuaekmma P 1 110 aelasayphnthusita P 2 113 mikarklayphnthuechnni odyyngphbsayphnthuxlfabwkkbkarklayphnthu E484K xikdwy 197 aexntibxdithngaebbomonokhlnaelathiidcakeluxdphbwa miprasiththiphaphkacdiwrsthimikarklayphnthu E484K idldlng 10 60 etha 198 199 inwnthi 2 kumphaphnth 2021 nkwithyasastrthangkaraephthykhxngshrachxanackrphbkarklayphnthu E484K intwxyang 11 twxyangcak 214 000 twxyang sungxacldprasiththiphaphkhxngwkhsinthiichxyuinpccubn 200 201 E484Q aekikh karklayphnthu E484Q hmaythungkaraethnkrdklutaemt E dwyklutamin Q thiyintaaehnng 484 184 E484Q xacthaihiwrscbkbhnwyrb ACE2 khxngesllmnusyiddikhun aelaxacthaihaexntibxdithiwkhsinchwykratuncbkboprtinhnamthiepliynipniidnxylng 123 orkhokhwid 19 idephimrabadmakkhuninxinediyeriminpi 2021 odyswnhnungkephraasayphnthu B 1 617 sayphnthubrrphburuskhxngedlta sayphnthunimkeriykphid wa mikarklayphnthu 2 chnid double mutant 202 N501Y aekikh karklayphnthu N501Y hmaythungkarepliynkrdxamion asparagine N epnithorsin Y thitaaehnng 501 203 odymichuxelnwa enlli 193 phiexchxiechuxwa karklayphnthunithaihiwrscbkbhnwyrbkhxngesllmnusyiddikhun ephraataaehnngkarklayphnthuxyuthi receptor binding domain RBD khxngoprtinhnamthicbkb ACE2 khxngesllmnusy odykphbkhxmulthisnbsnunsmmtithannidwy 24 aebbcalxngkarptismphnth inradbomelkulaelakarkhanwnkha free energy of binding aesdngwa karklayphnthunithaih RBD mismphkhphaphkarcbkbhnwyrbkhxngesll khux hACE2 sungsudinbrrdasayphnthuthinaepnhwng 1 sayphnthuthimikarklayphnthunirwmthngaekmma 196 110 xlfa VOC 20DEC 01 ebta aela COH 20G 501Y okhlmbs rthoxihox 1 sayphnthusudthayniidklayepnechuxchnidhlkinemuxngokhlmbsemuxplayeduxnthnwakhm 2020 aelaeduxnmkrakhm odyduehmuxncawiwthnakarkhuntanghakkbsayphnthuxun 204 205 D614G aekikh khwamchukechinglxkarithumkhxngkarklayphnthu D614G inpi 2020 tamkhxmulladbyinthibnthukiwinthankhxmulciesd 206 D614G epnkarklayphnthuaebbmisesns missense mutation thioprtinhnamkhxngiwrsokhwid 19 tngaeterimphbincinphakhtawnxxk khwamchukkhxngkarklayphnthunikidephimkhunthwolkinchwngkarrabadthw krdxamioniklsin G idaethnthikrdaexspartik D thitaaehnng 614 inpraethstang makmayodyechphaainyuorp aetkekidchakwaincinaelaexechiytawnxxkthiehlux sungsnbsnunsmmtithanwa G ephimxtrakartidtx aelaekhakbkarmiiwrs viral titer thiekhmkhnkwaaelakartidtxthisungkwainhlxdthdlxng in vitro 62 nkwicythiokhrngkaraephngoktngchuxelnihaekkarklayphnthuniwa dk Doug 193 ineduxnkrkdakhm 2020 miraynganwa sayphnthuorkhthimikarklayphnthu D614G aelatidtxidngaykwa idklaymaepnsayphnthuhlkaelw 207 208 209 210 phiexchxiyunynwa karklayphnthunimi phlpanklangtxkartidtxkhxngorkh odykalngtidtamduxyuthwolk 203 khwamchukkhxng D614G mishsmphnthkbphawaesiykarruklin anosmia thiepnxakarkhxngokhwid sungxacekidcak RBD thicbkbhnwyrb ACE2 iddikhun hruxekidcakkarsrangoprtinthiesthiyrkwa thaiheyuxbuphiwrbklin olfactory epithelium inchxngcmuktidechuxmakkwa 211 sayphnthuthimikarklayphnthu D614G rwmekhld G khxngciesd 62 aelaekhld B 1 khxngaephngok rwmthngxlfa ebta aelaedlta 62 P681H aekikh khwamchukechinglxkarithumkhxngkarklayphnthuaebb P681H inpi 2020 tamkhxmulladbyinthiidbnthukinthankhxmulciesd 206 ineduxnmkrakhm 2021 mikartiphimphraynganthiyngimidthbthwnodyphuruesmxknwa lksnaphiesskhxngsayphnthuxlfa aela B 1 1 207 phbkhrngaerkinincieriy khuxkarklayphnthu P681H kalngephimsdswnxyangepnelkhchikalngthwolk echnediywkbthiekidkbklayphnthu D614G thiaephrhlayipthwolkaelw 212 206 P681R aekikh karklayphnthu P681R hmaythungkarepliynkrdxamion proline P dwyxarcinin R thiyintaaehnng 681 184 phbwa sayphnthu B 1 617 thiepnbrrphburuskhxngedlta mikarklayphnthu P681R thisakhynxkehnuxipcak E484Q aela L452R karklayphnthuthinaepnhwngthngsamxyangnixyuthioprtinhnam sungepnswnsakhythiiwrsokhornaichcbkbhnwyrbkhxngesllmnusy 123 A701V aekikh tamraynganebuxngtnkhxngsux krathrwngsatharnsukhmaelesiyidprakasinwnthi 23 thnwakhm 2020 waidphbkarklayphnthuincionmkhxngiwrsokhwid 19 sungrabuwa A701B tamthiphimph sungimthuk inbrrdatwxyang 60 twxyang thiidmacakkhlsetxrinrthsabah odyrabuwakhlaykbthiephingphbinchwngnninaexfrikait xxsetreliy aelaenethxraelnd aemcayngimchdecnwatidtxidmakkhunhruxmiphltxkardaeninkhxngorkhhruxim 213 aetrthbalcnghwdsulukhxngfilippinssungxyuikl knkidrangbkaredinthangipyngsabahephraakhwamimchdecnkhxngsayphnthuni 214 inwnthi 25 thnwakhm xngkhkrsatharnsukhkhxngrth Kementerian Kesihatan Malaysia covid 19 Malaysia cdwa karklayphnthunikalngkracayipthwodyphbinphutidechuxthungrxyla 85 ethiybkbkarklayphnthu D614G thiphbetmrxyinmaelesiy 215 216 217 odytwxyangehlanikidcakkhlsetxrinrthsabah echnkn 217 216 sahrbkarklayphnthuni mikaraethnkrdxamionxalanindwywalinthiyinoprtinhnamtaaehnng 701 miraynganwaphbthwolkrwmthngaexfrikait xxsetreliy enethxraelnd aelaxngkvsinchwngewlaediywknkbmaelesiy 215 inthankhxmulciesd khwamchukkhxngkarklayphnthunixyuthirxyla 0 18 215 inwnthi 24 emsayn 2021 xngkhkrsatharnsukhkhxngmaelesiy Kementerian Kesihatan Malaysia raynganwa karrabadralxkthi 3 sungerimthirthsabahidkxsayphnthutang thimikarklayphnthu D614G aela A701V 218 kartrwcaelapraeminsayphnthuihm aekikhinwnthi 26 mkrakhm 2021 rthbalshrachxanackrrabuwa caaechrsmrrthphaphkarthxdladbcionmkbpraethsxun ephuxephimxtrakarthxdladbaelwtidtamsayphnthuihm odyeriykaephltfxrmniwa New Variant Assessment Platform 219 cnthungeduxnmkrakhm 2021 karthxdladbyinkhxngechuxokhwid 19 ekuxbkhrungthwolkidthainshrachxanackr 220 aehlngkaenidsayphnthutang aekikhnkwicyidesnxwa karklayphnthuhlayxyangxacekididemuxkhnikhthimiphumikhumknxxnaextidechuxxyangeruxrng odyechphaaemuxepnkarklayphnthuthihlbphumikhumknidaelaxyuitaerngkddnthangwiwthnakarenuxngkbkarrksadwyaexntibxdihruxdwyeluxdcakkhnikhthihayorkhaelw 221 222 aelamikarklayphnthuaebblbyinaexntiecn deletion xyangediywknsungekidtanghak inkhnikhtang 223 phltxprasiththiphaphwkhsin aekikhkhxmulephimetim wkhsinorkhtidechuxiwrsokhorna 2019 prasiththisky elnmiediy widioxphasaxngkvskhxngxngkhkarxnamyolk sungxthibaywasayphnthukhxngorkhekidkhunidxyangirinekhtthiprachachnimidchidwkhsin ptismphnthrahwangiwrsokhwid 19 kbmnusytxnaerkepniptamthrrmchati aetpccubnidepliynipephraakarchidwkhsin 224 oxkaskarekidsayphnthuokhwidthiduxtxaexntibxdithiwkhsinrunpccubnkratunihekid xacthaihtxngprbprungwkhsin 225 karthdlxngtang idrabuwa wkhsinthiphthnaephuxtxtansayphnthudngedim miprasiththiskytxtankartidechuxaebbaesdngxakarthildlngsahrbsayphnthubangsayphnthu 226 xlfa B 1 1 7 aekikh khxmulephimetim iwrs SARS CoV 2 sayphnthuaexlfa aela sayphnthukhxng SARS CoV 2 xlfa ineduxnthnwakhm sayphnthuihmkhxngiwrsokhwid 19 khuxsayphnthuxlfa B 1 1 7 idphbepnkhrngaerkinshrachxanackr 227 xngkhkarxnamyolkrabuwamihlkthancakdthiaesdngwawkhsinkhxngxxksfxrd aexstraesnenka khxngifesxr ibxxnethkh aelaonwaaewksyngkhngprasiththiphl prasiththiphaphtxtansayphnthuxlfaxyu swnwkhsinxun yngimmikhxmul ineruxngkarkhngradbaexntibxdilblangvththisungpxngknkartidechuxaebbimaesdngxakaraelasakhyinkaryutiehtukarnrabadthw wkhsinthiichmakthisudrwmthngsputnikwi wkhsinkhxngifesxr ibxxnethkh khxngomedxrna khxngsionaewkh khxngsionfarm aelaokhaewksin kpraktwakhngradbaexntibxdisahrbsayxlfadwy sahrbwkhsinkhxngxxksfxrd aexstraesnenka radbaexntibxdildlngelknxycnthungpanklang swnwkhsinxun yngimmikhxmul 228 phlebuxngtnaesdngwa wkhsinkhxngifesxr ibxxnethkhaelaomedxrnasamarthpxngknsayphnthuni 229 230 ngansuksahnungrabuwa wkhsinkhxngxxksfxrd aexstraesnenkamiprasiththiskyrahwangrxyla 42 89 txtansayphnthuni ethiybkbrxyla 71 91 sahrbsayphnthuxun 231 phlebuxngtncakkarthdlxngthangkhlinikrabuwa wkhsinonwaaewksmiprasiththiphaphpramanrxyla 96 sahrbkartidechuxthiaesdngxakarsahrbsayphnthudngedim aelapramanrxyla 86 sahrbsayphnthuxlfa 232 ebta B 1 351 aekikh khxmulephimetim sayphnthukhxng SARS CoV 2 ebta xngkhkarxnamyolkrabuwa mihlkthancakdcakngansuksaebuxngtnhlaynganthiaesdngwawkhsintang miprasiththisky prasiththiphaphtxtansayphnthuebtaldlnginradbtang rwmthngwkhsinkhxngxxksfxrd aexstraesnenka xaccamak onwaaewks panklang wkhsinkhxngbristhifesxr ibxxnethkhaelacxhnsnaexndcxhnsn nxy odyyngimmikhxmulsahrbwkhsinxun ineruxngkarkhngradbaexntibxdilblangvththisungpxngknkartidechuxaebbimaesdngxakaraelasakhyinkaryutiehtukarnrabadthw wkhsinthiichmakthisudrwmthngwkhsinkhxngxxksfxrd aexstraesnenka sputnikwi cxhnsnaexndcxhnsn ifesxr ibxxnethkh omedxrna aelaonwaaewkslwnmiaexntibxdildlnginradbnxycnthungmak ykewnsionaewkhaelasionfarmthimiaexntibxdildlngnxy odywkhsinxun yngimmikhxmul 228 omedxrnaiderimthakarthdlxngwkhsinrunihmephuxcdkarsayphnthuebta B 1 351 aelw 233 inwnthi 17 kumphaphnth 2021 bristhifesxrprakaswa sahrbsayphnthuni xanuphaphthalayvththiiwrskhxngaexntibxdithienuxngkbwkhsinldlngthung 2 3 odyrabudwywayngimsamarthkahndprasiththiskykhxngwkhsininkarpxngknkartidechuxaebbaesdngxakar 234 ngansuksahlayngantxmaidtrwcnaehluxngkhxngkhnikhthiidchidwkhsinkhxngomedxrnaaelakhxngifesxr ibxxnethkhaelwyunynwa xanuphaphthalayvththiiwrskhxngaexntibxdithienuxngkbwkhsinldlngcring 230 235 aetinwnthi 1 emsayn 2021 rayngancakkarthdlxngwkhsinkhxngifesxr ibxxnethkh inaexfrikaitklbraynganwa wkhsinmiprasiththiphaphetmrxycnthungtxnnn khux xasasmkhrthichidwkhsinimmiikhrtidorkhely ethiybkbklumyahlxkthixasasmkhr 6 khntidechuxchnidebta 236 ineduxnmkrakhm 2021 bristhcxhnsnaexndcxhnsnsungkalngthdsxbwkhsinokhwid 19 inaexfrikait raynganwaprasiththiskykarpxngknkartidechuxaebbmixakarpanklangcnthunghnkxyuthirxyla 72 inshrthaelarxyla 57 inaexfrikait 237 inwnthi 6 kumphaphnth hnngsuxphimphxngkvs Financial Times idrayngankhxmulebuxngtncakngansuksainaexfrikaitrwmkbmhawithyalyxxksfxrdthiaesdngwa wkhsinkhxngxxksfxrd aexstraesnenkamiprasiththiskyldlngsahrbsayphnthuni 238 odyphbwa inbrrdaphuidrbwkhsin 2 000 khn wkhsinsamarthpxngknorkhidephiyngelknxyykewnaetkhnthimixakarhnksud 239 txmainwnthi 7 kumphaphnth 2021 krathrwngsatharnsukhaexfrikaitcungrangbaephnkarchidwkhsinni 1 lanods ihaekprachachn 239 240 ineduxnminakhm 2021 miraynganwa prasiththiskyebuxngtnthiphb khxngonwaaewks NVX CoV2373 sahrbkartidechuxchnidebtathimixakarxxn panklang aelarunaerng 241 sahrbxasasmkhrthitrwcimphbexchixwixyuthirxyla 51 aekmma P 1 aekikh khxmulephimetim sayphnthukhxng SARS CoV 2 aekmma xngkhkarxnamyolkrabuwamihlkthancakdthiaesdngwawkhsinkhxngsionaewkhaelakhxngsionfarm yngkhngprasiththiphl prasiththiphaphtxtansayphnthuaekmmaxyu swnwkhsinxun yngimmikhxmul ineruxngkarkhngradbaexntibxdilblangvththisungpxngknkartidechuxaebbimaesdngxakaraelasakhyinkaryutiehtukarnrabadthw wkhsinkhxngxxksfxrd aexstraesnenkaaelakhxngsionaewkhimldhruxaethbimldprasiththiphaphtxtansayphnthuaekmmaely wkhsinkhxngifesxr ibxxnethkhaelakhxngomedxrnaldlngbangelknxycnthungpanklang swnwkhsinxun yngimmikhxmul 228 dngnn sayphnthuaekmma P 1 20J 501Y V3 sungerimtnphbthibrasil duehmuxncahlbphumikhumknenuxngkbwkhsinkhxngifesxr ibxxnethkhidbang 235 edlta B 1 617 2 aekikh khxmulephimetim iwrs SARS CoV 2 sayphnthuedlta aela sayphnthukhxng SARS CoV 2 edlta sayphnthuedlta hrux B 1 617 2 hrux G 452R V3 hrux 21A 242 hrux 21A S 478K 243 idphbkhrngaerkinxinediyemuxeduxntulakhm 2020 aethlngcaknnkidkracayipyngpraethsxun aelw epnsayphnthulukhlankhxng B 1 617 echnediywkbsayphnthuaekhppathikalngtrwcsxb 244 245 246 247 248 inwnthi 6 phvsphakhm 2021 nkwithyasastrxngkvsidprakassayphnthuni sungmicudednkhux immikarklayphnthu E484Q waepnsayphnthuthinaepnhwngodykahndrhsepn VOC 21APR 02 hlngcakthiphbhlkthanwamnkracayipiderwkwaiwrsdngedimaelaxackracayiderwethasayphnthuxlfa 249 250 251 mnmikarklayphnthu L452R T478K aela P681R 252 aetkimehmuxnkbsayphnthuaekhppaephraaimmikarklayphnthu E484Qxngkhkarxnamyolkrabuwa mihlkthancakdcakngansuksaebuxngtntang thiaesdngwawkhsinkhxngxxksfxrd aexstraesnenkaaelakhxngifesxr ibxxnethkhyngkhngprasiththiphl prasiththiphaphtxsayphnthuni swnwkhsinxun yngimmikhxmul ineruxngkarkhngradbaexntibxdilblangvththisungpxngknkartidechuxaebbimaesdngxakaraelasakhyinkaryutiehtukarnrabadthw wkhsinkhxngxxksfxrd aexstraesnenka miprasiththiphaphldlngxyangmak aelawkhsinkhxngifesxr ibxxnethkhaelaokhaewksinmiprasiththiphaphldlngnxycnthungpanklang swnwkhsinxun yngimmikhxmul 228 echingxrrth aekikh 1 0 1 1 1 2 Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages PANGO lineage Public Health England PHE variant rupaebbkartngchuxidxpedtemuxeduxnminakhm 2021 odyepliynpicakelkh 4 hlkehlux 2 hlk aelaepliyneduxncakelkh 2 hlkepnxksryx 3 tw twxyangechn dngedimepn VOC 202101 02 ihepliynepn VOC 21JAN 02 13 3 0 3 1 3 2 Nextstrain clade 4 0 4 1 thaimidrabuiwodyechphaa nipktihmaythungphumiinnaehluxngkhux neutralizing antibody sungmishsmphnthkbphumikhumknorkh ngansuksaodymakyngimidrabuphlcring khxngphumithildlngtxkhaprasiththiskykhxngwkhsin Monoclonal antibody efficacy 6 0 6 1 1 mikh 24 thkh 2020 praethsxngkvs 25 7 0 7 1 7 2 7 3 23 phy 2020 31 mkh 2021 praethsxngkvs 26 1 skh 31 thkh 2020 shrachxanackr 28 swnngansuksaxiknganhnungphbkhathi 50 20 113 inaexfrikaitrahwangeduxn phkh phy 2020 29 ykewnwkhsinkhxngomedxrnaaelacxhnsn 14 30 10 0 10 1 chwngkhwamechuxmnthiraynganmikhwamnacaepnta dngnn khapramancungcdwaaekhepnipid aetkyngimaennxnhruxwa nacaich 1 phy 2020 31 mkh 2021 maenas 33 ngansuksaxiknganhnunginmaenaspraeminwasayphnthu P 1 xactidtxidngaykwa 100 50 CrI 70 140 J 34 12 0 12 1 khwamaetktangxacmacaknoybayaelakarrksathiaetktangkninaetlaphunthiinewlathitang kn macaksmrrthphaphkhxngrabbsatharnsukh aelasayphnthutang thikalngkracayxyuinphunthi mikh 2020 kph 2021 maenas 34 phlebuxngtncakngansuksahnunginekhtthisitkhxngbrasilphbwa sayphnthu P 1 thaihkhnxayunxyaelamisukhphaphdithungtayyingkwa inklumthiirorkhpracatw sayphnthuniphbwathaihchayxayu 20 39 pi thungtayyingkwa 490 220 985 hyingxayu 20 39 pi thungtayyingkwa 465 190 1003 aelahyingxayu 40 59 pi thungtayyingkwa 670 401 1083 35 L ykewnwkhsinkhxngifesxr ibxxnethkh 14 15 0 15 1 15 2 15 3 smmutiwaethakbxlfa 15 ky 2020 mkh 2021 aekhlifxreniy 12 41 thukxlfaaesngipaelw 42 17 0 17 1 1 ky 2020 29 mkh aekhlifxreniy 43 3 mikh 17 phkh 2021 praethsxngkvs 46 phlngansuksaebuxngtnxiknganinyipunphbwa sayphnthuedltatidtxidephiyngrxyla 23 yingkwasayphnthuxlfa 47 L 1 emy 6 miy 2021 inpraethsskxtaelnd 48 wkhsin Covaxin ldlngpanklang 49 GISAID clade 22 0 22 1 inaehlngxangxingxikthihnung ciesdtngchuxekhld 7 ekhldodyimrwmekhld O aetrwmekhld GV 66 tamxngkhkarxnamydlk echuxsay lineage hruxekhld clade samarthrabuiddwykarmibrrphburusrwmkntamwiwthnakarchatiphnthu 67 cnthungeduxnmkrakhm 2021 canbwaepnekhldinrabbkhxngenkstsetrnkcatxngphaneknthtxipnixyangidxyanghnung khux 61 idekidinxtrayingkwarxyla 20 inradbolkepnraya 2 eduxnhruxyingkwa idekidinxtrayingkwarxyla 30 inradbphumiphakhepnraya 2 eduxnhruxyingkwa idcdepnsayphnthuthinaepnhwng VOC odycnthungwnthi 6 mkrakhm nirwmsayphnthu 501Y V1 aela 501Y V2 Antigenicity epnsmrrthphaphkhxngokhrngsrangthangekhmi imwacaepnaexntiecn hrux hapten inkarekhacbodyechphaa kbphlitphnthinrangkaythimiphumikhumknaebbcaephaarwmthng T cell receptor hrux antibody hruxthieriykwa B cell receptor xangxing aekikh 1 0 1 1 1 2 1 3 1 4 Shahhosseini Nariman Babuadze George Wong Gary Kobinger Gary 2021 Mutation Signatures and In Silico Docking of Novel SARS CoV 2 Variants of Concern Microorganisms 9 5 926 doi 10 3390 microorganisms9050926 PMID 33925854 S2CID 233460887 subkhnemux 2021 05 04 Coronavirus variants and mutations The science explained BBC News phasaxngkvs 2021 01 06 subkhnemux 2021 02 02 Kupferschmidt K 2021 01 15 New coronavirus variants could cause more reinfections require updated vaccines Science American Association for the Advancement of Science doi 10 1126 science abg6028 subkhnemux 2021 02 02 Shahhosseini Nariman Wong Gary Kobinger Gary Chinikar Sadegh 2021 SARS CoV 2 spillover transmission due to recombination event Gene Reports 23 101045 doi 10 1016 j genrep 2021 101045 PMC 7884226 PMID 33615041 5 0 5 1 5 2 Kumar Sudhir Tao Qiqing Weaver Steven Sanderford Maxwell Caraballo Ortiz Marcos A Sharma Sudip Pond Sergei L K Miura Sayaka An evolutionary portrait of the progenitor SARS CoV 2 and its dominant offshoots in COVID 19 pandemic Oxford Academic subkhnemux 2020 05 10 The ancestor of SARS CoV 2 s Wuhan strain was circulating in late October 2019 News Medical subkhnemux 2020 05 10 Journal reference Kumar S et al 2021 An evolutionary portrait 7 0 7 1 Lineage descriptions cov lineages org Pango team Yurkovetskiy Leonid Wang Xue Pascal Kristen E Tomkins Tinch Christopher Nyalile Thomas P Wang Yetao aelakhna October 2020 Structural and Functional Analysis of the D614G SARS CoV 2 Spike Protein Variant Cell 183 3 739 751 e8 doi 10 1016 j cell 2020 09 032 PMC 7492024 PMID 32991842 Thomson Emma C Rosen Laura E Shepherd James G Spreafico Roberto da Silva Filipe Ana Wojcechowskyj Jason A aelakhna March 2021 Circulating SARS CoV 2 spike N439K variants maintain fitness while evading antibody mediated immunity Cell 184 5 1171 1187 e20 doi 10 1016 j cell 2021 01 037 PMC 7843029 PMID 33621484 Covid Is there a limit to how much worse variants can get BBC 2021 06 12 11 0 11 1 11 2 11 3 Tracking SARS CoV 2 variants who int phasaxngkvs World Health Organization ekb cakaehlngedimemux 2021 06 18 12 00 12 01 12 02 12 03 12 04 12 05 12 06 12 07 12 08 12 09 12 10 12 11 12 12 12 13 SARS CoV 2 Variant Classifications and Definitions CDC gov Centers for Disease Control and Prevention 2020 02 11 13 00 13 01 13 02 13 03 13 04 13 05 13 06 13 07 13 08 13 09 13 10 13 11 13 12 13 13 13 14 13 15 Variants distribution of cases data GOV UK Government Digital Service Public Health England 14 0 14 1 14 2 14 3 14 4 14 5 14 6 Living Evidence SARS CoV 2 variants Agency for Clinical Innovation nsw gov au Ministry of Health New South Wales 2021 06 22 15 0 15 1 SARS CoV 2 variants of concern ECDC eu European Centre for Disease Prevention and Control Coronavirus Disease COVID 19 Situation Reports who int World Health Organization Investigation of SARS CoV 2 variants of concern technical briefings GOV UK Government Digital Service Public Health England Investigation of SARS CoV 2 variants of concern variant risk assessments GOV UK Government Digital Service Public Health England SARS CoV 2 variants risk assessment framework PDF GOV UK Government Digital Service Public Health England 2021 05 22 GOV 8426 20 0 20 1 20 2 20 3 20 4 20 5 20 6 Weekly epidemiological update on COVID 19 15 June 2021 Situation report World Health Organization 2021 06 15 subkhnemux 2021 06 16 Rambaut A Loman N Pybus O Barclay W Barrett J Carabelli A aelakhna 2020 12 18 Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS CoV 2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations Virological subkhnemux 2021 06 14 Investigation of novel SARS COV 2 variant technical briefing 1 PDF Briefing Public Health England 2020 12 21 subkhnemux 2021 06 06 23 0 23 1 23 2 23 3 23 4 Emerging SARS CoV 2 Variants CDC gov Science brief Centers for Disease Control and Prevention 2021 01 28 subkhnemux 2021 01 04 bthkhwamnirwmexaenuxkhwamcakaehlngxangxingni sungepnsatharnsmbti 24 0 24 1 24 2 Chand et al 2020 p 6 Potential impact of spike variant N501Y Davies NG Abbott S Barnard RC Jarvis CI Kucharski AJ Munday JD aelakhna 2021 Estimated transmissibility and impact of SARS CoV 2 lineage B 1 1 7 in England Science 372 6538 eabg3055 doi 10 1126 science abg3055 PMC 8128288 PMID 33658326 CS1 maint multiple names authors list link Nyberg T Twohig KA Harris RJ Seaman SR Flannagan J Allen H aelakhna 2021 06 15 Risk of hospital admission for patients with SARS CoV 2 variant B 1 1 7 cohort analysis BMJ 373 n1412 doi 10 1136 bmj n1412 ISSN 1756 1833 PMID 34130987 S2CID 235187479 Horby Peter Barclay Wendy Huntley Catherine 2021 01 13 NERVTAG paper brief note on SARS CoV 2 variants Note Public Health England subkhnemux 2021 06 06 Zhao S Lou J Cao L Zheng H Chong MK Chen Z aelakhna 2021 01 28 Quantifying the transmission advantage associated with N501Y substitution of SARS CoV 2 in the UK an early data driven analysis Journal of Travel Medicine 28 2 doi 10 1093 jtm taab011 ISSN 1195 1982 PMC 7928809 PMID 33506254 Risk related to the spread of new SARS CoV 2 variants of concern in the EU EEA first update Risk assessment European Centre for Disease Prevention and Control 2021 02 02 30 0 30 1 30 2 30 3 30 4 30 5 30 6 30 7 30 8 30 9 Weekly epidemiological update on COVID 19 8 June 2021 Situation report World Health Organization 2021 06 08 subkhnemux 2021 06 14 Confirmed cases of COVID 19 variants identified in UK Friday 15 January GOV UK Public Health England 2021 01 15 CS1 maint location link Horby Peter Barclay Wendy Gupta Ravi Huntley Catherine 2021 01 27 NERVTAG paper note on variant P 1 Note Public Health England subkhnemux 2021 06 06 Coutinho RM Marquitti FM Ferreira LS Borges ME da Silva RL Canton O aelakhna 2021 03 23 Model based estimation of transmissibility and reinfection of SARS CoV 2 P 1 variant medRxiv Preprint 9 doi 10 1101 2021 03 03 21252706 S2CID 232119656 subkhnemux 2021 04 29 The new variant was found to be about 2 6 times more transmissible 95 Confidence Interval CI 2 4 2 8 than previous circulating variant s Table 1 Summary of the fitted parameters and respective confidence intervals considering the entire period November 1 2020 January 31 2021 maintaining the same pathogenicity of the previous variant Parameter Relative transmission rate for the new variant Estimate 2 61 2 5 2 45 97 5 2 76 34 0 34 1 34 2 Faria NR Mellan TA Whittaker C Claro IM Candido DS Mishra S aelakhna 2021 05 21 Genomics and epidemiology of the P 1 SARS CoV 2 lineage in Manaus Brazil Science 372 6544 815 821 doi 10 1126 science abh2644 ISSN 0036 8075 PMID 33853970 Within this plausible region of parameter space P 1 can be between 1 7 and 2 4 times more transmissible 50 BCI 2 0 median with a 99 posterior probability of being gt 1 than local non P1 lineages and can evade 21 to 46 50 BCI 32 median with a 95 posterior probability of being able to evade at least 10 of protective immunity elicited by previous infection with non P 1 lineages corresponding to 54 to 79 50 BCI 68 median cross immunity We estimate that infections are 1 2 to 1 9 times more likely 50 BCI median 1 5 90 posterior probability of being gt 1 to result in mortality in the period after the emergence of P 1 compared with before although posterior estimates of this relative risk are also correlated with inferred cross immunity More broadly the recent epidemic in Manaus has strained the city s health care system leading to inadequate access to medical care We therefore cannot determine whether the estimated increase in relative mortality risk is due to P 1 infection stresses on the Manaus health care system or both Detailed clinical investigations of P 1 infections are needed Freitas AR Lemos DR Beckedorff OA Cavalcanti LP Siqueira AM Mello RC aelakhna 2021 04 19 The increase in the risk of severity and fatality rate of covid 19 in southern Brazil after the emergence of the Variant of Concern VOC SARS CoV 2 P 1 was greater among young adults without pre existing risk conditions Preprint doi 10 1101 2021 04 13 21255281 odythang medRxiv Female 20 to 39 years old with no pre existing risk conditions were at risk of death 5 65 times higher in February 95 CI 2 9 11 03 p lt 0 0001 and in the age group of 40 and 59 years old this risk was 7 7 times higher 95 CI 5 01 11 83 p lt 0 0001 comparing with November December The heterogeneity observed between the age groups was greater when we analyzed the subgroup of the population without preexisting risk conditions where we found that the CFR in the female sex in the second wave was 1 95 times 95 CI 1 38 2 76 the CFR of the first wave in the population over 85 years old and was 7 7 times 95 CI 5 01 11 83 p lt 0 0001 in the population between 40 and 59 years old In the male population without previous diseases the CFR in the second wave was 2 18 95 CI 1 62 2 93 times the CFR of the first wave in the population over 85 years old and 5 9 95 CI 3 2 10 85 p lt 0 0001 higher in the range between 20 and 39 years old Cite journal requires journal help Public Health England 2021 02 16 Variants distribution of cases data GOV UK subkhnemux 2021 02 17 Investigation of novel SARS CoV 2 variant 202012 01 technical briefing 5 PDF Briefing Public Health England 2021 02 02 GW 1905 subkhnemux 2021 06 14 Investigation of SARS CoV 2 variants of concern in England technical briefing 6 PDF Briefing Public Health England 2021 02 13 GW 1934 subkhnemux 2021 06 06 39 0 39 1 39 2 39 3 Collier DA De Marco A Gupta RK al et 2021 05 06 Sensitivity of SARS CoV 2 B 1 1 7 to mRNA vaccine elicited antibodies Nature Published 593 7857 136 141 doi 10 1038 s41586 021 03412 7 PMID 33706364 We therefore generated pseudoviruses that carried the B 1 1 7 spike mutations with or without the additional E484K substitution and tested these against sera obtained after the first and second dose of the BNT162b2 mRNA vaccine as well as against convalescent sera After the second vaccine dose we observed a considerable loss of neutralizing activity for the pseudovirus with the B 1 1 7 spike mutations and E484K Fig 3d e The mean fold change for the E484K containing B 1 1 7 spike variant was 6 7 compared with 1 9 for the B 1 1 7 variant relative to the wild type spike protein Fig 3a c and Extended Data Fig 5 Similarly when we tested a panel of convalescent sera with a range of neutralization titres Fig 1f g and Extended Data Fig 5 we observed additional loss of activity against the mutant B 1 1 7 spike with E484K with fold change of 11 4 relative to the wild type spike protein Fig 3f g and Extended Data Fig 5 Azad Arman 2021 03 17 Coronavirus strains first detected in California are officially variants of concern CDC says CNN subkhnemux 2021 06 06 Deng X Garcia Knight MA Khalid MM Servellita V Wang C Morris MK aelakhna 2021 03 09 Transmission infectivity and antibody neutralization of an emerging SARS CoV 2 variant in California carrying a L452R spike protein mutation Preprint doi 10 1101 2021 03 07 21252647 PMC 7987058 PMID 33758899 odythang medRxiv Cite journal requires journal help 42 0 42 1 42 2 Zimmer Carl Mandavilli Apoorva 2021 05 14 How the United States Beat the Variants for Now New York Times subkhnemux 2021 05 17 Wadman M 2021 02 23 California coronavirus strain may be more infectious and lethal Science News doi 10 1126 science abh2101 subkhnemux 2021 03 17 SARS CoV 2 variants of concern and variants under investigation in England technical briefing 10 PDF Briefing Public Health England 2021 05 07 GOV 8226 subkhnemux 2021 06 06 45 0 45 1 45 2 SARS CoV 2 Variant Classifications and Definitions CDC gov Centers for Disease Control and Prevention 2021 05 12 subkhnemux 2021 05 16 46 0 46 1 46 2 SARS CoV 2 variants of concern and variants under investigation in England technical briefing 15 PDF Briefing Public Health England 2021 06 11 GOV 8576 subkhnemux 2021 06 15 Ito K Piantham C Nishiura H 2021 06 15 Predicted domination of variant Delta of SARS CoV 2 before Tokyo Olympic games Japan medRxiv Preprint doi 10 1101 2021 06 12 21258835 S2CID 235437370 Sheikh A McMenamin J Taylor B Robertson C 2021 06 14 SARS CoV 2 Delta VOC in Scotland demographics risk of hospital admission and vaccine effectiveness The Lancet doi 10 1016 S0140 6736 21 01358 1 ISSN 0140 6736 PMID 34139198 49 0 49 1 49 2 49 3 Yadav PD Sapkal GN Abraham P Ella R Deshpande G Patil DY aelakhna 2021 05 07 Neutralization of variant under investigation B 1 617 with sera of BBV152 vaccinees Clinical Infectious Diseases Oxford University Press ciab411 bioRxiv 10 1101 2021 04 23 441101 doi 10 1093 cid ciab411 PMID 33961693 50 0 50 1 Planas D Veyer D Baidaliuk A Staropoli I Guivel Benhassine F Rajah MM aelakhna 2021 05 27 Reduced sensitivity of infectious SARS CoV 2 variant B 1 617 2 to monoclonal antibodies and sera from convalescent and vaccinated individuals bioRxiv 10 1101 2021 05 26 445838 Risk assessment for SARS CoV 2 variant Delta PDF Assessment Public Health England 2021 06 18 GOV 8664 subkhnemux 2021 06 22 Nuki Paul Newey Sarah 2021 04 16 Arrival of India s double mutation adds to variant woes but threat posed remains unclear The Telegraph phasaxngkvs ISSN 0307 1235 subkhnemux 2021 04 17 B 1 525 international lineage report cov lineages org Pango team subkhnemux 2021 06 04 Date mismatch between international report and lineage description cov lineages pangolin GitHub Software issue 2021 06 13 subkhnemux 2021 06 14 55 0 55 1 55 2 B 1 525 cov lineages org Pango team subkhnemux 2021 03 22 B 1 525 cov lineages org Pango team subkhnemux 2021 03 22 tarangniepnkarprbichngankhxng Alm et al figure 1 58 0 58 1 Rambaut A Holmes EC A O Toole Hill V McCrone JT Ruis C aelakhna November 2020 A dynamic nomenclature proposal for SARS CoV 2 lineages to assist genomic epidemiology Nature Microbiology 5 11 1403 1407 doi 10 1038 s41564 020 0770 5 PMC 7610519 PMID 32669681 S2CID 220544096 Cited in Alm et al 59 0 59 1 Alm E Broberg EK Connor T Hodcroft EB Komissarov AB Maurer Stroh S aelakhna August 2020 Geographical and temporal distribution of SARS CoV 2 clades in the WHO European Region January to June 2020 Euro Surveillance 25 32 doi 10 2807 1560 7917 ES 2020 25 32 2001410 PMC 7427299 PMID 32794443 60 0 60 1 Nextclade What are the clades clades nextstrain org ekb cakaehlngedimemux 2021 01 19 subkhnemux 2021 01 19 61 0 61 1 61 2 61 3 Bedford T Hodcroft B Neher RA 2021 01 06 Updated Nextstrain SARS CoV 2 clade naming strategy nextstrain org blog subkhnemux 2021 01 19 62 0 62 1 62 2 62 3 62 4 62 5 62 6 Zhukova A Blassel L Lemoine F Morel M Voznica J Gascuel O November 2020 Origin evolution and global spread of SARS CoV 2 Comptes Rendus Biologies 1 20 doi 10 5802 crbiol 29 PMID 33274614 63 0 63 1 63 2 Zhang W Davis B Chen SS Martinez JS Plummer JT Vail E 2021 Emergence of a novel SARS CoV 2 strain in Southern California USA MedRxiv doi 10 1101 2021 01 18 21249786 S2CID 231646931 PANGO lineages Lineage B 1 1 28 cov lineages org subkhnemux 2021 02 04 imxyuinaehlngxangxing Variant 20J 501Y V3 covariants org 2021 04 01 subkhnemux 2021 04 06 clade tree from Clade and lineage nomenclature www gisaid org 2020 07 04 subkhnemux 2021 01 07 67 0 67 1 67 2 67 3 3 6 Considerations for virus naming and nomenclature SARS CoV 2 genomic sequencing for public health goals Interim guidance 8 January 2021 World Health Organization 2021 01 08 p 6 subkhnemux 2021 02 02 Don t call it the British variant Use the correct name B 1 1 7 STAT phasaxngkvs 2021 02 09 subkhnemux 2021 02 12 Flanagan R 2021 02 02 Why the WHO won t call it the U K variant and you shouldn t either Coronavirus phasaxngkvs subkhnemux 2021 02 12 The name game for coronavirus variants just got a little easier stat 2021 05 31 emergency committee regarding the coronavirus disease covid 19 pandemic Statement on the sixth meeting of the International Health Regulations 2005 Emergency Committee regarding the coronavirus disease COVID 19 pandemic Check url value help World Health Organization 2021 01 15 subkhnemux 2021 01 18 Koyama T Platt D Parida L July 2020 Variant analysis of SARS CoV 2 genomes Bulletin of the World Health Organization 98 7 495 504 doi 10 2471 BLT 20 253591 PMC 7375210 PMID 32742035 We detected in total 65776 variants with 5775 distinct variants Global phylogeny updated by Nextstrain GISAID 2021 01 18 subkhnemux 2021 01 19 Hadfield J Megill C Bell SM Huddleston J Potter B Callender C aelakhna December 2018 Kelso J b k Nextstrain real time tracking of pathogen evolution Bioinformatics 34 23 4121 4123 doi 10 1093 bioinformatics bty407 PMC 6247931 PMID 29790939 cov lineages pangolin Software package for assigning SARS CoV 2 genome sequences to global lineages Github subkhnemux 2021 01 02 Rambaut A Holmes EC A O Toole Hill V McCrone JT Ruis C aelakhna March 2021 Addendum A dynamic nomenclature proposal for SARS CoV 2 lineages to assist genomic epidemiology Nature Microbiology 6 3 415 doi 10 1038 s41564 021 00872 5 PMC 7845574 PMID 33514928 Wu Fan Zhao Su Yu Bin Chen Yan Mei Wang Wen Song Zhi Gang Hu Yi Tao Zhao Wu Tian Jun Hua Pei Yuan Yuan Yuan Ming Li Zhang Yu Ling Dai Fa Hui Liu Yi Wang Qi Min Zheng Jiao Jiao Xu Lin Holmes Edward C Zhang Yong Zhen 2020 A new coronavirus associated with human respiratory disease in China Nature 579 7798 265 269 doi 10 1038 s41586 020 2008 3 ISSN 0028 0836 Chiara M Horner DS Gissi C Pesole G May 2021 Comparative Genomics Reveals Early Emergence and Biased Spatiotemporal Distribution of SARS CoV 2 Mol Biol Evol 38 6 2547 2565 doi 10 1093 molbev msab049 PMC 7928790 PMID 33605421 Zhou Peng Yang Xing Lou Wang Xian Guang Hu Ben Zhang Lei Zhang Wei Si Hao Rui Zhu Yan Li Bei Huang Chao Lin Chen Hui Dong Chen Jing Luo Yun Guo Hua Jiang Ren Di Liu Mei Qin Chen Ying Shen Xu Rui Wang Xi Zheng Xiao Shuang Zhao Kai Chen Quan Jiao Deng Fei Liu Lin Lin Yan Bing Zhan Fa Xian Wang Yan Yi Xiao Geng Fu Shi Zheng Li 2020 A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin Nature 579 7798 270 273 doi 10 1038 s41586 020 2012 7 ISSN 0028 0836 Okada Pilailuk Buathong Rome Phuygun Siripaporn Thanadachakul Thanutsapa Parnmen Sittiporn Wongboot Warawan Waicharoen Sunthareeya Wacharapluesadee Supaporn Uttayamakul Sumonmal Vachiraphan Apichart Chittaganpitch Malinee Mekha Nanthawan Janejai Noppavan Iamsirithaworn Sopon Lee Raphael TC Maurer Stroh Sebastian 2020 Early transmission patterns of coronavirus disease 2019 COVID 19 in travellers from Wuhan to Thailand January 2020 Eurosurveillance 25 8 doi 10 2807 1560 7917 ES 2020 25 8 2000097 ISSN 1560 7917 Official hCoV 19 Reference Sequence GISAID subkhnemux 2021 05 14 82 0 82 1 82 2 82 3 Emerging SARS CoV 2 Variants cdc org Science brief Centers for Disease Control and Prevention 2021 01 28 subkhnemux 2021 01 04 bthkhwamnirwmexaenuxkhwamcakaehlngxangxingni sungepnsatharnsmbti COVID Mega variant and eight criteria for a template to assess all variants Science Speaks Global ID News phasaxngkvs 2021 02 02 subkhnemux 2021 02 20 Griffiths E Tanner J Knox N Hsiao W Van Domselaar G 2021 01 15 CanCOGeN Interim Recommendations for Naming Identifying and Reporting SARS CoV 2 Variants of Concern PDF CanCOGeN nccid ca subkhnemux 2021 02 25 Chand M Hopkins S Dabrera G Achison C Barclay W Ferguson N et al 2020 12 21 Investigation of novel SARS COV 2 variant Variant of Concern 202012 01 rayngan Public Health England https assets publishing service gov uk government uploads system uploads attachment data file 947048 Technical Briefing VOC SH NJL2 SH2 pdf eriykkhxmulemux 2020 12 23 Covid Ireland Italy Belgium and Netherlands ban flights from UK BBC News 2020 12 20 PHE investigating a novel strain of COVID 19 Public Health England PHE 2020 12 14 Rambaut A Loman N Pybus O Barclay W Barrett J Carabelli A et al 2020 Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS CoV 2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations rayngan Written on behalf of COVID 19 Genomics Consortium UK https virological org t 563 eriykkhxmulemux 2020 12 20 Kupferschmidt K 2020 12 20 Mutant coronavirus in the United Kingdom sets off alarms but its importance remains unclear Science Mag phasaxngkvs subkhnemux 2020 12 21 New evidence on VUI 202012 01 and review of the public health risk assessment khub net 2020 12 15 COG UK Showcase Event subkhnemux 2020 12 25 odythang YouTube New evidence on VUI 202012 01 and review of the public health risk assessment subkhnemux 2021 01 04 Estimated transmissibility and severity of novel SARS CoV 2 Variant of Concern 202012 01 in England CMMID Repository 2020 12 23 subkhnemux 2021 01 24 odythang GitHub Cited in Risk related to the spread of new SARS CoV 2 variants of concern in the EU EEA first update PDF Stockholm European Centre for Disease Prevention and Control ECDC 2021 01 21 p 9 subkhnemux 2021 01 24 Gallagher J 2021 01 22 Coronavirus UK variant may be more deadly BBC News subkhnemux 2021 01 22 Horby Peter Huntley Catherine Davies Nick Edmunds John Ferguson Neil Medley Graham Hayward Andrew Cevik Muge Semple Calum 2021 02 11 NERVTAG paper on COVID 19 variant of concern B 1 1 7 NERVTAG update note on B 1 1 7 severity 2021 02 11 PDF www gov uk CS1 maint uses authors parameter link Genomic characteristics and clinical effect of the emergent SARS CoV 2 B 1 1 7 lineage in London UK a whole genome sequencing and hospital based cohort study Dan Frampton et al The Lancet Online April 12 2021 PANGO lineages Lineage B 1 1 7 cov lineages org subkhnemux 2021 05 15 Mandavilli A 2021 03 05 In Oregon Scientists Find a Virus Variant With a Worrying Mutation In a single sample geneticists discovered a version of the coronavirus first identified in Britain with a mutation originally reported in South Africa The New York Times subkhnemux 2021 03 06 Chen RE Zhang X Case JB Winkler ES Liu Y VanBlargan LA aelakhna March 2021 Resistance of SARS CoV 2 variants to neutralization by monoclonal and serum derived polyclonal antibodies Nature Medicine 27 4 717 726 doi 10 1038 s41591 021 01294 w PMC 8058618 PMID 33664494 B 1 1 7 Lineage with S E484K Report outbreak info 2021 03 05 subkhnemux 2021 03 07 Moustafa AM Bianco C Denu L Ahmed A Neide B Everett J aelakhna 2021 04 21 Comparative Analysis of Emerging B 1 1 7 E484K SARS CoV 2 isolates from Pennsylvania bioRxiv 10 1101 2021 04 21 440801 B 1 1 7 Lineage with S E484K Report outbreak info 103 0 103 1 103 2 South Africa announces a new coronavirus variant The New York Times 2020 12 18 subkhnemux 2020 12 20 104 0 104 1 Wroughton L Bearak M 2020 12 18 South Africa coronavirus Second wave fueled by new strain teen rage festivals The Washington Post subkhnemux 2020 12 20 Mkhize Z 2020 12 18 Update on Covid 19 18th December 2020 Press release South Africa COVID 19 South African Online Portal subkhnemux 2020 12 23 Our clinicians have also warned us that things have changed and that younger previously healthy people are now becoming very sick The 2nd Covid 19 wave in South Africa Transmissibility amp a 501 V2 variant 11th slide www scribd com 2020 12 19 Lowe D 2020 12 22 The New Mutations In the Pipeline American Association for the Advancement of Science subkhnemux 2020 12 23 I should note here that there s another strain in South Africa that is bringing on similar concerns This one has eight mutations in the Spike protein with three of them K417N E484K and N501Y that may have some functional role Statement of the WHO Working Group on COVID 19 Animal Models WHO COM about the UK and South African SARS CoV 2 new variants PDF World Health Organization 2020 12 22 subkhnemux 2020 12 23 Japan finds new coronavirus variant in travelers from Brazil Japan Today Japan 2021 01 11 subkhnemux 2021 01 14 110 0 110 1 110 2 110 3 110 4 110 5 Faria NR Claro IM Candido D LA Moyses Franco Andrade PS Coletti TM aelakhna 2021 01 12 Genomic characterisation of an emergent SARS CoV 2 lineage in Manaus preliminary findings CADDE Genomic Network virological org subkhnemux 2021 01 23 COG UK Report on SARS CoV 2 Spike mutations of interest in the UK PDF Covid 19 Genomics UK Consortium 2021 01 15 subkhnemux 2021 01 25 P 1 report cov lineages org subkhnemux 2021 02 08 113 0 113 1 113 2 Voloch CM da Silva Francisco R de Almeida LG Cardoso CC Brustolini OJ Gerber AL aelakhna 2020 Genomic characterization of a novel SARS CoV 2 lineage from Rio de Janeiro Brazil doi 10 1101 2020 12 23 20248598 S2CID 229379623 odythang MedRxiv Cite journal requires journal help Nascimento V Souza V 2021 02 25 COVID 19 epidemic in the Brazilian state of Amazonas was driven by long term persistence of endemic SARS CoV 2 lineages and the recent emergence of the new Variant of Concern P 1 Research Square doi 10 21203 rs 3 rs 275494 v1 subkhnemux 2021 03 02 Cite journal requires journal help Andreoni M Londono E Casado L 2021 03 03 Brazil s Covid Crisis Is a Warning to the Whole World Scientists Say Brazil is seeing a record number of deaths and the spread of a more contagious coronavirus variant that may cause reinfection The New York Times subkhnemux 2021 03 03 Zimmer C 2021 03 01 Virus Variant in Brazil Infected Many Who Had Already Recovered From Covid 19 The first detailed studies of the so called P 1 variant show how it devastated a Brazilian city Now scientists want to know what it will do elsewhere The New York Times subkhnemux 2021 03 03 Garcia Beltran W Lam E Denis K 2021 03 12 Circulating SARS CoV 2 variants escape neutralization by vaccine induced humoral immunity doi 10 1101 2021 02 14 21251704 subkhnemux 2021 04 14 odythang medrxiv Gaier R 2021 03 05 Exclusive Oxford study indicates AstraZeneca effective against Brazil variant source says Reuters Rio de Janeiro subkhnemux 2021 03 09 Exclusive Oxford study indicates AstraZeneca effective against Brazil variant source says Reuters Rio de Janeiro 2021 03 08 subkhnemux 2021 03 09 Moutinho Sofia 2021 05 04 Chinese COVID 19 vaccine maintains protection in variant plagued Brazil Simoes E Gaier R 2021 03 08 CoronaVac e Oxford sao eficazes contra variante de Manaus dizem laboratorios CoronaVac and Oxford are effective against Manaus variant say laboratories UOL Noticias phasaoprtueks Reuters Brazil subkhnemux 2021 03 09 PANGO lineages cov lineages org subkhnemux 2021 04 18 123 0 123 1 123 2 123 3 Koshy J 2021 04 08 Coronavirus Indian double mutant strain named B 1 617 The Hindu phasaxngkvs India s variant fuelled second wave coincided with spike in infected flights landing in Canada Toronto Sun 2021 04 10 subkhnemux 2021 04 10 Weekly epidemiological update on COVID 19 11 May 2021 World Health Organization 2021 05 11 subkhnemux 2021 05 12 COVID strain first detected in India found in 53 territories WHO British scientists warn over Indian coronavirus variant Reuters 2021 05 07 subkhnemux 2021 05 07 SARS CoV 2 variants of concern as of 6 May 2021 European Centre for Disease Prevention and Control phasaxngkvs subkhnemux 2021 05 12 expert reaction to VUI 21APR 02 B 1 617 2 being classified by PHE as a variant of concern Science Media Centre 2021 05 07 subkhnemux 2021 05 15 Pearson Heide Pullen Lauren Dao Christa 2021 06 11 AHS breaks down vaccination data of COVID 19 Delta variant outbreak at Calgary hospital Global News subkhnemux 2021 06 12 Schraer Rachel 2021 06 04 Nepal variant What s the mutation stopping green list trips to Portugal BBC News subkhnemux 2021 06 18 Acharya Bhargav Jamkhandikar Shilpa 2021 06 23 Explainer What is the Delta variant of coronavirus with K417N mutation Reuters subkhnemux 2021 06 23 SARS CoV 2 variants of concern and variants under investigation in England technical briefing 16 PDF Briefing Public Health England 2021 06 18 GOV 8641 subkhnemux 2021 06 23 Sharma Milan New Delta Plus variant of SARS CoV 2 identified here s what we know so far India Today phasaxngkvs subkhnemux 2021 06 16 Cutler Sally 2021 06 18 Nepal variant what we ve learned so far The Conversation subkhnemux 2021 06 18 India says new COVID variant is a concern Reuters Bengaluru 2021 06 22 subkhnemux 2021 06 23 Biswas Soutik 2021 06 23 Delta plus Scientists say too early to tell risk of Covid 19 variant BBC News subkhnemux 2021 06 23 Southern California COVID 19 Strain Rapidly Expands Global Reach Cedars Sinai Newsroom Los Angeles 2021 02 11 subkhnemux 2021 03 17 B 1 429 Lineage Report Alaa Abdel Latif Julia L Mullen Manar Alkuzweny Ginger Tsueng Marco Cano Emily Haag Jerry Zhou Mark Zeller Nate Matteson Chunlei Wu Kristian G Andersen Andrew I Su Karthik Gangavarapu Laura D Hughes and the Center for Viral Systems Biology outbreak info available at https outbreak info situation reports pango B 1 429 amp loc USA amp loc USA US CA amp selected USA US CA Accessed 28 May 2021 140 0 140 1 140 2 New California Variant May Be Driving Virus Surge There Study Suggests New York Times 2021 01 19 SARS CoV 2 Variant Classifications and Definitions Centers for Disease Control and Prevention U S Department of Health amp Human Services 2021 03 24 subkhnemux 2021 04 04 Shen X Tang H Pajon R Smith G Glenn GM Shi W aelakhna April 2021 Neutralization of SARS CoV 2 Variants B 1 429 and B 1 351 The New England Journal of Medicine doi 10 1056 NEJMc2103740 PMC 8063884 PMID 33826819 Local COVID 19 Strain Found in Over One Third of Los Angeles Patients news wise Press release California Cedars Sinai Medical Center 2021 01 19 subkhnemux 2021 03 03 B 1 429 Rambaut Group University of Edinburgh PANGO Lineages 2021 02 15 subkhnemux 2021 02 16 B 1 429 Lineage Report Scripps Research outbreak info 2021 02 15 subkhnemux 2021 02 16 PANGO lineages Lineage P 2 COV lineages subkhnemux 2021 01 28 P 2 Alias of B 1 1 28 2 Brazilian lineage Delta PCR testen The Delta PCR Test phasaDanish Statens Serum Institut 2021 02 25 subkhnemux 2021 02 27 CS1 maint unrecognized language link 148 0 148 1 GISAID hCOV19 Variants see menu option G 484K V3 B 1 525 www gisaid org subkhnemux 2021 03 04 149 0 149 1 Status for udvikling af SARS CoV 2 Variants of Concern VOC i Danmark Status of development of SARS CoV 2 Variants of Concern VOC in Denmark phasaDanish Statens Serum Institut 2021 02 27 subkhnemux 2021 02 27 CS1 maint unrecognized language link Varianten van het coronavirus SARS CoV 2 Variants of the coronavirus SARS CoV 2 phasaDutch Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu RIVM 2021 02 16 subkhnemux 2021 02 16 CS1 maint unrecognized language link A coronavirus variant with a mutation that likely helps it escape antibodies is already in at least 11 countries including the US Business Insider 2021 02 16 subkhnemux 2021 02 16 En ny variant av koronaviruset er oppdaget i Norge Hva vet vi om den A new variant of the coronavirus has been discovered in Norway What do we know about it phasaNorwegian Aftenposten 2021 02 18 subkhnemux 2021 02 18 CS1 maint unrecognized language link Cullen P 2021 02 25 Coronavirus Variant discovered in UK and Nigeria found in State for first time The Irish Times subkhnemux 2021 02 25 Gataveckaite G 2021 02 25 First Irish case of B1525 strain of Covid 19 confirmed as R number increases Irish Independent subkhnemux 2021 02 25 McGlynn M 2021 02 25 Nphet confirm new variant B1525 detected in Ireland as 35 deaths and 613 cases confirmed Irish Examiner subkhnemux 2021 02 25 Roberts M 2021 02 16 Another new coronavirus variant seen in the UK BBC News subkhnemux 2021 02 16 DOH confirms detection of 2 SARS CoV 2 mutations in Region 7 ABS CBN News phasaxngkvs 2021 02 18 subkhnemux 2021 03 13 Santos E 2021 03 13 DOH reports COVID 19 variant unique to PH first case of Brazil variant CNN Philippines subkhnemux 2021 03 17 DOH confirms new COVID 19 variant first detected in PH first case of Brazil variant ABS CBN News phasaxngkvs 2021 03 13 subkhnemux 2021 03 13 PH discovered new COVID 19 variant earlier than Japan expert clarifies CNN Philippines 2021 03 13 subkhnemux 2021 03 17 Japan detects new coronavirus variant from traveler coming from PH CNN Philippines 2021 03 13 subkhnemux 2021 03 21 UK reports 2 cases of COVID 19 variant first detected in Philippines ABS CBN 2021 03 17 subkhnemux 2021 03 21 Covid 19 Sarawak detects variant reported in the Philippines phasaxngkvs 2021 04 30 subkhnemux 2021 04 30 Mandavilli A 2021 02 24 A New Coronavirus Variant Is Spreading in New York Researchers Report The New York Times Tracking SARS CoV 2 variants www who int phasaxngkvs 2021 05 31 subkhnemux 2021 06 05 Weekly epidemiological update on COVID 19 27 April 2021 Situation report World Health Organization 2021 04 27 subkhnemux 2021 06 14 Le Page Michael 2021 06 04 Indian covid 19 variant B 1 617 New Scientist subkhnemux 2021 06 08 in en SARS CoV 2 variants of concern and variants under investigation in England Technical briefing 10 rayngan London 2021 05 07 https assets publishing service gov uk government uploads system uploads attachment data file 984274 Variants of Concern VOC Technical Briefing 10 England pdf eriykkhxmulemux 2021 06 05 A variant first detected in India was designated under investigation on 1 April 2021 as VUI 21APR 01 B 1 617 1 OGL bthkhwamni rwmenuxkhwamthitiphimphitsyya Open Government Licence v3 0 Tracking SARS CoV 2 variants World Health Organization phasaxngkvs subkhnemux 2021 06 17 168 0 168 1 Detection of SARS CoV 2 P681H Spike Protein Variant in Nigeria Virological phasaxngkvs 2020 12 23 subkhnemux 2021 01 01 Lineage B 1 1 207 cov lineages org Pango team subkhnemux 2021 03 11 Queensland travellers have hotel quarantine extended after Russian variant of coronavirus detected www abc net au phasaxngkvs 2021 03 03 subkhnemux 2021 03 03 Latest update New Variant Under Investigation designated in the UK www gov uk 2021 03 04 subkhnemux 2021 03 05 New coronavirus variant found in West Bengal thehindu What is the new triple mutant variant of Covid 19 virus found in Bengal How bad is it indiatoday 2021 04 22 PANGO lineages Lineage B 1 618 cov lineages subkhnemux 2021 04 23 175 0 175 1 175 2 COVID 19 African variant reveals sequencing lag Unidentified coronavirus strain found in eastern Lithuania lrt lt 2021 04 20 The travel related origin and spread of SARS CoV 2 B 1 620 strain 2021 05 11 Lassauniere R Fonager J Rasmussen M Frische A Strandh C Rasmussen T aelakhna 2020 11 10 SARS CoV 2 spike mutations arising in Danish mink their spread to humans and neutralization data Preprint Statens Serum Institut ekb cakaehlngedimemux 2020 11 10 subkhnemux 2020 11 11 Detection of new SARS CoV 2 variants related to mink PDF European Centre for Disease Prevention and Control 2020 11 12 subkhnemux 2020 11 12 SARS CoV 2 mink associated variant strain Denmark WHO Disease Outbreak News 2020 11 06 subkhnemux 2021 03 19 Danish Covid mink variant very likely extinct but controversial cull continues theguardian 2020 11 19 Larsen HD Fonager J Lomholt FK Dalby T Benedetti G Kristensen B aelakhna February 2021 Preliminary report of an outbreak of SARS CoV 2 in mink and mink farmers associated with community spread Denmark June to November 2020 Euro Surveillance 26 5 doi 10 2807 1560 7917 ES 2021 26 5 210009 PMC 7863232 PMID 33541485 Covid 19 and evolutionary pressure can we predict which genetic dangers lurk beyond the horizon 2021 06 14 n230 Cite journal requires journal help 184 0 184 1 184 2 184 3 184 4 Greenwood M 2021 01 15 What Mutations of SARS CoV 2 are Causing Concern News Medical Lifesciences subkhnemux 2021 01 16 Tandel Dixit Gupta Divya Sah Vishal Harshan Krishnan Harinivas 2021 04 30 N440K variant of SARS CoV 2 has Higher Infectious Fitness bioRxiv phasaxngkvs 2021 04 30 441434 doi 10 1101 2021 04 30 441434 Bhattacharjee Sumit 2021 05 03 COVID 19 A P strain at least 15 times more virulent The Hindu phasaxngkvs Hyderabad Mutant N440K 10 times more infectious than parent strain span, wikipedia, วิกิ หนังสือ, หนังสือ, ห้องสมุด,

    บทความ

    , อ่าน, ดาวน์โหลด, ฟรี, ดาวน์โหลดฟรี, mp3, วิดีโอ, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, รูปภาพ, เพลง, เพลง, หนัง, หนังสือ, เกม, เกม